RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.8□□□□□ -1.16
CSAG1-201ENST00000361211 MTURNQ8N3F0 131 aa7.8□□□□□ -1.16
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.79□□□□□ -1.16
CSAG1-201ENST00000361211 LCE2BO14633 110 aa7.77□□□□□ -1.17
CSAG1-201ENST00000361211 MT1HP80294 61 aa7.77□□□□□ -1.17
CSAG1-201ENST00000361211 H3BT86 120 aa7.76□□□□□ -1.17
CSAG1-201ENST00000361211 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.76□□□□□ -1.17
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1B0GVX0 72 aa7.75□□□□□ -1.17
CSAG1-201ENST00000361211 PDE6GP18545 87 aa7.75□□□□□ -1.17
CSAG1-201ENST00000361211 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1B0GW54 56 aa7.72□□□□□ -1.17
CSAG1-201ENST00000361211 C8orf87E5RJ46 101 aa7.72□□□□□ -1.17
CSAG1-201ENST00000361211 J3KT08 172 aa7.72□□□□□ -1.17
CSAG1-201ENST00000361211 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.72□□□□□ -1.17
CSAG1-201ENST00000361211 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.71□□□□□ -1.18
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.71□□□□□ -1.18
CSAG1-201ENST00000361211 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.69□□□□□ -1.18
CSAG1-201ENST00000361211 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.66□□□□□ -1.18
CSAG1-201ENST00000361211 A8MWP4 228 aa7.66□□□□□ -1.18
CSAG1-201ENST00000361211 NREPQ16612 68 aa7.66□□□□□ -1.18
CSAG1-201ENST00000361211 NDUFB1O75438 58 aa7.65□□□□□ -1.18
CSAG1-201ENST00000361211 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.64□□□□□ -1.19
CSAG1-201ENST00000361211 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.63□□□□□ -1.19
CSAG1-201ENST00000361211 PRO0461Q9UI25 63 aa7.63□□□□□ -1.19
CSAG1-201ENST00000361211 K7EP34 96 aa7.62□□□□□ -1.19
CSAG1-201ENST00000361211 M0R2T5 61 aa7.6□□□□□ -1.19
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CSAG1-201ENST00000361211 PRR15Q8IV56 129 aa7.6□□□□□ -1.19
CSAG1-201ENST00000361211 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CSAG1-201ENST00000361211 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CSAG1-201ENST00000361211 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CSAG1-201ENST00000361211 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.57□□□□□ -1.2
CSAG1-201ENST00000361211 K7EQZ3 153 aa7.57□□□□□ -1.2
CSAG1-201ENST00000361211 HRES1P13985 223 aa7.57□□□□□ -1.2
CSAG1-201ENST00000361211 Q6ZVQ6 151 aa7.56□□□□□ -1.2
CSAG1-201ENST00000361211 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.55□□□□□ -1.2
CSAG1-201ENST00000361211 BPY2O14599 106 aa7.53□□□□□ -1.2
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.52□□□□□ -1.21
CSAG1-201ENST00000361211 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CSAG1-201ENST00000361211 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.5□□□□□ -1.21
CSAG1-201ENST00000361211 Q8N9L7 120 aa7.5□□□□□ -1.21
CSAG1-201ENST00000361211 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.49□□□□□ -1.21
CSAG1-201ENST00000361211 hDV103S1A0JD37 113 aa7.49□□□□□ -1.21
CSAG1-201ENST00000361211 FAM236CP0DP71 79 aa7.49□□□□□ -1.21
CSAG1-201ENST00000361211 SPINK7P58062 85 aa7.49□□□□□ -1.21
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00846Q9NV44 126 aa7.49□□□□□ -1.21
CSAG1-201ENST00000361211 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.47□□□□□ -1.21
CSAG1-201ENST00000361211 F8W1H4 67 aa7.44□□□□□ -1.22
CSAG1-201ENST00000361211 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.44□□□□□ -1.22
CSAG1-201ENST00000361211 NDUFS5O43920 106 aa7.43□□□□□ -1.22
