RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264318.3

GABRA4-201, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha4 subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GABRA4, Length 11,973 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4-201ENST00000264318 TENM2Q9NT68 2774 aa5.34□□□□□ -1.55
GABRA4-201ENST00000264318 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa5.34□□□□□ -1.55
GABRA4-201ENST00000264318 ATMQ13315 3056 aa5.33□□□□□ -1.56
GABRA4-201ENST00000264318 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.32□□□□□ -1.56
GABRA4-201ENST00000264318 DMXL1Q9Y485 3027 aa5.31□□□□□ -1.56
GABRA4-201ENST00000264318 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.31□□□□□ -1.56
GABRA4-201ENST00000264318 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.31□□□□□ -1.56
GABRA4-201ENST00000264318 LAMA1P25391 3075 aa5.31□□□□□ -1.56
GABRA4-201ENST00000264318 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
GABRA4-201ENST00000264318 TPRXLQ17RH7 258 aa5.26□□□□□ -1.57
GABRA4-201ENST00000264318 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.26□□□□□ -1.57
GABRA4-201ENST00000264318 KRTAP10-3P60369 221 aa5.25□□□□□ -1.57
GABRA4-201ENST00000264318 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.23□□□□□ -1.57
GABRA4-201ENST00000264318 FREM2Q5SZK8 3169 aa5.21□□□□□ -1.58
GABRA4-201ENST00000264318 TNP1P09430 55 aa5.18□□□□□ -1.58
GABRA4-201ENST00000264318 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.17□□□□□ -1.58
GABRA4-201ENST00000264318 INE1O15225 51 aa5.16□□□□□ -1.58
GABRA4-201ENST00000264318 HTTP42858 3142 aa5.15□□□□□ -1.58
GABRA4-201ENST00000264318 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa5.11□□□□□ -1.59
GABRA4-201ENST00000264318 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.11□□□□□ -1.59
GABRA4-201ENST00000264318 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.11□□□□□ -1.59
GABRA4-201ENST00000264318 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.09□□□□□ -1.59
GABRA4-201ENST00000264318 COL7A1Q02388 2944 aa5.08□□□□□ -1.6
GABRA4-201ENST00000264318 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.08□□□□□ -1.6
GABRA4-201ENST00000264318 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.08□□□□□ -1.6
GABRA4-201ENST00000264318 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.08□□□□□ -1.6
GABRA4-201ENST00000264318 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
GABRA4-201ENST00000264318 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
GABRA4-201ENST00000264318 KRTAP10-8P60410 259 aa5.05□□□□□ -1.6
GABRA4-201ENST00000264318 OTOGQ6ZRI0 2925 aa5.05□□□□□ -1.6
GABRA4-201ENST00000264318 FBN3Q75N90 2809 aa5.03□□□□□ -1.6
GABRA4-201ENST00000264318 WDFY4Q6ZS81 3184 aa5.01□□□□□ -1.61
GABRA4-201ENST00000264318 KRTAP12-2P59991 146 aa5□□□□□ -1.61
GABRA4-201ENST00000264318 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa4.98□□□□□ -1.61
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GABRA4-201ENST00000264318 UTRNP46939 3433 aa4.97□□□□□ -1.61
GABRA4-201ENST00000264318 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
GABRA4-201ENST00000264318 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa4.94□□□□□ -1.62
GABRA4-201ENST00000264318 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
GABRA4-201ENST00000264318 XP32Q5T750 250 aa4.93□□□□□ -1.62
GABRA4-201ENST00000264318 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.93□□□□□ -1.62
GABRA4-201ENST00000264318 KRTAP12-1P59990 96 aa4.91□□□□□ -1.62
GABRA4-201ENST00000264318 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.9□□□□□ -1.62
GABRA4-201ENST00000264318 KRTAP10-1P60331 282 aa4.88□□□□□ -1.63
