RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437051.5

SGO1-208, Transcript of shugoshin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGO1, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1-208ENST00000437051 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa9.21□□□□□ -0.94
SGO1-208ENST00000437051 PSMB2P49721 201 aa9.21□□□□□ -0.94
SGO1-208ENST00000437051 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa9.19□□□□□ -0.94
SGO1-208ENST00000437051 UBE2V1Q13404 147 aa9.19□□□□□ -0.94
SGO1-208ENST00000437051 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa9.19□□□□□ -0.94
SGO1-208ENST00000437051 H3BQ85 93 aa9.18□□□□□ -0.94
SGO1-208ENST00000437051 TRACP01848 142 aa9.18□□□□□ -0.94
SGO1-208ENST00000437051 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa9.15□□□□□ -0.94
SGO1-208ENST00000437051 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
SGO1-208ENST00000437051 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa9.13□□□□□ -0.95
SGO1-208ENST00000437051 A0A1B0GVX0 72 aa9.13□□□□□ -0.95
SGO1-208ENST00000437051 COX6CP09669 75 aa9.13□□□□□ -0.95
SGO1-208ENST00000437051 FAM236CP0DP71 79 aa9.13□□□□□ -0.95
SGO1-208ENST00000437051 LCE1DQ5T752 114 aa9.11□□□□□ -0.95
SGO1-208ENST00000437051 UQCR10Q9UDW1 63 aa9.1□□□□□ -0.95
SGO1-208ENST00000437051 C8orf87E5RJ46 101 aa9.09□□□□□ -0.95
SGO1-208ENST00000437051 VPS25Q9BRG1 176 aa9.09□□□□□ -0.95
SGO1-208ENST00000437051 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9.09□□□□□ -0.95
SGO1-208ENST00000437051 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa9.08□□□□□ -0.96
SGO1-208ENST00000437051 RBM3P98179 157 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
SGO1-208ENST00000437051 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
SGO1-208ENST00000437051 BAALC-AS2P0C853 105 aa9.03□□□□□ -0.96
SGO1-208ENST00000437051 KRTAP10-10P60014 251 aa9.03□□□□□ -0.96
SGO1-208ENST00000437051 Q6ZQT0 140 aa9.03□□□□□ -0.96
SGO1-208ENST00000437051 DSCR8Q96T75 97 aa9.03□□□□□ -0.96
SGO1-208ENST00000437051 SCGB1C2P0DMR2 95 aa9.02□□□□□ -0.97
SGO1-208ENST00000437051 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
SGO1-208ENST00000437051 SPINK7P58062 85 aa9.01□□□□□ -0.97
SGO1-208ENST00000437051 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SGO1-208ENST00000437051 C9JAW5 83 aa8.99□□□□□ -0.97
SGO1-208ENST00000437051 J3KT08 172 aa8.98□□□□□ -0.97
SGO1-208ENST00000437051 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SGO1-208ENST00000437051 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.95□□□□□ -0.98
SGO1-208ENST00000437051 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.95□□□□□ -0.98
SGO1-208ENST00000437051 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SGO1-208ENST00000437051 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.93□□□□□ -0.98
SGO1-208ENST00000437051 A8MWP4 228 aa8.93□□□□□ -0.98
SGO1-208ENST00000437051 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.91□□□□□ -0.98
SGO1-208ENST00000437051 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.9□□□□□ -0.98
SGO1-208ENST00000437051 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.9□□□□□ -0.98
SGO1-208ENST00000437051 ATXN8Q156A1 80 aa8.88□□□□□ -0.99
SGO1-208ENST00000437051 MTURNQ8N3F0 131 aa8.88□□□□□ -0.99
SGO1-208ENST00000437051 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.87□□□□□ -0.99
SGO1-208ENST00000437051 NDUFB1O75438 58 aa8.87□□□□□ -0.99
SGO1-208ENST00000437051 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.87□□□□□ -0.99
SGO1-208ENST00000437051 Q6ZVQ6 151 aa8.85□□□□□ -0.99
SGO1-208ENST00000437051 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
