RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299687.9

ZNF407-201, Transcript of zinc finger protein 407, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF407, Length 7,948 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407-201ENST00000299687 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.1□□□□□ -1.27
ZNF407-201ENST00000299687 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
ZNF407-201ENST00000299687 COL12A1Q99715 3063 aa7.09□□□□□ -1.28
ZNF407-201ENST00000299687 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa7.08□□□□□ -1.28
ZNF407-201ENST00000299687 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa7.07□□□□□ -1.28
ZNF407-201ENST00000299687 A8MU10 97 aa7.06□□□□□ -1.28
ZNF407-201ENST00000299687 ZZEF1O43149 2961 aa7.04□□□□□ -1.28
ZNF407-201ENST00000299687 A0A087X002 238 aa7.04□□□□□ -1.28
ZNF407-201ENST00000299687 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.99□□□□□ -1.29
ZNF407-201ENST00000299687 ATMQ13315 3056 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF407-201ENST00000299687 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
ZNF407-201ENST00000299687 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.93□□□□□ -1.3
ZNF407-201ENST00000299687 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.93□□□□□ -1.3
ZNF407-201ENST00000299687 RELNP78509 3460 aa6.92□□□□□ -1.3
ZNF407-201ENST00000299687 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.91□□□□□ -1.3
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP10-8P60410 259 aa6.91□□□□□ -1.3
ZNF407-201ENST00000299687 ITPR1Q14643 2758 aa6.91□□□□□ -1.3
ZNF407-201ENST00000299687 A6NN06 94 aa6.91□□□□□ -1.3
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
ZNF407-201ENST00000299687 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.89□□□□□ -1.31
ZNF407-201ENST00000299687 P0C880 135 aa6.88□□□□□ -1.31
ZNF407-201ENST00000299687 TACC2O95359 2948 aa6.87□□□□□ -1.31
ZNF407-201ENST00000299687 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
ZNF407-201ENST00000299687 PP632Q6XCG6 107 aa6.86□□□□□ -1.31
ZNF407-201ENST00000299687 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.85□□□□□ -1.31
ZNF407-201ENST00000299687 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.83□□□□□ -1.32
ZNF407-201ENST00000299687 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.82□□□□□ -1.32
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.79□□□□□ -1.32
ZNF407-201ENST00000299687 FLNCQ14315 2725 aa6.79□□□□□ -1.32
ZNF407-201ENST00000299687 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
ZNF407-201ENST00000299687 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.79□□□□□ -1.32
ZNF407-201ENST00000299687 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.77□□□□□ -1.33
ZNF407-201ENST00000299687 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
ZNF407-201ENST00000299687 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.74□□□□□ -1.33
ZNF407-201ENST00000299687 HIVEP1P15822 2718 aa6.74□□□□□ -1.33
ZNF407-201ENST00000299687 NF1P21359 2839 aa6.72□□□□□ -1.33
ZNF407-201ENST00000299687 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.71□□□□□ -1.34
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF407-201ENST00000299687 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF407-201ENST00000299687 A0A1B0GVY2 172 aa6.68□□□□□ -1.34
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.67□□□□□ -1.34
ZNF407-201ENST00000299687 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF407-201ENST00000299687 DMDP11532 3685 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP10-10P60014 251 aa6.65□□□□□ -1.35
ZNF407-201ENST00000299687 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.63□□□□□ -1.35
ZNF407-201ENST00000299687 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.62□□□□□ -1.35
ZNF407-201ENST00000299687 TENM3Q9P273 2699 aa6.58□□□□□ -1.36
ZNF407-201ENST00000299687 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
ZNF407-201ENST00000299687 ZFHX3Q15911 3703 aa6.58□□□□□ -1.36
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.58□□□□□ -1.36
ZNF407-201ENST00000299687 XP32Q5T750 250 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF407-201ENST00000299687 TPRXLQ17RH7 258 aa6.52□□□□□ -1.37
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.46□□□□□ -1.38
ZNF407-201ENST00000299687 H0YAA0 97 aa6.45□□□□□ -1.38
ZNF407-201ENST00000299687 FBN2P35556 2912 aa6.45□□□□□ -1.38
ZNF407-201ENST00000299687 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.44□□□□□ -1.38
ZNF407-201ENST00000299687 PDZD2O15018 2839 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF407-201ENST00000299687 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF407-201ENST00000299687 VWFP04275 2813 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF407-201ENST00000299687 CUBNO60494 3623 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF407-201ENST00000299687 TGP01266 2768 aa6.37□□□□□ -1.39
ZNF407-201ENST00000299687 ZANQ9Y493 2812 aa6.35□□□□□ -1.39
ZNF407-201ENST00000299687 TENM4Q6N022 2769 aa6.34□□□□□ -1.39
ZNF407-201ENST00000299687 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF407-201ENST00000299687 VPS13CQ709C8 3753 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF407-201ENST00000299687 TENM2Q9NT68 2774 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP12-2P59991 146 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF407-201ENST00000299687 MUC3AQ02505 3323 aa6.22□□□□□ -1.41
ZNF407-201ENST00000299687 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.21□□□□□ -1.41
ZNF407-201ENST00000299687 COL7A1Q02388 2944 aa6.15□□□□□ -1.42
ZNF407-201ENST00000299687 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
ZNF407-201ENST00000299687 BSNQ9UPA5 3926 aa6.13□□□□□ -1.43
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.1□□□□□ -1.43
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.1□□□□□ -1.43
ZNF407-201ENST00000299687 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
ZNF407-201ENST00000299687 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF407-201ENST00000299687 AKAP9Q99996 3911 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF407-201ENST00000299687 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.94□□□□□ -1.46
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP12-1P59990 96 aa5.91□□□□□ -1.46
ZNF407-201ENST00000299687 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.87□□□□□ -1.47
ZNF407-201ENST00000299687 INE1O15225 51 aa5.87□□□□□ -1.47
ZNF407-201ENST00000299687 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5.85□□□□□ -1.47
ZNF407-201ENST00000299687 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
ZNF407-201ENST00000299687 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
ZNF407-201ENST00000299687 FBN3Q75N90 2809 aa5.71□□□□□ -1.5
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP10-12P60413 245 aa5.67□□□□□ -1.5
ZNF407-201ENST00000299687 OTOGQ6ZRI0 2925 aa5.64□□□□□ -1.51
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.52□□□□□ -1.53
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP12-3P60328 96 aa5.44□□□□□ -1.54
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP10-5P60370 271 aa5.44□□□□□ -1.54
ZNF407-201ENST00000299687 LYSTQ99698 3801 aa5.41□□□□□ -1.54
ZNF407-201ENST00000299687 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.4□□□□□ -1.55
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.33□□□□□ -1.56
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.32□□□□□ -1.56
ZNF407-201ENST00000299687 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.32□□□□□ -1.56
ZNF407-201ENST00000299687 LCE3AQ5TA76 89 aa5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.1 ms