RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 VPS25Q9BRG1 176 aa10.89□□□□□ -0.67
CITED1-201ENST00000246139 SPCS1Q9Y6A9 102 aa10.89□□□□□ -0.67
CITED1-201ENST00000246139 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa10.88□□□□□ -0.67
CITED1-201ENST00000246139 DEFB116Q30KQ4 102 aa10.88□□□□□ -0.67
CITED1-201ENST00000246139 LINC00313P59037 77 aa10.87□□□□□ -0.67
CITED1-201ENST00000246139 LINC00472Q9H8W2 130 aa10.87□□□□□ -0.67
CITED1-201ENST00000246139 H3BT86 120 aa10.83□□□□□ -0.68
CITED1-201ENST00000246139 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa10.83□□□□□ -0.68
CITED1-201ENST00000246139 PDE6GP18545 87 aa10.82□□□□□ -0.68
CITED1-201ENST00000246139 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa10.82□□□□□ -0.68
CITED1-201ENST00000246139 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa10.8□□□□□ -0.68
CITED1-201ENST00000246139 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa10.8□□□□□ -0.68
CITED1-201ENST00000246139 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa10.79□□□□□ -0.68
CITED1-201ENST00000246139 K7EP34 96 aa10.76□□□□□ -0.69
CITED1-201ENST00000246139 A0A1B0GW54 56 aa10.73□□□□□ -0.69
CITED1-201ENST00000246139 Q6ZQT0 140 aa10.73□□□□□ -0.69
CITED1-201ENST00000246139 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa10.72□□□□□ -0.69
CITED1-201ENST00000246139 A0A1B0GVX0 72 aa10.72□□□□□ -0.69
CITED1-201ENST00000246139 C8orf87E5RJ46 101 aa10.71□□□□□ -0.69
CITED1-201ENST00000246139 J3KT08 172 aa10.71□□□□□ -0.69
CITED1-201ENST00000246139 MTURNQ8N3F0 131 aa10.7□□□□□ -0.7
CITED1-201ENST00000246139 C14orf132Q9NPU4 83 aa10.68□□□□□ -0.7
CITED1-201ENST00000246139 F8W1H4 67 aa10.65□□□□□ -0.7
CITED1-201ENST00000246139 NDUFB1O75438 58 aa10.62□□□□□ -0.71
CITED1-201ENST00000246139 USH2AO75445 5202 aa10.61□□□□□ -0.71
CITED1-201ENST00000246139 SSPOA2VEC9 5147 aa10.6□□□□□ -0.71
CITED1-201ENST00000246139 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa10.59□□□□□ -0.71
CITED1-201ENST00000246139 FAM236CP0DP71 79 aa10.59□□□□□ -0.71
CITED1-201ENST00000246139 PRO0461Q9UI25 63 aa10.57□□□□□ -0.72
CITED1-201ENST00000246139 A8MWP4 228 aa10.56□□□□□ -0.72
CITED1-201ENST00000246139 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
CITED1-201ENST00000246139 HRES1P13985 223 aa10.54□□□□□ -0.72
CITED1-201ENST00000246139 NREPQ16612 68 aa10.54□□□□□ -0.72
CITED1-201ENST00000246139 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa10.54□□□□□ -0.72
CITED1-201ENST00000246139 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CITED1-201ENST00000246139 C8orf17Q9NRJ1 99 aa10.53□□□□□ -0.72
CITED1-201ENST00000246139 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa10.52□□□□□ -0.73
CITED1-201ENST00000246139 MPLKIPQ8TAP9 179 aa10.51□□□□□ -0.73
CITED1-201ENST00000246139 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CITED1-201ENST00000246139 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CITED1-201ENST00000246139 ETDBQ3ZM63 59 aa10.46□□□□□ -0.73
CITED1-201ENST00000246139 PRR15Q8IV56 129 aa10.46□□□□□ -0.73
CITED1-201ENST00000246139 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa10.46□□□□□ -0.73
CITED1-201ENST00000246139 Q6ZVQ6 151 aa10.45□□□□□ -0.74
CITED1-201ENST00000246139 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa10.44□□□□□ -0.74
CITED1-201ENST00000246139 SPINK7P58062 85 aa10.44□□□□□ -0.74
CITED1-201ENST00000246139 UBL5Q9BZL1 73 aa10.43□□□□□ -0.74
CITED1-201ENST00000246139 A0A1B0GV90 55 aa10.4□□□□□ -0.74
CITED1-201ENST00000246139 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa10.38□□□□□ -0.75
CITED1-201ENST00000246139 BPY2O14599 106 aa10.38□□□□□ -0.75