SGO1-208ENST00000437051 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.84□□□□□ -0.99
SGO1-208ENST00000437051 A0A1B0GW54 56 aa8.84□□□□□ -0.99
SGO1-208ENST00000437051 PRR15Q8IV56 129 aa8.84□□□□□ -0.99
SGO1-208ENST00000437051 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.83□□□□□ -1
SGO1-208ENST00000437051 M0R143 59 aa8.81□□□□□ -1
SGO1-208ENST00000437051 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa8.8□□□□□ -1
SGO1-208ENST00000437051 PDE6GP18545 87 aa8.78□□□□□ -1
SGO1-208ENST00000437051 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.77□□□□□ -1.01
SGO1-208ENST00000437051 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.76□□□□□ -1.01
SGO1-208ENST00000437051 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
SGO1-208ENST00000437051 K7EQZ3 153 aa8.75□□□□□ -1.01
SGO1-208ENST00000437051 NREPQ16612 68 aa8.74□□□□□ -1.01
SGO1-208ENST00000437051 Q5W150 140 aa8.7□□□□□ -1.02
SGO1-208ENST00000437051 hDV103S1A0JD37 113 aa8.69□□□□□ -1.02
SGO1-208ENST00000437051 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.69□□□□□ -1.02
SGO1-208ENST00000437051 SMIM6P0DI80 62 aa8.68□□□□□ -1.02
SGO1-208ENST00000437051 BATFQ16520 125 aa8.64□□□□□ -1.03
SGO1-208ENST00000437051 H3BT86 120 aa8.63□□□□□ -1.03
SGO1-208ENST00000437051 TAX1BP3O14907 124 aa8.62□□□□□ -1.03
SGO1-208ENST00000437051 NDUFS5O43920 106 aa8.62□□□□□ -1.03
SGO1-208ENST00000437051 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.61□□□□□ -1.03
SGO1-208ENST00000437051 IGKV2-30P06310 120 aa8.61□□□□□ -1.03
SGO1-208ENST00000437051 Q8N9L7 120 aa8.61□□□□□ -1.03
SGO1-208ENST00000437051 C9orf118A6NHY6 69 aa8.6□□□□□ -1.03
SGO1-208ENST00000437051 A0A1W2PPM0 123 aa8.58□□□□□ -1.04
SGO1-208ENST00000437051 BPY2O14599 106 aa8.57□□□□□ -1.04
SGO1-208ENST00000437051 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.57□□□□□ -1.04
SGO1-208ENST00000437051 LINC00846Q9NV44 126 aa8.56□□□□□ -1.04
SGO1-208ENST00000437051 TSTD3H0UI37 97 aa8.54□□□□□ -1.04
SGO1-208ENST00000437051 HCG22E2RYF7 251 aa8.52□□□□□ -1.05
SGO1-208ENST00000437051 C4orf26Q17RF5 130 aa8.52□□□□□ -1.05
SGO1-208ENST00000437051 CASC2Q6XLA1 102 aa8.52□□□□□ -1.05
SGO1-208ENST00000437051 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa8.51□□□□□ -1.05
SGO1-208ENST00000437051 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.51□□□□□ -1.05
SGO1-208ENST00000437051 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.49□□□□□ -1.05
SGO1-208ENST00000437051 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.46□□□□□ -1.06
SGO1-208ENST00000437051 MT1BP07438 61 aa8.43□□□□□ -1.06
SGO1-208ENST00000437051 CXCL6P80162 114 aa8.42□□□□□ -1.06
SGO1-208ENST00000437051 PRO0461Q9UI25 63 aa8.42□□□□□ -1.06
SGO1-208ENST00000437051 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.42□□□□□ -1.06
SGO1-208ENST00000437051 C5orf47Q569G3 176 aa8.41□□□□□ -1.06
SGO1-208ENST00000437051 LCE4AQ5TA78 99 aa8.37□□□□□ -1.07
SGO1-208ENST00000437051 NEBP20929 6669 aa8.37□□□□□ -1.07
SGO1-208ENST00000437051 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.34□□□□□ -1.07
SGO1-208ENST00000437051 LCA10Q71F78 164 aa8.33□□□□□ -1.08
SGO1-208ENST00000437051 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.33□□□□□ -1.08
SGO1-208ENST00000437051 S4R3F8 94 aa8.32□□□□□ -1.08
SGO1-208ENST00000437051 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.3□□□□□ -1.08
SGO1-208ENST00000437051 UBL5Q9BZL1 73 aa8.3□□□□□ -1.08
SGO1-208ENST00000437051 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.28□□□□□ -1.08
SGO1-208ENST00000437051 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.28□□□□□ -1.08
SGO1-208ENST00000437051 K7EP34 96 aa8.26□□□□□ -1.09
SGO1-208ENST00000437051 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms