RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361490.8

HPS1-204, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 3,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-204ENST00000361490 IGKV2-30P06310 120 aa6.75□□□□□ -1.33
HPS1-204ENST00000361490 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HPS1-204ENST00000361490 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.75□□□□□ -1.33
HPS1-204ENST00000361490 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.75□□□□□ -1.33
HPS1-204ENST00000361490 H7BZZ5 65 aa6.74□□□□□ -1.33
HPS1-204ENST00000361490 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.74□□□□□ -1.33
HPS1-204ENST00000361490 C1orf195Q5TG92 126 aa6.74□□□□□ -1.33
HPS1-204ENST00000361490 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.74□□□□□ -1.33
HPS1-204ENST00000361490 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.73□□□□□ -1.33
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.73□□□□□ -1.33
HPS1-204ENST00000361490 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HPS1-204ENST00000361490 FAT1Q14517 4588 aa6.72□□□□□ -1.33
HPS1-204ENST00000361490 NDUFC1O43677 76 aa6.72□□□□□ -1.33
HPS1-204ENST00000361490 SPINK1P00995 79 aa6.72□□□□□ -1.33
HPS1-204ENST00000361490 KLKP1Q107X0 134 aa6.72□□□□□ -1.33
HPS1-204ENST00000361490 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.71□□□□□ -1.34
HPS1-204ENST00000361490 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.71□□□□□ -1.34
HPS1-204ENST00000361490 A0A1B0GVY2 172 aa6.7□□□□□ -1.34
HPS1-204ENST00000361490 A0A0U1RQV1 116 aa6.69□□□□□ -1.34
HPS1-204ENST00000361490 CD164Q04900 197 aa6.69□□□□□ -1.34
HPS1-204ENST00000361490 PKHD1P08F94 4074 aa6.69□□□□□ -1.34
HPS1-204ENST00000361490 Q5XG85 94 aa6.68□□□□□ -1.34
HPS1-204ENST00000361490 V9GYY9 64 aa6.68□□□□□ -1.34
HPS1-204ENST00000361490 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.67□□□□□ -1.34
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
HPS1-204ENST00000361490 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.66□□□□□ -1.34
HPS1-204ENST00000361490 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.66□□□□□ -1.34
HPS1-204ENST00000361490 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.65□□□□□ -1.34
HPS1-204ENST00000361490 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.65□□□□□ -1.35
HPS1-204ENST00000361490 C8orf87E5RJ46 101 aa6.63□□□□□ -1.35
HPS1-204ENST00000361490 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HPS1-204ENST00000361490 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.61□□□□□ -1.35
HPS1-204ENST00000361490 Q5W150 140 aa6.6□□□□□ -1.35
HPS1-204ENST00000361490 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HPS1-204ENST00000361490 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.59□□□□□ -1.35
HPS1-204ENST00000361490 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.58□□□□□ -1.36
HPS1-204ENST00000361490 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HPS1-204ENST00000361490 BRK1Q8WUW1 75 aa6.58□□□□□ -1.36
HPS1-204ENST00000361490 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.57□□□□□ -1.36
HPS1-204ENST00000361490 Q8N1X5 172 aa6.56□□□□□ -1.36
HPS1-204ENST00000361490 J3QL48 77 aa6.55□□□□□ -1.36
HPS1-204ENST00000361490 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HPS1-204ENST00000361490 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.55□□□□□ -1.36
HPS1-204ENST00000361490 PSPHP1O15172 72 aa6.54□□□□□ -1.36
HPS1-204ENST00000361490 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.54□□□□□ -1.36
HPS1-204ENST00000361490 H3BPC8 53 aa6.53□□□□□ -1.36
HPS1-204ENST00000361490 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.52□□□□□ -1.37