CSAG1-201ENST00000361211 ETDBQ3ZM63 59 aa7.43□□□□□ -1.22
CSAG1-201ENST00000361211 UBL5Q9BZL1 73 aa7.43□□□□□ -1.22
CSAG1-201ENST00000361211 CASC2Q6XLA1 102 aa7.4□□□□□ -1.22
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.39□□□□□ -1.23
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.38□□□□□ -1.23
CSAG1-201ENST00000361211 Q5W150 140 aa7.37□□□□□ -1.23
CSAG1-201ENST00000361211 HCG22E2RYF7 251 aa7.36□□□□□ -1.23
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.31□□□□□ -1.24
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV2-30P06310 120 aa7.31□□□□□ -1.24
CSAG1-201ENST00000361211 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.31□□□□□ -1.24
CSAG1-201ENST00000361211 MT2AP02795 61 aa7.29□□□□□ -1.24
CSAG1-201ENST00000361211 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.29□□□□□ -1.24
CSAG1-201ENST00000361211 CXCL6P80162 114 aa7.28□□□□□ -1.24
CSAG1-201ENST00000361211 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.28□□□□□ -1.24
CSAG1-201ENST00000361211 MT1FP04733 61 aa7.25□□□□□ -1.25
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1B0GV90 55 aa7.22□□□□□ -1.25
CSAG1-201ENST00000361211 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.2□□□□□ -1.26
CSAG1-201ENST00000361211 ACYP1P07311 99 aa7.2□□□□□ -1.26
CSAG1-201ENST00000361211 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.2□□□□□ -1.26
CSAG1-201ENST00000361211 USH2AO75445 5202 aa7.19□□□□□ -1.26
CSAG1-201ENST00000361211 C4orf26Q17RF5 130 aa7.18□□□□□ -1.26
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP10-10P60014 251 aa7.17□□□□□ -1.26
CSAG1-201ENST00000361211 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.16□□□□□ -1.26
CSAG1-201ENST00000361211 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.14□□□□□ -1.27
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.14□□□□□ -1.27
CSAG1-201ENST00000361211 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.1□□□□□ -1.27
CSAG1-201ENST00000361211 SSPOA2VEC9 5147 aa7.08□□□□□ -1.28
CSAG1-201ENST00000361211 A0A087WVE0 104 aa7.06□□□□□ -1.28
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00643Q86TS7 51 aa7.06□□□□□ -1.28
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.05□□□□□ -1.28
CSAG1-201ENST00000361211 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.04□□□□□ -1.28
CSAG1-201ENST00000361211 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.03□□□□□ -1.28
CSAG1-201ENST00000361211 UQCRQO14949 82 aa6.99□□□□□ -1.29
CSAG1-201ENST00000361211 C5orf47Q569G3 176 aa6.99□□□□□ -1.29
CSAG1-201ENST00000361211 S4R3F8 94 aa6.99□□□□□ -1.29
CSAG1-201ENST00000361211 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.98□□□□□ -1.29
CSAG1-201ENST00000361211 H0Y9P7 68 aa6.97□□□□□ -1.29
CSAG1-201ENST00000361211 LCA10Q71F78 164 aa6.96□□□□□ -1.3
CSAG1-201ENST00000361211 J3QR89 54 aa6.93□□□□□ -1.3
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.92□□□□□ -1.3
CSAG1-201ENST00000361211 ATOX1O00244 68 aa6.91□□□□□ -1.3
CSAG1-201ENST00000361211 OCR1Q9BZK8 76 aa6.9□□□□□ -1.3
CSAG1-201ENST00000361211 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CSAG1-201ENST00000361211 CSAG1Q6PB30 78 aa6.88□□□□□ -1.31
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00208Q96KT6 92 aa6.86□□□□□ -1.31
CSAG1-201ENST00000361211 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.85□□□□□ -1.31
CSAG1-201ENST00000361211 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.85□□□□□ -1.31
CSAG1-201ENST00000361211 KLKP1Q107X0 134 aa6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 161.5 ms