RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.62□□□□□ -1.67
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1B0GV72 72 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H0YGX0 51 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H3BUT2 72 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPINK1P00995 79 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BATFQ16520 125 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MUC17Q685J3 4493 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TSTD3H0UI37 97 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP1-201ENST00000455321 F8WEM9 126 aa4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SNHG12Q9BXW3 62 aa4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FABP2P12104 132 aa4.58□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A8MUU9 505 aa4.57□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 M0R143 59 aa4.57□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OCIAD2Q56VL3 154 aa4.57□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGFL1Q6UW32 110 aa4.57□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1orf195Q5TG92 126 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MUC2Q02817 5179 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A8MWP4 228 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SNCGO76070 127 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DNAL4O96015 105 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COX6CP09669 75 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1B0GX51 115 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H3BMG7 143 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LST1O00453 97 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TCL1BO95988 128 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP10-5P60370 271 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q6JHZ5 121 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPDPFLQ8WWR9 84 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LIMD2Q9BT23 127 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.52□□□□□ -1.69
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C9orf92A6NGG3 77 aa4.52□□□□□ -1.69
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TPRXLQ17RH7 258 aa4.52□□□□□ -1.69
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRACP01848 142 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TAX1BP3O14907 124 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00313P59037 77 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1W2PNM2 257 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A6NED7 52 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H3BQ85 93 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A087WSZ3 146 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATXN8Q156A1 80 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q5XG85 94 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1W2PPM0 123 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TEN1Q86WV5 123 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VPS25Q9BRG1 176 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C9JAW5 83 aa4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCKP06307 115 aa4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q6Q795 121 aa4.44□□□□□ -1.7
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LYRM7Q5U5X0 104 aa4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q96NJ1 140 aa4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DSCR8Q96T75 97 aa4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.41□□□□□ -1.7
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SIGMAR1Q99720 223 aa4.41□□□□□ -1.7
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.41□□□□□ -1.7
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.41□□□□□ -1.7
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPCS1Q9Y6A9 102 aa4.41□□□□□ -1.7
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCOTHQ58A44 107 aa4.4□□□□□ -1.71
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q6ZQT0 140 aa4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGKV4-1P06312 121 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP1-201ENST00000455321 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.37□□□□□ -1.71
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LCE1EQ5T753 118 aa4.37□□□□□ -1.71
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00472Q9H8W2 130 aa4.37□□□□□ -1.71
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H3BT86 120 aa4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP1-201ENST00000455321 K7EP34 96 aa4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PMAIP1Q13794 54 aa4.35□□□□□ -1.71
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRO0461Q9UI25 63 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP12-2P59991 146 aa4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP1-201ENST00000455321 R4GN34 69 aa4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1B0GU33 70 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDE6GP18545 87 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NREPQ16612 68 aa4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.28□□□□□ -1.72
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.28□□□□□ -1.72
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 212.7 ms