HPS1-204ENST00000361490 RYR2Q92736 4967 aa6.52□□□□□ -1.37
HPS1-204ENST00000361490 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.52□□□□□ -1.37
HPS1-204ENST00000361490 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.51□□□□□ -1.37
HPS1-204ENST00000361490 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.48□□□□□ -1.37
HPS1-204ENST00000361490 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.47□□□□□ -1.37
HPS1-204ENST00000361490 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.47□□□□□ -1.37
HPS1-204ENST00000361490 HRES1P13985 223 aa6.47□□□□□ -1.37
HPS1-204ENST00000361490 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HPS1-204ENST00000361490 PKD1P98161 4303 aa6.47□□□□□ -1.37
HPS1-204ENST00000361490 RYR3Q15413 4870 aa6.47□□□□□ -1.37
HPS1-204ENST00000361490 COA5Q86WW8 74 aa6.47□□□□□ -1.37
HPS1-204ENST00000361490 PRO0628Q9UI54 55 aa6.47□□□□□ -1.37
HPS1-204ENST00000361490 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
HPS1-204ENST00000361490 PRR15LQ9BU68 103 aa6.43□□□□□ -1.38
HPS1-204ENST00000361490 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HPS1-204ENST00000361490 ACYP2P14621 99 aa6.41□□□□□ -1.38
HPS1-204ENST00000361490 SPINK7P58062 85 aa6.38□□□□□ -1.39
HPS1-204ENST00000361490 A8MUN3 132 aa6.38□□□□□ -1.39
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.38□□□□□ -1.39
HPS1-204ENST00000361490 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.37□□□□□ -1.39
HPS1-204ENST00000361490 MYCBP2O75592 4640 aa6.37□□□□□ -1.39
HPS1-204ENST00000361490 RYR1P21817 5038 aa6.37□□□□□ -1.39
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.35□□□□□ -1.39
HPS1-204ENST00000361490 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
HPS1-204ENST00000361490 A6NED7 52 aa6.34□□□□□ -1.4
HPS1-204ENST00000361490 H3BS24 57 aa6.34□□□□□ -1.4
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.34□□□□□ -1.4
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP10-8P60410 259 aa6.33□□□□□ -1.4
HPS1-204ENST00000361490 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HPS1-204ENST00000361490 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.31□□□□□ -1.4
HPS1-204ENST00000361490 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.31□□□□□ -1.4
HPS1-204ENST00000361490 A8MU10 97 aa6.27□□□□□ -1.41
HPS1-204ENST00000361490 PMAIP1Q13794 54 aa6.27□□□□□ -1.41
HPS1-204ENST00000361490 A0A1B0GU69 56 aa6.25□□□□□ -1.41
HPS1-204ENST00000361490 A8MUU9 505 aa6.23□□□□□ -1.41
HPS1-204ENST00000361490 Q1T7F1 81 aa6.23□□□□□ -1.41
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.23□□□□□ -1.41
HPS1-204ENST00000361490 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.23□□□□□ -1.41
HPS1-204ENST00000361490 XP32Q5T750 250 aa6.22□□□□□ -1.41
HPS1-204ENST00000361490 HSPG2P98160 4391 aa6.22□□□□□ -1.41
HPS1-204ENST00000361490 MT1HL1P0DM35 61 aa6.21□□□□□ -1.41
HPS1-204ENST00000361490 DMAC1Q96GE9 116 aa6.2□□□□□ -1.42
HPS1-204ENST00000361490 Q75L30 129 aa6.2□□□□□ -1.42
HPS1-204ENST00000361490 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
HPS1-204ENST00000361490 Q5VV11 94 aa6.17□□□□□ -1.42
HPS1-204ENST00000361490 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.13□□□□□ -1.43
HPS1-204ENST00000361490 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.1□□□□□ -1.43
HPS1-204ENST00000361490 HERC2O95714 4834 aa6.08□□□□□ -1.44
HPS1-204ENST00000361490 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.06□□□□□ -1.44
HPS1-204ENST00000361490 LCA10Q71F78 164 aa6.06□□□□□ -1.44
HPS1-204ENST00000361490 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HPS1-204ENST00000361490 TPRXLQ17RH7 258 aa6.03□□□□□ -1.44
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