RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-202ENST00000444040 CD164Q04900 197 aa9.39□□□□□ -0.91
SHQ1-202ENST00000444040 NDUFS5O43920 106 aa9.38□□□□□ -0.91
SHQ1-202ENST00000444040 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.38□□□□□ -0.91
SHQ1-202ENST00000444040 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.37□□□□□ -0.91
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SHQ1-202ENST00000444040 IGKV2-30P06310 120 aa9.04□□□□□ -0.96
SHQ1-202ENST00000444040 A8MU10 97 aa9.04□□□□□ -0.96
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SHQ1-202ENST00000444040 SPINK1P00995 79 aa9.03□□□□□ -0.96
SHQ1-202ENST00000444040 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.03□□□□□ -0.96
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SHQ1-202ENST00000444040 PRR26Q8N8Z3 221 aa9□□□□□ -0.97
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SHQ1-202ENST00000444040 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.83□□□□□ -1
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SHQ1-202ENST00000444040 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.81□□□□□ -1
SHQ1-202ENST00000444040 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.8□□□□□ -1
SHQ1-202ENST00000444040 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.78□□□□□ -1
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SHQ1-202ENST00000444040 A8MUU9 505 aa8.72□□□□□ -1.01
SHQ1-202ENST00000444040 C9orf92A6NGG3 77 aa8.72□□□□□ -1.01
SHQ1-202ENST00000444040 A6NN06 94 aa8.7□□□□□ -1.02
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SHQ1-202ENST00000444040 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.62□□□□□ -1.03
SHQ1-202ENST00000444040 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.6□□□□□ -1.03
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SHQ1-202ENST00000444040 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.53□□□□□ -1.04
SHQ1-202ENST00000444040 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-202ENST00000444040 TNXBP22105 4242 aa8.51□□□□□ -1.05
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP10-8P60410 259 aa8.5□□□□□ -1.05
SHQ1-202ENST00000444040 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SHQ1-202ENST00000444040 HSPG2P98160 4391 aa8.46□□□□□ -1.05
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SHQ1-202ENST00000444040 Q5VSD8 79 aa8.45□□□□□ -1.06
SHQ1-202ENST00000444040 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.41□□□□□ -1.06
SHQ1-202ENST00000444040 RYR1P21817 5038 aa8.38□□□□□ -1.07
SHQ1-202ENST00000444040 RYR3Q15413 4870 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1-202ENST00000444040 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.36□□□□□ -1.07
SHQ1-202ENST00000444040 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SHQ1-202ENST00000444040 H0YAA0 97 aa8.32□□□□□ -1.08
SHQ1-202ENST00000444040 XP32Q5T750 250 aa8.31□□□□□ -1.08
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