RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299608.6

TMX3-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX3, Length 4,927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3-201ENST00000299608 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
TMX3-201ENST00000299608 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.25□□□□□ -1.41
TMX3-201ENST00000299608 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.24□□□□□ -1.41
TMX3-201ENST00000299608 Q5XG85 94 aa6.22□□□□□ -1.41
TMX3-201ENST00000299608 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
TMX3-201ENST00000299608 R4GN34 69 aa6.22□□□□□ -1.41
TMX3-201ENST00000299608 OXTP01178 125 aa6.19□□□□□ -1.42
TMX3-201ENST00000299608 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.18□□□□□ -1.42
TMX3-201ENST00000299608 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.17□□□□□ -1.42
TMX3-201ENST00000299608 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.16□□□□□ -1.42
TMX3-201ENST00000299608 VWFP04275 2813 aa6.16□□□□□ -1.42
TMX3-201ENST00000299608 Q1T7F1 81 aa6.16□□□□□ -1.42
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TMX3-201ENST00000299608 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.12□□□□□ -1.43
TMX3-201ENST00000299608 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.12□□□□□ -1.43
TMX3-201ENST00000299608 DMAC1Q96GE9 116 aa6.12□□□□□ -1.43
TMX3-201ENST00000299608 RELNP78509 3460 aa6.11□□□□□ -1.43
TMX3-201ENST00000299608 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
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TMX3-201ENST00000299608 Q75L30 129 aa6.09□□□□□ -1.44
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TMX3-201ENST00000299608 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.02□□□□□ -1.45
TMX3-201ENST00000299608 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.02□□□□□ -1.45
TMX3-201ENST00000299608 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
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TMX3-201ENST00000299608 Q5VV11 94 aa6.01□□□□□ -1.45
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TMX3-201ENST00000299608 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa5.98□□□□□ -1.45
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TMX3-201ENST00000299608 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.97□□□□□ -1.45
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TMX3-201ENST00000299608 PLAC4Q8WY50 150 aa5.95□□□□□ -1.46
TMX3-201ENST00000299608 LAMA5O15230 3695 aa5.93□□□□□ -1.46
TMX3-201ENST00000299608 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.92□□□□□ -1.46
TMX3-201ENST00000299608 OTOGQ6ZRI0 2925 aa5.9□□□□□ -1.46
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TMX3-201ENST00000299608 ASPMQ8IZT6 3477 aa5.86□□□□□ -1.47
TMX3-201ENST00000299608 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.86□□□□□ -1.47
TMX3-201ENST00000299608 ROMO1P60602 79 aa5.85□□□□□ -1.47
TMX3-201ENST00000299608 A8MU10 97 aa5.8□□□□□ -1.48
TMX3-201ENST00000299608 XP32Q5T750 250 aa5.77□□□□□ -1.49
TMX3-201ENST00000299608 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.77□□□□□ -1.49
TMX3-201ENST00000299608 H3BS24 57 aa5.75□□□□□ -1.49
TMX3-201ENST00000299608 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.74□□□□□ -1.49
TMX3-201ENST00000299608 A0A1B0GVY2 172 aa5.71□□□□□ -1.5
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TMX3-201ENST00000299608 A6NN06 94 aa5.64□□□□□ -1.51
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TMX3-201ENST00000299608 TNP1P09430 55 aa5.57□□□□□ -1.52
TMX3-201ENST00000299608 KRTAP10-10P60014 251 aa5.57□□□□□ -1.52
TMX3-201ENST00000299608 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.56□□□□□ -1.52
TMX3-201ENST00000299608 A0A0A0MQY5 61 aa5.55□□□□□ -1.52
TMX3-201ENST00000299608 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.55□□□□□ -1.52
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TMX3-201ENST00000299608 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.47□□□□□ -1.53
TMX3-201ENST00000299608 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.47□□□□□ -1.53
TMX3-201ENST00000299608 P0C880 135 aa5.43□□□□□ -1.54
TMX3-201ENST00000299608 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5.41□□□□□ -1.54
TMX3-201ENST00000299608 H0YAA0 97 aa5.37□□□□□ -1.55
TMX3-201ENST00000299608 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.37□□□□□ -1.55
TMX3-201ENST00000299608 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
TMX3-201ENST00000299608 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.32□□□□□ -1.56
TMX3-201ENST00000299608 NDUFAF8A1L188 74 aa5.29□□□□□ -1.56
TMX3-201ENST00000299608 PP632Q6XCG6 107 aa5.28□□□□□ -1.56
TMX3-201ENST00000299608 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
TMX3-201ENST00000299608 MT1HL1P0DM35 61 aa5.18□□□□□ -1.58
TMX3-201ENST00000299608 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.16□□□□□ -1.58
TMX3-201ENST00000299608 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.15□□□□□ -1.59
TMX3-201ENST00000299608 KRTAP12-2P59991 146 aa5.11□□□□□ -1.59
TMX3-201ENST00000299608 KRTAP12-1P59990 96 aa5.03□□□□□ -1.6
TMX3-201ENST00000299608 BSNQ9UPA5 3926 aa5.03□□□□□ -1.6
TMX3-201ENST00000299608 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
TMX3-201ENST00000299608 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.98□□□□□ -1.61
TMX3-201ENST00000299608 DNHD1Q96M86 4753 aa4.95□□□□□ -1.62
TMX3-201ENST00000299608 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
TMX3-201ENST00000299608 VPS13CQ709C8 3753 aa4.94□□□□□ -1.62
TMX3-201ENST00000299608 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TMX3-201ENST00000299608 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.91□□□□□ -1.62
TMX3-201ENST00000299608 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TMX3-201ENST00000299608 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.81□□□□□ -1.64
TMX3-201ENST00000299608 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.8□□□□□ -1.64
TMX3-201ENST00000299608 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.79□□□□□ -1.64
TMX3-201ENST00000299608 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.78□□□□□ -1.64
TMX3-201ENST00000299608 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TMX3-201ENST00000299608 DNAH9Q9NYC9 4486 aa4.72□□□□□ -1.65
TMX3-201ENST00000299608 KRTAP10-12P60413 245 aa4.69□□□□□ -1.66
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