RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGKV4-1P06312 121 aa5.79□□□□□ -1.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.79□□□□□ -1.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.79□□□□□ -1.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DSCR10P59022 87 aa5.78□□□□□ -1.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.77□□□□□ -1.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.76□□□□□ -1.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.75□□□□□ -1.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CD164Q04900 197 aa5.74□□□□□ -1.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 K7EQZ3 153 aa5.74□□□□□ -1.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 Q96NJ1 140 aa5.74□□□□□ -1.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.73□□□□□ -1.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 H3BS24 57 aa5.72□□□□□ -1.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATOX1O00244 68 aa5.72□□□□□ -1.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.72□□□□□ -1.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.71□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC179H3BU77 68 aa5.69□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPINK1P00995 79 aa5.69□□□□□ -1.5
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.69□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LIMD2Q9BT23 127 aa5.69□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.69□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.68□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A8MWP4 228 aa5.68□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 J3KT08 172 aa5.67□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRR15Q8IV56 129 aa5.67□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TNXBP22105 4242 aa5.66□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COX7CP15954 63 aa5.65□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SERP2Q8N6R1 65 aa5.65□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HCG22E2RYF7 251 aa5.64□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP10-8P60410 259 aa5.64□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 Q5XG85 94 aa5.64□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.64□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.64□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.64□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.62□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UQCRQO14949 82 aa5.62□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NDUFB1O75438 58 aa5.62□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A1B0GVX0 72 aa5.61□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C1orf195Q5TG92 126 aa5.61□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OCR1Q9BZK8 76 aa5.61□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.6□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.6□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.6□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.6□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CASC2Q6XLA1 102 aa5.59□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.58□□□□□ -1.52
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MT1HL1P0DM35 61 aa5.57□□□□□ -1.52
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 hDV103S1A0JD37 113 aa5.56□□□□□ -1.52
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C20orf197Q8N268 126 aa5.56□□□□□ -1.52
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.56□□□□□ -1.52
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.53□□□□□ -1.52
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SNURFQ9Y675 71 aa5.53□□□□□ -1.52
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C8orf87E5RJ46 101 aa5.51□□□□□ -1.53
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MYCBP2O75592 4640 aa5.51□□□□□ -1.53
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A0U1RQV1 116 aa5.5□□□□□ -1.53
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KLKP1Q107X0 134 aa5.49□□□□□ -1.53
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HERC2O95714 4834 aa5.49□□□□□ -1.53
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.48□□□□□ -1.53
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NDUFS5O43920 106 aa5.48□□□□□ -1.53
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C5orf47Q569G3 176 aa5.48□□□□□ -1.53
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.48□□□□□ -1.53
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 H0Y9P7 68 aa5.47□□□□□ -1.53
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 H7BZZ5 65 aa5.45□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.45□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.45□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.43□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MP68P56378 58 aa5.43□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRR4Q16378 134 aa5.43□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC00208Q96KT6 92 aa5.43□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.43□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 Q5W150 140 aa5.42□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM258P61165 79 aa5.41□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.41□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C9orf92A6NGG3 77 aa5.4□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 H3BPC8 53 aa5.4□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NDUFC1O43677 76 aa5.4□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.4□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TPRXLQ17RH7 258 aa5.38□□□□□ -1.55
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.37□□□□□ -1.55
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM236CP0DP71 79 aa5.37□□□□□ -1.55
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A8MUU9 505 aa5.33□□□□□ -1.56
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.33□□□□□ -1.56
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PCOTHQ58A44 107 aa5.33□□□□□ -1.56
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.32□□□□□ -1.56
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGKV2-30P06310 120 aa5.3□□□□□ -1.56
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 Q75L30 129 aa5.3□□□□□ -1.56
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.3□□□□□ -1.56
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.29□□□□□ -1.56
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