RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 VPS25Q9BRG1 176 aa10.45□□□□□ -0.74
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GVX0 72 aa10.42□□□□□ -0.74
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
LIMS1-208ENST00000428064 RBM3P98179 157 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
LIMS1-208ENST00000428064 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa10.4□□□□□ -0.74
LIMS1-208ENST00000428064 DSCR8Q96T75 97 aa10.39□□□□□ -0.75
LIMS1-208ENST00000428064 MT1FP04733 61 aa10.38□□□□□ -0.75
LIMS1-208ENST00000428064 J3KT08 172 aa10.37□□□□□ -0.75
LIMS1-208ENST00000428064 M0R143 59 aa10.37□□□□□ -0.75
LIMS1-208ENST00000428064 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
LIMS1-208ENST00000428064 BAALC-AS2P0C853 105 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMS1-208ENST00000428064 MTURNQ8N3F0 131 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMS1-208ENST00000428064 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa10.33□□□□□ -0.76
LIMS1-208ENST00000428064 C9JAW5 83 aa10.31□□□□□ -0.76
LIMS1-208ENST00000428064 LCE2BO14633 110 aa10.31□□□□□ -0.76
LIMS1-208ENST00000428064 ATXN8Q156A1 80 aa10.31□□□□□ -0.76
LIMS1-208ENST00000428064 SMIM6P0DI80 62 aa10.3□□□□□ -0.76
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP10-10P60014 251 aa10.3□□□□□ -0.76
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZQT0 140 aa10.3□□□□□ -0.76
LIMS1-208ENST00000428064 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
LIMS1-208ENST00000428064 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
LIMS1-208ENST00000428064 SPINK7P58062 85 aa10.27□□□□□ -0.77
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GW54 56 aa10.25□□□□□ -0.77
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFB1O75438 58 aa10.25□□□□□ -0.77
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa10.23□□□□□ -0.77
LIMS1-208ENST00000428064 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa10.22□□□□□ -0.77
LIMS1-208ENST00000428064 BATFQ16520 125 aa10.22□□□□□ -0.77
LIMS1-208ENST00000428064 A8MWP4 228 aa10.2□□□□□ -0.78
LIMS1-208ENST00000428064 TSTD3H0UI37 97 aa10.2□□□□□ -0.78
LIMS1-208ENST00000428064 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa10.19□□□□□ -0.78
LIMS1-208ENST00000428064 LYRM7Q5U5X0 104 aa10.19□□□□□ -0.78
LIMS1-208ENST00000428064 C8orf17Q9NRJ1 99 aa10.19□□□□□ -0.78
LIMS1-208ENST00000428064 C14orf132Q9NPU4 83 aa10.18□□□□□ -0.78
LIMS1-208ENST00000428064 PDE6GP18545 87 aa10.16□□□□□ -0.78
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa10.14□□□□□ -0.79
LIMS1-208ENST00000428064 WFDC13Q8IUB5 93 aa10.14□□□□□ -0.79
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZVQ6 151 aa10.11□□□□□ -0.79
LIMS1-208ENST00000428064 PRR15Q8IV56 129 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00846Q9NV44 126 aa10.05□□□□□ -0.8
LIMS1-208ENST00000428064 C9orf118A6NHY6 69 aa10.04□□□□□ -0.8
LIMS1-208ENST00000428064 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa10.03□□□□□ -0.8
LIMS1-208ENST00000428064 NREPQ16612 68 aa10.03□□□□□ -0.8
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa10.03□□□□□ -0.8
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM254Q8TBM7 123 aa10.03□□□□□ -0.8
LIMS1-208ENST00000428064 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa10.02□□□□□ -0.81
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PPM0 123 aa10.01□□□□□ -0.81
LIMS1-208ENST00000428064 H3BT86 120 aa10.01□□□□□ -0.81
LIMS1-208ENST00000428064 TAX1BP3O14907 124 aa10.01□□□□□ -0.81
LIMS1-208ENST00000428064 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
