RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRU-204ENST00000428026 MYO15AQ9UKN7 3530 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRU-204ENST00000428026 Q5VSD8 79 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRU-204ENST00000428026 Q6ZR54 194 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRU-204ENST00000428026 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRU-204ENST00000428026 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRU-204ENST00000428026 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRU-204ENST00000428026 A0A087X002 238 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRU-204ENST00000428026 M0QZ58 72 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRU-204ENST00000428026 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRU-204ENST00000428026 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.5□□□□□ -1.05
PTPRU-204ENST00000428026 PANO1I0J062 215 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRU-204ENST00000428026 A6NN06 94 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRU-204ENST00000428026 A8MU10 97 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRU-204ENST00000428026 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRU-204ENST00000428026 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRU-204ENST00000428026 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRU-204ENST00000428026 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRU-204ENST00000428026 RELNP78509 3460 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRU-204ENST00000428026 NF1P21359 2839 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRU-204ENST00000428026 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRU-204ENST00000428026 FBN2P35556 2912 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRU-204ENST00000428026 PLAC4Q8WY50 150 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRU-204ENST00000428026 MUC3AQ02505 3323 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRU-204ENST00000428026 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRU-204ENST00000428026 LAMA5O15230 3695 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRU-204ENST00000428026 NDUFAF8A1L188 74 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRU-204ENST00000428026 ASPMQ8IZT6 3477 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRU-204ENST00000428026 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRU-204ENST00000428026 DMDP11532 3685 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRU-204ENST00000428026 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRU-204ENST00000428026 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRU-204ENST00000428026 A8MUU9 505 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRU-204ENST00000428026 TENM2Q9NT68 2774 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRU-204ENST00000428026 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRU-204ENST00000428026 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRU-204ENST00000428026 PDZD2O15018 2839 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRU-204ENST00000428026 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRU-204ENST00000428026 TENM3Q9P273 2699 aa8□□□□□ -1.13
PTPRU-204ENST00000428026 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8□□□□□ -1.13
PTPRU-204ENST00000428026 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRU-204ENST00000428026 ZFHX4Q86UP3 3567 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRU-204ENST00000428026 ZFHX3Q15911 3703 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRU-204ENST00000428026 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRU-204ENST00000428026 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRU-204ENST00000428026 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRU-204ENST00000428026 TNP1P09430 55 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRU-204ENST00000428026 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRU-204ENST00000428026 H0YAA0 97 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRU-204ENST00000428026 VWFP04275 2813 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRU-204ENST00000428026 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRU-204ENST00000428026 TGP01266 2768 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRU-204ENST00000428026 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRU-204ENST00000428026 P0C880 135 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRU-204ENST00000428026 PP632Q6XCG6 107 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP10-8P60410 259 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRU-204ENST00000428026 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRU-204ENST00000428026 A0A1B0GVY2 172 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRU-204ENST00000428026 XP32Q5T750 250 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRU-204ENST00000428026 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRU-204ENST00000428026 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRU-204ENST00000428026 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRU-204ENST00000428026 BSNQ9UPA5 3926 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRU-204ENST00000428026 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRU-204ENST00000428026 TPRXLQ17RH7 258 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRU-204ENST00000428026 CUBNO60494 3623 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP10-10P60014 251 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRU-204ENST00000428026 FBN3Q75N90 2809 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP12-2P59991 146 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRU-204ENST00000428026 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRU-204ENST00000428026 COL7A1Q02388 2944 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP12-1P59990 96 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRU-204ENST00000428026 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRU-204ENST00000428026 VPS13CQ709C8 3753 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRU-204ENST00000428026 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRU-204ENST00000428026 AKAP9Q99996 3911 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRU-204ENST00000428026 MT1HL1P0DM35 61 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRU-204ENST00000428026 INE1O15225 51 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRU-204ENST00000428026 DNHD1Q96M86 4753 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRU-204ENST00000428026 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRU-204ENST00000428026 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRU-204ENST00000428026 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRU-204ENST00000428026 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.59□□□□□ -1.35
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