CITED1-201ENST00000246139 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
CITED1-201ENST00000246139 K7EQZ3 153 aa10.36□□□□□ -0.75
CITED1-201ENST00000246139 TMEM254Q8TBM7 123 aa10.36□□□□□ -0.75
CITED1-201ENST00000246139 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
CITED1-201ENST00000246139 ACYP1P07311 99 aa10.33□□□□□ -0.76
CITED1-201ENST00000246139 hDV103S1A0JD37 113 aa10.32□□□□□ -0.76
CITED1-201ENST00000246139 MT2AP02795 61 aa10.3□□□□□ -0.76
CITED1-201ENST00000246139 LINC00846Q9NV44 126 aa10.3□□□□□ -0.76
CITED1-201ENST00000246139 NDUFS5O43920 106 aa10.29□□□□□ -0.76
CITED1-201ENST00000246139 WFDC13Q8IUB5 93 aa10.28□□□□□ -0.76
CITED1-201ENST00000246139 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa10.25□□□□□ -0.77
CITED1-201ENST00000246139 J3QR89 54 aa10.24□□□□□ -0.77
CITED1-201ENST00000246139 KRTAP10-10P60014 251 aa10.23□□□□□ -0.77
CITED1-201ENST00000246139 MT1FP04733 61 aa10.22□□□□□ -0.77
CITED1-201ENST00000246139 Q8N9L7 120 aa10.22□□□□□ -0.77
CITED1-201ENST00000246139 LCE2BO14633 110 aa10.21□□□□□ -0.77
CITED1-201ENST00000246139 CXCL6P80162 114 aa10.19□□□□□ -0.78
CITED1-201ENST00000246139 CASC2Q6XLA1 102 aa10.18□□□□□ -0.78
CITED1-201ENST00000246139 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa10.18□□□□□ -0.78
CITED1-201ENST00000246139 Q5W150 140 aa10.15□□□□□ -0.78
CITED1-201ENST00000246139 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa10.14□□□□□ -0.79
CITED1-201ENST00000246139 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa10.14□□□□□ -0.79
CITED1-201ENST00000246139 HCG22E2RYF7 251 aa10.13□□□□□ -0.79
CITED1-201ENST00000246139 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa10.12□□□□□ -0.79
CITED1-201ENST00000246139 IGKV2-30P06310 120 aa10.12□□□□□ -0.79
CITED1-201ENST00000246139 C7orf65Q6ZTY9 151 aa10.09□□□□□ -0.79
CITED1-201ENST00000246139 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa10.06□□□□□ -0.8
CITED1-201ENST00000246139 LINC00643Q86TS7 51 aa10.06□□□□□ -0.8
CITED1-201ENST00000246139 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CITED1-201ENST00000246139 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CITED1-201ENST00000246139 K7ERU9 68 aa9.99□□□□□ -0.81
CITED1-201ENST00000246139 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CITED1-201ENST00000246139 C4orf26Q17RF5 130 aa9.94□□□□□ -0.82
CITED1-201ENST00000246139 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa9.94□□□□□ -0.82
CITED1-201ENST00000246139 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa9.86□□□□□ -0.83
CITED1-201ENST00000246139 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa9.78□□□□□ -0.84
CITED1-201ENST00000246139 C1orf64Q8NEQ6 169 aa9.77□□□□□ -0.85
CITED1-201ENST00000246139 A0A087WVE0 104 aa9.75□□□□□ -0.85
CITED1-201ENST00000246139 IMUPQ9GZP8 106 aa9.75□□□□□ -0.85
CITED1-201ENST00000246139 UQCRQO14949 82 aa9.74□□□□□ -0.85
CITED1-201ENST00000246139 C5orf47Q569G3 176 aa9.74□□□□□ -0.85
CITED1-201ENST00000246139 SCGB1A1P11684 91 aa9.73□□□□□ -0.85
CITED1-201ENST00000246139 S4R3F8 94 aa9.72□□□□□ -0.85
CITED1-201ENST00000246139 TRAV22A0A0B4J277 110 aa9.71□□□□□ -0.86
CITED1-201ENST00000246139 ATOX1O00244 68 aa9.7□□□□□ -0.86
CITED1-201ENST00000246139 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa9.67□□□□□ -0.86
CITED1-201ENST00000246139 LCA10Q71F78 164 aa9.65□□□□□ -0.86
CITED1-201ENST00000246139 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa9.64□□□□□ -0.87
CITED1-201ENST00000246139 CSAG1Q6PB30 78 aa9.64□□□□□ -0.87
CITED1-201ENST00000246139 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 834.7 ms