LIMS1-208ENST00000428064 hDV103S1A0JD37 113 aa9.95□□□□□ -0.82
LIMS1-208ENST00000428064 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa9.95□□□□□ -0.82
LIMS1-208ENST00000428064 K7EQZ3 153 aa9.92□□□□□ -0.82
LIMS1-208ENST00000428064 SPCS1Q9Y6A9 102 aa9.89□□□□□ -0.83
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFS5O43920 106 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMS1-208ENST00000428064 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
LIMS1-208ENST00000428064 BPY2O14599 106 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMS1-208ENST00000428064 C7orf65Q6ZTY9 151 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa9.81□□□□□ -0.84
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV2-30P06310 120 aa9.81□□□□□ -0.84
LIMS1-208ENST00000428064 Q5W150 140 aa9.81□□□□□ -0.84
LIMS1-208ENST00000428064 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
LIMS1-208ENST00000428064 Q8N9L7 120 aa9.79□□□□□ -0.84
LIMS1-208ENST00000428064 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa9.76□□□□□ -0.85
LIMS1-208ENST00000428064 CASC2Q6XLA1 102 aa9.74□□□□□ -0.85
LIMS1-208ENST00000428064 HCG22E2RYF7 251 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMS1-208ENST00000428064 K7EP34 96 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMS1-208ENST00000428064 PRO0461Q9UI25 63 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMS1-208ENST00000428064 CXCL6P80162 114 aa9.69□□□□□ -0.86
LIMS1-208ENST00000428064 C4orf26Q17RF5 130 aa9.68□□□□□ -0.86
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa9.68□□□□□ -0.86
LIMS1-208ENST00000428064 UBL5Q9BZL1 73 aa9.67□□□□□ -0.86
LIMS1-208ENST00000428064 C5orf47Q569G3 176 aa9.57□□□□□ -0.88
LIMS1-208ENST00000428064 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa9.57□□□□□ -0.88
LIMS1-208ENST00000428064 PCP4L1A6NKN8 68 aa9.55□□□□□ -0.88
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa9.55□□□□□ -0.88
LIMS1-208ENST00000428064 S4R3F8 94 aa9.53□□□□□ -0.88
LIMS1-208ENST00000428064 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa9.52□□□□□ -0.89
LIMS1-208ENST00000428064 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.52□□□□□ -0.89
LIMS1-208ENST00000428064 ETDBQ3ZM63 59 aa9.49□□□□□ -0.89
LIMS1-208ENST00000428064 CSAG1Q6PB30 78 aa9.49□□□□□ -0.89
LIMS1-208ENST00000428064 SPRR2GQ9BYE4 73 aa9.49□□□□□ -0.89
LIMS1-208ENST00000428064 F8W1H4 67 aa9.48□□□□□ -0.89
LIMS1-208ENST00000428064 MT1BP07438 61 aa9.48□□□□□ -0.89
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf64Q8NEQ6 169 aa9.48□□□□□ -0.89
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMS1-208ENST00000428064 Q5VV11 94 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMS1-208ENST00000428064 LCA10Q71F78 164 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMS1-208ENST00000428064 A6NN06 94 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMS1-208ENST00000428064 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMS1-208ENST00000428064 KLKP1Q107X0 134 aa9.36□□□□□ -0.91
LIMS1-208ENST00000428064 MUC12Q9UKN1 5478 aa9.34□□□□□ -0.91
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP10-5P60370 271 aa9.33□□□□□ -0.92
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.32□□□□□ -0.92
LIMS1-208ENST00000428064 NEBP20929 6669 aa9.29□□□□□ -0.92
LIMS1-208ENST00000428064 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa9.28□□□□□ -0.92
LIMS1-208ENST00000428064 ACYP1P07311 99 aa9.25□□□□□ -0.93
LIMS1-208ENST00000428064 CRIPTQ9P021 101 aa9.25□□□□□ -0.93
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