RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 DSCR10P59022 87 aa2.4□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00483Q53H64 154 aa2.4□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 MOBPQ13875 183 aa2.39□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 PKD1P98161 4303 aa2.39□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 SACSQ9NZJ4 4579 aa2.39□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 K7EQZ3 153 aa2.39□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 Q6ZSA8 131 aa2.39□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV7A0A075B6U4 112 aa2.38□□□□□ -2.03
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LRRTM4-201ENST00000409088 SPTSSBQ8NFR3 76 aa2.38□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa2.38□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 LRP1BQ9NZR2 4599 aa2.38□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 C20orf197Q8N268 126 aa2.38□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 CYSTM1Q9H1C7 97 aa2.37□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00472Q9H8W2 130 aa2.37□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 WFDC13Q8IUB5 93 aa2.36□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 Q8N1X5 172 aa2.36□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 C8orf87E5RJ46 101 aa2.36□□□□□ -2.03
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LRRTM4-201ENST00000409088 PKHD1P08F94 4074 aa2.35□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 OCR1Q9BZK8 76 aa2.35□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 A8MWP4 228 aa2.35□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 NDUFS5O43920 106 aa2.35□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 PRR15Q8IV56 129 aa2.35□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa2.35□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A087X002 238 aa2.35□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 NDUFB1O75438 58 aa2.35□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa2.34□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 Q96NJ1 140 aa2.34□□□□□ -2.03
LRRTM4-201ENST00000409088 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
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LRRTM4-201ENST00000409088 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.04
LRRTM4-201ENST00000409088 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa2.34□□□□□ -2.04
LRRTM4-201ENST00000409088 CASC2Q6XLA1 102 aa2.34□□□□□ -2.04
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM254Q8TBM7 123 aa2.34□□□□□ -2.04
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1B0GVY2 172 aa2.33□□□□□ -2.04
LRRTM4-201ENST00000409088 CDK2AP2O75956 126 aa2.33□□□□□ -2.04
LRRTM4-201ENST00000409088 KLKP1Q107X0 134 aa2.33□□□□□ -2.04
LRRTM4-201ENST00000409088 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa2.32□□□□□ -2.04
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LRRTM4-201ENST00000409088 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa2.32□□□□□ -2.04
LRRTM4-201ENST00000409088 RYR2Q92736 4967 aa2.32□□□□□ -2.04
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LRRTM4-201ENST00000409088 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa2.32□□□□□ -2.04
LRRTM4-201ENST00000409088 hDV103S1A0JD37 113 aa2.32□□□□□ -2.04
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LRRTM4-201ENST00000409088 FAT1Q14517 4588 aa2.31□□□□□ -2.04
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LRRTM4-201ENST00000409088 H0Y9P7 68 aa2.29□□□□□ -2.04
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LRRTM4-201ENST00000409088 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa2.29□□□□□ -2.04
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
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LRRTM4-201ENST00000409088 SPINK1P00995 79 aa2.27□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00304Q8N9R0 145 aa2.27□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 PSPHP1O15172 72 aa2.27□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00313P59037 77 aa2.27□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 C1orf64Q8NEQ6 169 aa2.27□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa2.27□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 PRR4Q16378 134 aa2.27□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 RYR3Q15413 4870 aa2.26□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.26□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 H3BPC8 53 aa2.26□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 SERP1Q9Y6X1 66 aa2.25□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 SPAG11AQ6PDA7 123 aa2.25□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa2.25□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 PCOTHQ58A44 107 aa2.25□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 Q5W150 140 aa2.24□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 RETNLBQ9BQ08 111 aa2.24□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 Q5VSD8 79 aa2.24□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 ADM2Q7Z4H4 148 aa2.24□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS29P62273 56 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 HSPG2P98160 4391 aa2.23□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa2.22□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 Q75L30 129 aa2.22□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.22□□□□□ -2.05
LRRTM4-201ENST00000409088 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.22□□□□□ -2.05
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