RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 C9orf118A6NHY6 69 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAX1BP3O14907 124 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 C14orf132Q9NPU4 83 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 C8orf87E5RJ46 101 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 J3KT08 172 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PPM0 123 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDE6GP18545 87 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1B0GW54 56 aa10.05□□□□□ -0.8
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PTPRCAP-201ENST00000326294 C8orf17Q9NRJ1 99 aa9.93□□□□□ -0.82
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PTPRCAP-201ENST00000326294 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa9.86□□□□□ -0.83
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PTPRCAP-201ENST00000326294 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM236CP0DP71 79 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 K7EQZ3 153 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9.8□□□□□ -0.84
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PTPRCAP-201ENST00000326294 K7EP34 96 aa9.79□□□□□ -0.84
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PTPRCAP-201ENST00000326294 SPINK7P58062 85 aa9.77□□□□□ -0.85
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PTPRCAP-201ENST00000326294 Q8N9L7 120 aa9.68□□□□□ -0.86
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PTPRCAP-201ENST00000326294 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBL5Q9BZL1 73 aa9.61□□□□□ -0.87
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PTPRCAP-201ENST00000326294 MT2AP02795 61 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 F8W1H4 67 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q5W150 140 aa9.57□□□□□ -0.88
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PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP10-10P60014 251 aa9.42□□□□□ -0.9
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PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa9.39□□□□□ -0.91
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PTPRCAP-201ENST00000326294 C4orf26Q17RF5 130 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRCAP-201ENST00000326294 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACYP1P07311 99 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1B0GV90 55 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf64Q8NEQ6 169 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
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PTPRCAP-201ENST00000326294 S4R3F8 94 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRCAP-201ENST00000326294 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
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PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.99□□□□□ -0.97
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PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRCAP-201ENST00000326294 J3QR89 54 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRCAP-201ENST00000326294 OCR1Q9BZK8 76 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00208Q96KT6 92 aa8.86□□□□□ -0.99
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