RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262124.15

SEH1L-201, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEH1L, Length 3,494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-201ENST00000262124 A0A1B0GVX0 72 aa7.13□□□□□ -1.27
SEH1L-201ENST00000262124 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.12□□□□□ -1.27
SEH1L-201ENST00000262124 NDUFC1O43677 76 aa7.12□□□□□ -1.27
SEH1L-201ENST00000262124 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.1□□□□□ -1.27
SEH1L-201ENST00000262124 Q6ZSA8 131 aa7.1□□□□□ -1.27
SEH1L-201ENST00000262124 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.1□□□□□ -1.27
SEH1L-201ENST00000262124 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.09□□□□□ -1.27
SEH1L-201ENST00000262124 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.09□□□□□ -1.27
SEH1L-201ENST00000262124 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SEH1L-201ENST00000262124 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SEH1L-201ENST00000262124 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SEH1L-201ENST00000262124 LCE6AA0A183 80 aa7.05□□□□□ -1.28
SEH1L-201ENST00000262124 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.05□□□□□ -1.28
SEH1L-201ENST00000262124 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.04□□□□□ -1.28
SEH1L-201ENST00000262124 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.04□□□□□ -1.28
SEH1L-201ENST00000262124 Q5W150 140 aa7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-201ENST00000262124 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-201ENST00000262124 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-201ENST00000262124 C1orf195Q5TG92 126 aa7.02□□□□□ -1.29
SEH1L-201ENST00000262124 Q5XG85 94 aa7.02□□□□□ -1.29
SEH1L-201ENST00000262124 LINC00313P59037 77 aa7.02□□□□□ -1.29
SEH1L-201ENST00000262124 PSPHP1O15172 72 aa7.01□□□□□ -1.29
SEH1L-201ENST00000262124 C9orf92A6NGG3 77 aa6.99□□□□□ -1.29
SEH1L-201ENST00000262124 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.98□□□□□ -1.29
SEH1L-201ENST00000262124 CD164Q04900 197 aa6.97□□□□□ -1.29
SEH1L-201ENST00000262124 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SEH1L-201ENST00000262124 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.96□□□□□ -1.29
SEH1L-201ENST00000262124 IGKV2-30P06310 120 aa6.96□□□□□ -1.29
SEH1L-201ENST00000262124 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SEH1L-201ENST00000262124 RYR2Q92736 4967 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-201ENST00000262124 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-201ENST00000262124 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-201ENST00000262124 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-201ENST00000262124 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-201ENST00000262124 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-201ENST00000262124 RYR3Q15413 4870 aa6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-201ENST00000262124 BRK1Q8WUW1 75 aa6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-201ENST00000262124 LIMD2Q9BT23 127 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-201ENST00000262124 MYCBP2O75592 4640 aa6.89□□□□□ -1.31
SEH1L-201ENST00000262124 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.89□□□□□ -1.31
SEH1L-201ENST00000262124 A0A1B0GVY2 172 aa6.89□□□□□ -1.31
SEH1L-201ENST00000262124 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.88□□□□□ -1.31
SEH1L-201ENST00000262124 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.88□□□□□ -1.31
SEH1L-201ENST00000262124 COA5Q86WW8 74 aa6.87□□□□□ -1.31
SEH1L-201ENST00000262124 A8MUN3 132 aa6.86□□□□□ -1.31
SEH1L-201ENST00000262124 SPINK1P00995 79 aa6.86□□□□□ -1.31
SEH1L-201ENST00000262124 H3BPC8 53 aa6.85□□□□□ -1.31
SEH1L-201ENST00000262124 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.84□□□□□ -1.32
SEH1L-201ENST00000262124 C8orf87E5RJ46 101 aa6.83□□□□□ -1.32
SEH1L-201ENST00000262124 HRES1P13985 223 aa6.82□□□□□ -1.32
SEH1L-201ENST00000262124 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-201ENST00000262124 FAM229AH3BQW9 127 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-201ENST00000262124 PRR15LQ9BU68 103 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-201ENST00000262124 Q5VSD8 79 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-201ENST00000262124 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-201ENST00000262124 Q8N1X5 172 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-201ENST00000262124 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-201ENST00000262124 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-201ENST00000262124 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-201ENST00000262124 A8MU10 97 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-201ENST00000262124 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-201ENST00000262124 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SEH1L-201ENST00000262124 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.74□□□□□ -1.33
SEH1L-201ENST00000262124 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SEH1L-201ENST00000262124 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.73□□□□□ -1.33
SEH1L-201ENST00000262124 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.73□□□□□ -1.33
SEH1L-201ENST00000262124 HSPG2P98160 4391 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-201ENST00000262124 RYR1P21817 5038 aa6.69□□□□□ -1.34
SEH1L-201ENST00000262124 A6NED7 52 aa6.68□□□□□ -1.34
SEH1L-201ENST00000262124 Q1T7F1 81 aa6.68□□□□□ -1.34
SEH1L-201ENST00000262124 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.68□□□□□ -1.34
SEH1L-201ENST00000262124 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.68□□□□□ -1.34
SEH1L-201ENST00000262124 ACYP2P14621 99 aa6.67□□□□□ -1.34
SEH1L-201ENST00000262124 Q5VV11 94 aa6.66□□□□□ -1.34
SEH1L-201ENST00000262124 PRO0628Q9UI54 55 aa6.61□□□□□ -1.35
SEH1L-201ENST00000262124 V9GYY9 64 aa6.6□□□□□ -1.35
SEH1L-201ENST00000262124 SPINK7P58062 85 aa6.59□□□□□ -1.35
SEH1L-201ENST00000262124 DMAC1Q96GE9 116 aa6.59□□□□□ -1.36
SEH1L-201ENST00000262124 SVIPQ8NHG7 77 aa6.57□□□□□ -1.36
SEH1L-201ENST00000262124 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.56□□□□□ -1.36
SEH1L-201ENST00000262124 A0A1B0GU69 56 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-201ENST00000262124 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-201ENST00000262124 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-201ENST00000262124 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.52□□□□□ -1.36
SEH1L-201ENST00000262124 TNXBP22105 4242 aa6.52□□□□□ -1.37
SEH1L-201ENST00000262124 KRTAP10-8P60410 259 aa6.52□□□□□ -1.37
SEH1L-201ENST00000262124 LCA10Q71F78 164 aa6.51□□□□□ -1.37
SEH1L-201ENST00000262124 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.51□□□□□ -1.37
SEH1L-201ENST00000262124 LRP2P98164 4655 aa6.5□□□□□ -1.37
SEH1L-201ENST00000262124 A8MUU9 505 aa6.5□□□□□ -1.37
SEH1L-201ENST00000262124 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.5□□□□□ -1.37
SEH1L-201ENST00000262124 LPAP08519 4548 aa6.49□□□□□ -1.37
SEH1L-201ENST00000262124 PMAIP1Q13794 54 aa6.49□□□□□ -1.37
SEH1L-201ENST00000262124 Q75L30 129 aa6.46□□□□□ -1.38
SEH1L-201ENST00000262124 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.44□□□□□ -1.38
SEH1L-201ENST00000262124 MT1HL1P0DM35 61 aa6.43□□□□□ -1.38
SEH1L-201ENST00000262124 XP32Q5T750 250 aa6.43□□□□□ -1.38
SEH1L-201ENST00000262124 SEC61GP60059 68 aa6.38□□□□□ -1.39
SEH1L-201ENST00000262124 J3QL48 77 aa6.36□□□□□ -1.39
SEH1L-201ENST00000262124 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.35□□□□□ -1.39
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