RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 LCE6AA0A183 80 aa10.26□□□□□ -0.77
SCARB2-201ENST00000264896 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa10.25□□□□□ -0.77
SCARB2-201ENST00000264896 CSAG1Q6PB30 78 aa10.24□□□□□ -0.77
SCARB2-201ENST00000264896 PRAC1Q96KF2 57 aa10.24□□□□□ -0.77
SCARB2-201ENST00000264896 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa10.21□□□□□ -0.78
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa10.21□□□□□ -0.78
SCARB2-201ENST00000264896 S4R3F8 94 aa10.21□□□□□ -0.78
SCARB2-201ENST00000264896 MYO15AQ9UKN7 3530 aa10.16□□□□□ -0.78
SCARB2-201ENST00000264896 Q5VSD8 79 aa10.15□□□□□ -0.78
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SCARB2-201ENST00000264896 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa10.1□□□□□ -0.79
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SCARB2-201ENST00000264896 M0R2T5 61 aa9.9□□□□□ -0.83
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SCARB2-201ENST00000264896 OTOGQ6ZRI0 2925 aa9.41□□□□□ -0.9
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SCARB2-201ENST00000264896 H0YAA0 97 aa9.25□□□□□ -0.93
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SCARB2-201ENST00000264896 FBN3Q75N90 2809 aa9.1□□□□□ -0.95
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SCARB2-201ENST00000264896 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
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SCARB2-201ENST00000264896 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
SCARB2-201ENST00000264896 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.88□□□□□ -0.99
SCARB2-201ENST00000264896 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.87□□□□□ -0.99
SCARB2-201ENST00000264896 COL7A1Q02388 2944 aa8.83□□□□□ -1
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.76□□□□□ -1.01
SCARB2-201ENST00000264896 BSNQ9UPA5 3926 aa8.73□□□□□ -1.01
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP10-10P60014 251 aa8.65□□□□□ -1.02
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP12-2P59991 146 aa8.64□□□□□ -1.03
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP12-1P59990 96 aa8.56□□□□□ -1.04
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SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.44□□□□□ -1.06
SCARB2-201ENST00000264896 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.42□□□□□ -1.06
SCARB2-201ENST00000264896 VPS13CQ709C8 3753 aa8.41□□□□□ -1.06
SCARB2-201ENST00000264896 MT1HL1P0DM35 61 aa8.33□□□□□ -1.08
SCARB2-201ENST00000264896 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.24□□□□□ -1.09
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.23□□□□□ -1.09
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
SCARB2-201ENST00000264896 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.08□□□□□ -1.12
SCARB2-201ENST00000264896 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.99□□□□□ -1.13
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.95□□□□□ -1.14
SCARB2-201ENST00000264896 AKAP9Q99996 3911 aa7.91□□□□□ -1.14
SCARB2-201ENST00000264896 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.9□□□□□ -1.14
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.86□□□□□ -1.15
SCARB2-201ENST00000264896 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
SCARB2-201ENST00000264896 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.81□□□□□ -1.16
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