RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445077.1

RBMS3-208, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 3, human

TSL 3

Gene RBMS3, Length 448 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS3-208	ENST00000445077		K7ERS5	55 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBMS3-208	ENST00000445077	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RBMS3-208	ENST00000445077	CENPE	Q02224	2701 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBMS3-208	ENST00000445077	USP24	Q9UPU5	2620 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBMS3-208	ENST00000445077	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBMS3-208	ENST00000445077	VPS13C	Q709C8	3753 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBMS3-208	ENST00000445077	SPINK1	P00995	79 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBMS3-208	ENST00000445077	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBMS3-208	ENST00000445077	MTOR	P42345	2549 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBMS3-208	ENST00000445077	NF1	P21359	2839 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBMS3-208	ENST00000445077	PANO1	I0J062	215 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBMS3-208	ENST00000445077	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBMS3-208	ENST00000445077	ACAN	P16112	2415 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBMS3-208	ENST00000445077	LY6G6C	O95867	125 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBMS3-208	ENST00000445077	AKAP9	Q99996	3911 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBMS3-208	ENST00000445077	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBMS3-208	ENST00000445077	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBMS3-208	ENST00000445077	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RBMS3-208	ENST00000445077	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBMS3-208	ENST00000445077	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBMS3-208	ENST00000445077	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		5	□□□□□ -1.61
RBMS3-208	ENST00000445077	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	5	□□□□□ -1.61
RBMS3-208	ENST00000445077	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS3-208	ENST00000445077	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS3-208	ENST00000445077	HIVEP1	P15822	2718 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS3-208	ENST00000445077	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
RBMS3-208	ENST00000445077	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS3-208	ENST00000445077	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS3-208	ENST00000445077	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS3-208	ENST00000445077	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS3-208	ENST00000445077		A0A1B0GU33	70 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS3-208	ENST00000445077	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS3-208	ENST00000445077	CSAG1	Q6PB30	78 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS3-208	ENST00000445077	ATR	Q13535	2644 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBMS3-208	ENST00000445077	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBMS3-208	ENST00000445077	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBMS3-208	ENST00000445077	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBMS3-208	ENST00000445077	VWF	P04275	2813 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBMS3-208	ENST00000445077		A8MUU9	505 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBMS3-208	ENST00000445077	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBMS3-208	ENST00000445077		Q6ZSA8	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBMS3-208	ENST00000445077	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS3-208	ENST00000445077	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS3-208	ENST00000445077	MAST4	O15021	2626 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS3-208	ENST00000445077	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS3-208	ENST00000445077	ITPR2	Q14571	2701 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS3-208	ENST00000445077	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS3-208	ENST00000445077	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBMS3-208	ENST00000445077	F8	P00451	2351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS3-208	ENST00000445077	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBMS3-208	ENST00000445077	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS3-208	ENST00000445077	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS3-208	ENST00000445077	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS3-208	ENST00000445077	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS3-208	ENST00000445077	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBMS3-208	ENST00000445077	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS3-208	ENST00000445077	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS3-208	ENST00000445077		Q8N1X5	172 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBMS3-208	ENST00000445077	TENM2	Q9NT68	2774 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBMS3-208	ENST00000445077	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RBMS3-208	ENST00000445077	ROMO1	P60602	79 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RBMS3-208	ENST00000445077	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RBMS3-208	ENST00000445077	TENM3	Q9P273	2699 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RBMS3-208	ENST00000445077	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RBMS3-208	ENST00000445077		H0YAA0	97 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RBMS3-208	ENST00000445077	CUBN	O60494	3623 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RBMS3-208	ENST00000445077	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RBMS3-208	ENST00000445077	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBMS3-208	ENST00000445077	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBMS3-208	ENST00000445077	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBMS3-208	ENST00000445077	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBMS3-208	ENST00000445077	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBMS3-208	ENST00000445077	CRIPT	Q9P021	101 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RBMS3-208	ENST00000445077	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RBMS3-208	ENST00000445077	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBMS3-208	ENST00000445077	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBMS3-208	ENST00000445077	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBMS3-208	ENST00000445077	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBMS3-208	ENST00000445077	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBMS3-208	ENST00000445077	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBMS3-208	ENST00000445077	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBMS3-208	ENST00000445077	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS3-208	ENST00000445077	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBMS3-208	ENST00000445077	STAB1	Q9NY15	2570 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBMS3-208	ENST00000445077	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBMS3-208	ENST00000445077		S4R3F8	94 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBMS3-208	ENST00000445077	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBMS3-208	ENST00000445077		M0QZ58	72 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBMS3-208	ENST00000445077	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBMS3-208	ENST00000445077	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBMS3-208	ENST00000445077	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBMS3-208	ENST00000445077	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBMS3-208	ENST00000445077	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBMS3-208	ENST00000445077	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RBMS3-208	ENST00000445077	ANK2	Q01484	3957 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBMS3-208	ENST00000445077	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBMS3-208	ENST00000445077		A0A0D9SG42	100 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RBMS3-208	ENST00000445077	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RBMS3-208	ENST00000445077	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RBMS3-208	ENST00000445077	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.45	□□□□□ -1.7

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