GABRA4-201ENST00000264318 Q5VSD8 79 aa4.88□□□□□ -1.63
GABRA4-201ENST00000264318 XIRP2A4UGR9 3374 aa4.87□□□□□ -1.63
GABRA4-201ENST00000264318 AKAP9Q99996 3911 aa4.84□□□□□ -1.63
GABRA4-201ENST00000264318 KRTAP10-2P60368 255 aa4.81□□□□□ -1.64
GABRA4-201ENST00000264318 COL6A3P12111 3177 aa4.8□□□□□ -1.64
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GABRA4-201ENST00000264318 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
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GABRA4-201ENST00000264318 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.73□□□□□ -1.65
GABRA4-201ENST00000264318 M0R2T5 61 aa4.72□□□□□ -1.65
GABRA4-201ENST00000264318 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
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GABRA4-201ENST00000264318 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.59□□□□□ -1.68
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GABRA4-201ENST00000264318 BSNQ9UPA5 3926 aa4.55□□□□□ -1.68
GABRA4-201ENST00000264318 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa4.52□□□□□ -1.69
GABRA4-201ENST00000264318 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
GABRA4-201ENST00000264318 LYSTQ99698 3801 aa4.51□□□□□ -1.69
GABRA4-201ENST00000264318 USP34Q70CQ2 3546 aa4.49□□□□□ -1.69
GABRA4-201ENST00000264318 CMYA5Q8N3K9 4069 aa4.49□□□□□ -1.69
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GABRA4-201ENST00000264318 DMDP11532 3685 aa4.47□□□□□ -1.69
GABRA4-201ENST00000264318 UNC80Q8N2C7 3258 aa4.47□□□□□ -1.69
GABRA4-201ENST00000264318 VPS13CQ709C8 3753 aa4.44□□□□□ -1.7
GABRA4-201ENST00000264318 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.42□□□□□ -1.7
GABRA4-201ENST00000264318 MYO15AQ9UKN7 3530 aa4.41□□□□□ -1.7
GABRA4-201ENST00000264318 ZFHX4Q86UP3 3567 aa4.41□□□□□ -1.7
GABRA4-201ENST00000264318 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.39□□□□□ -1.71
GABRA4-201ENST00000264318 VCANP13611 3396 aa4.39□□□□□ -1.71
GABRA4-201ENST00000264318 SZT2Q5T011 3432 aa4.34□□□□□ -1.71
GABRA4-201ENST00000264318 CDH23Q9H251 3354 aa4.33□□□□□ -1.72
GABRA4-201ENST00000264318 ANK2Q01484 3957 aa4.32□□□□□ -1.72
GABRA4-201ENST00000264318 LAMA3Q16787 3333 aa4.31□□□□□ -1.72
GABRA4-201ENST00000264318 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa4.29□□□□□ -1.72
GABRA4-201ENST00000264318 BRCA2P51587 3418 aa4.29□□□□□ -1.72
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GABRA4-201ENST00000264318 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa4.24□□□□□ -1.73
GABRA4-201ENST00000264318 SPEGQ15772 3267 aa4.24□□□□□ -1.73
GABRA4-201ENST00000264318 EYSQ5T1H1 3165 aa4.24□□□□□ -1.73
GABRA4-201ENST00000264318 DCHS1Q96JQ0 3298 aa4.23□□□□□ -1.73
GABRA4-201ENST00000264318 DNAH7Q8WXX0 4024 aa4.22□□□□□ -1.73
GABRA4-201ENST00000264318 LOC400499M0QZD8 3231 aa4.17□□□□□ -1.74
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GABRA4-201ENST00000264318 A0A1B0GVY2 172 aa4.14□□□□□ -1.75
GABRA4-201ENST00000264318 KRTAP12-3P60328 96 aa4.13□□□□□ -1.75
GABRA4-201ENST00000264318 KRTAP10-12P60413 245 aa4.11□□□□□ -1.75
GABRA4-201ENST00000264318 KRTAP10-10P60014 251 aa4.1□□□□□ -1.75
GABRA4-201ENST00000264318 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.05□□□□□ -1.76
GABRA4-201ENST00000264318 LCE3AQ5TA76 89 aa4.01□□□□□ -1.77
GABRA4-201ENST00000264318 RELNP78509 3460 aa4□□□□□ -1.77
GABRA4-201ENST00000264318 ASPMQ8IZT6 3477 aa3.99□□□□□ -1.77
GABRA4-201ENST00000264318 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.98□□□□□ -1.77
GABRA4-201ENST00000264318 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.96□□□□□ -1.78
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