RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 A0A087X002 238 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD13-201ENST00000392539 CD164Q04900 197 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD13-201ENST00000392539 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD13-201ENST00000392539 LY6G6CO95867 125 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD13-201ENST00000392539 Q5VV11 94 aa15.55■□□□□ 0.08
HOXD13-201ENST00000392539 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa15.54■□□□□ 0.08
HOXD13-201ENST00000392539 COA5Q86WW8 74 aa15.53■□□□□ 0.08
HOXD13-201ENST00000392539 SPINK6Q6UWN8 80 aa15.52■□□□□ 0.08
HOXD13-201ENST00000392539 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa15.52■□□□□ 0.08
HOXD13-201ENST00000392539 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXD13-201ENST00000392539 TGP01266 2768 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXD13-201ENST00000392539 DNAH6Q9C0G6 4158 aa15.45■□□□□ 0.06
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP10-2P60368 255 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXD13-201ENST00000392539 PMAIP1Q13794 54 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXD13-201ENST00000392539 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXD13-201ENST00000392539 C8orf87E5RJ46 101 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXD13-201ENST00000392539 PRR15LQ9BU68 103 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD13-201ENST00000392539 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD13-201ENST00000392539 ALMS1Q8TCU4 4167 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD13-201ENST00000392539 Q75L30 129 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXD13-201ENST00000392539 Q5W150 140 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXD13-201ENST00000392539 DNAH11Q96DT5 4516 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXD13-201ENST00000392539 DNAH5Q8TE73 4624 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXD13-201ENST00000392539 Q6ZSA8 131 aa15.3■□□□□ 0.04
HOXD13-201ENST00000392539 HRES1P13985 223 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXD13-201ENST00000392539 LINC00313P59037 77 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXD13-201ENST00000392539 A8MU10 97 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP10-1P60331 282 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD13-201ENST00000392539 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD13-201ENST00000392539 SEC61GP60059 68 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD13-201ENST00000392539 SPAG11AQ6PDA7 123 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD13-201ENST00000392539 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD13-201ENST00000392539 A6NED7 52 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD13-201ENST00000392539 LCA10Q71F78 164 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD13-201ENST00000392539 FAM229AH3BQW9 127 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD13-201ENST00000392539 DNHD1Q96M86 4753 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD13-201ENST00000392539 PKD1P98161 4303 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD13-201ENST00000392539 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa15.12■□□□□ 0.01
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa15.11■□□□□ 0.01
HOXD13-201ENST00000392539 ACYP2P14621 99 aa15.09■□□□□ 0.01
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa15.05■□□□□ -0
HOXD13-201ENST00000392539 LRP1BQ9NZR2 4599 aa15.05■□□□□ -0
HOXD13-201ENST00000392539 SPTSSBQ8NFR3 76 aa15.04■□□□□ -0
HOXD13-201ENST00000392539 IGKV2-30P06310 120 aa15.03■□□□□ -0
HOXD13-201ENST00000392539 RETNLBQ9BQ08 111 aa15.02■□□□□ -0
HOXD13-201ENST00000392539 DMAC1Q96GE9 116 aa15.02□□□□□ -0.01
HOXD13-201ENST00000392539 FAT2Q9NYQ8 4349 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXD13-201ENST00000392539 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa15□□□□□ -0.01
HOXD13-201ENST00000392539 PRR26Q8N8Z3 221 aa15□□□□□ -0.01
HOXD13-201ENST00000392539 C4orf48Q5BLP8 95 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD13-201ENST00000392539 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXD13-201ENST00000392539 A6NN06 94 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXD13-201ENST00000392539 TYMSOSQ8TAI1 123 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXD13-201ENST00000392539 HYDINQ4G0P3 5121 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXD13-201ENST00000392539 SPINK1P00995 79 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD13-201ENST00000392539 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD13-201ENST00000392539 SPINK7P58062 85 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXD13-201ENST00000392539 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXD13-201ENST00000392539 RPS29P62273 56 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXD13-201ENST00000392539 LINC00304Q8N9R0 145 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXD13-201ENST00000392539 C7orf65Q6ZTY9 151 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXD13-201ENST00000392539 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1B0GU69 56 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXD13-201ENST00000392539 SACSQ9NZJ4 4579 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD13-201ENST00000392539 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXD13-201ENST00000392539 PKHD1P08F94 4074 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXD13-201ENST00000392539 SPATA8Q6RVD6 105 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXD13-201ENST00000392539 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1B0GVY2 172 aa14.44□□□□□ -0.1
HOXD13-201ENST00000392539 Q8N1X5 172 aa14.42□□□□□ -0.1
HOXD13-201ENST00000392539 A8MUU9 505 aa14.41□□□□□ -0.1
HOXD13-201ENST00000392539 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa14.41□□□□□ -0.1
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
HOXD13-201ENST00000392539 UQCR11O14957 56 aa14.4□□□□□ -0.1
HOXD13-201ENST00000392539 C9orf92A6NGG3 77 aa14.38□□□□□ -0.11
HOXD13-201ENST00000392539 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa14.36□□□□□ -0.11
HOXD13-201ENST00000392539 MIR22HGQ0VDD5 57 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXD13-201ENST00000392539 APOBP04114 4563 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
HOXD13-201ENST00000392539 FAT1Q14517 4588 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXD13-201ENST00000392539 PRAC1Q96KF2 57 aa14.15□□□□□ -0.14
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa14.13□□□□□ -0.15
HOXD13-201ENST00000392539 ADM2Q7Z4H4 148 aa14.1□□□□□ -0.15
HOXD13-201ENST00000392539 RYR2Q92736 4967 aa14.02□□□□□ -0.17
HOXD13-201ENST00000392539 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
HOXD13-201ENST00000392539 COX6B2Q6YFQ2 88 aa13.96□□□□□ -0.17
HOXD13-201ENST00000392539 LINC01554Q52M75 96 aa13.92□□□□□ -0.18
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP10-8P60410 259 aa13.9□□□□□ -0.18
HOXD13-201ENST00000392539 H0YAA0 97 aa13.87□□□□□ -0.19
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1B0GU33 70 aa13.87□□□□□ -0.19
HOXD13-201ENST00000392539 FAT3Q8TDW7 4589 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXD13-201ENST00000392539 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa13.83□□□□□ -0.2
HOXD13-201ENST00000392539 TNXBP22105 4242 aa13.8□□□□□ -0.2
HOXD13-201ENST00000392539 Q5VSD8 79 aa13.79□□□□□ -0.2
HOXD13-201ENST00000392539 CSAG1Q6PB30 78 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXD13-201ENST00000392539 RPL37P61927 97 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
HOXD13-201ENST00000392539 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
HOXD13-201ENST00000392539 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms