RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246024.6

TMX4-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX4, Length 6,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4-201ENST00000246024 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
TMX4-201ENST00000246024 DMXL1Q9Y485 3027 aa7.81□□□□□ -1.16
TMX4-201ENST00000246024 HIVEP1P15822 2718 aa7.8□□□□□ -1.16
TMX4-201ENST00000246024 ZZEF1O43149 2961 aa7.79□□□□□ -1.16
TMX4-201ENST00000246024 A8MUU9 505 aa7.78□□□□□ -1.16
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.77□□□□□ -1.17
TMX4-201ENST00000246024 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.77□□□□□ -1.17
TMX4-201ENST00000246024 A8MU10 97 aa7.7□□□□□ -1.18
TMX4-201ENST00000246024 TENM4Q6N022 2769 aa7.7□□□□□ -1.18
TMX4-201ENST00000246024 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
TMX4-201ENST00000246024 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.69□□□□□ -1.18
TMX4-201ENST00000246024 LOC400499M0QZD8 3231 aa7.67□□□□□ -1.18
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.67□□□□□ -1.18
TMX4-201ENST00000246024 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.65□□□□□ -1.18
TMX4-201ENST00000246024 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa7.64□□□□□ -1.19
TMX4-201ENST00000246024 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
TMX4-201ENST00000246024 APCP25054 2843 aa7.61□□□□□ -1.19
TMX4-201ENST00000246024 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.61□□□□□ -1.19
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
TMX4-201ENST00000246024 TNP1P09430 55 aa7.6□□□□□ -1.19
TMX4-201ENST00000246024 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.58□□□□□ -1.2
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.55□□□□□ -1.2
TMX4-201ENST00000246024 RELNP78509 3460 aa7.55□□□□□ -1.2
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.55□□□□□ -1.2
TMX4-201ENST00000246024 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.54□□□□□ -1.2
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.53□□□□□ -1.2
TMX4-201ENST00000246024 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
TMX4-201ENST00000246024 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.52□□□□□ -1.2
TMX4-201ENST00000246024 NDUFAF8A1L188 74 aa7.51□□□□□ -1.21
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP10-8P60410 259 aa7.49□□□□□ -1.21
TMX4-201ENST00000246024 ZANQ9Y493 2812 aa7.47□□□□□ -1.21
TMX4-201ENST00000246024 A0A1B0GVY2 172 aa7.46□□□□□ -1.22
TMX4-201ENST00000246024 LAMA5O15230 3695 aa7.45□□□□□ -1.22
TMX4-201ENST00000246024 DCHS1Q96JQ0 3298 aa7.44□□□□□ -1.22
TMX4-201ENST00000246024 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.41□□□□□ -1.22
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.4□□□□□ -1.22
TMX4-201ENST00000246024 ZFHX4Q86UP3 3567 aa7.4□□□□□ -1.22
TMX4-201ENST00000246024 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.4□□□□□ -1.22
TMX4-201ENST00000246024 FBN2P35556 2912 aa7.37□□□□□ -1.23
TMX4-201ENST00000246024 NF1P21359 2839 aa7.35□□□□□ -1.23
TMX4-201ENST00000246024 A6NN06 94 aa7.34□□□□□ -1.24
TMX4-201ENST00000246024 TENM2Q9NT68 2774 aa7.32□□□□□ -1.24
TMX4-201ENST00000246024 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TMX4-201ENST00000246024 DMDP11532 3685 aa7.3□□□□□ -1.24
TMX4-201ENST00000246024 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.29□□□□□ -1.24
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.29□□□□□ -1.24
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP10-10P60014 251 aa7.27□□□□□ -1.24
TMX4-201ENST00000246024 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.25□□□□□ -1.25
TMX4-201ENST00000246024 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.23□□□□□ -1.25
TMX4-201ENST00000246024 PP632Q6XCG6 107 aa7.19□□□□□ -1.26
TMX4-201ENST00000246024 ZFHX3Q15911 3703 aa7.19□□□□□ -1.26
TMX4-201ENST00000246024 XP32Q5T750 250 aa7.19□□□□□ -1.26
TMX4-201ENST00000246024 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.17□□□□□ -1.26
TMX4-201ENST00000246024 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.16□□□□□ -1.26
TMX4-201ENST00000246024 VWFP04275 2813 aa7.16□□□□□ -1.26
TMX4-201ENST00000246024 MUC3AQ02505 3323 aa7.15□□□□□ -1.27
TMX4-201ENST00000246024 TENM3Q9P273 2699 aa7.15□□□□□ -1.27
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.12□□□□□ -1.27
TMX4-201ENST00000246024 P0C880 135 aa7.1□□□□□ -1.27
TMX4-201ENST00000246024 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
TMX4-201ENST00000246024 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.02□□□□□ -1.29
TMX4-201ENST00000246024 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.02□□□□□ -1.29
TMX4-201ENST00000246024 CUBNO60494 3623 aa7.01□□□□□ -1.29
TMX4-201ENST00000246024 TPRXLQ17RH7 258 aa7.01□□□□□ -1.29
TMX4-201ENST00000246024 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.99□□□□□ -1.29
TMX4-201ENST00000246024 H0YAA0 97 aa6.94□□□□□ -1.3
TMX4-201ENST00000246024 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
TMX4-201ENST00000246024 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
TMX4-201ENST00000246024 PDZD2O15018 2839 aa6.86□□□□□ -1.31
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.85□□□□□ -1.31
TMX4-201ENST00000246024 TGP01266 2768 aa6.8□□□□□ -1.32
TMX4-201ENST00000246024 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
TMX4-201ENST00000246024 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.74□□□□□ -1.33
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP12-2P59991 146 aa6.68□□□□□ -1.34
TMX4-201ENST00000246024 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TMX4-201ENST00000246024 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.65□□□□□ -1.35
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.56□□□□□ -1.36
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.54□□□□□ -1.36
TMX4-201ENST00000246024 BSNQ9UPA5 3926 aa6.5□□□□□ -1.37
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.49□□□□□ -1.37
TMX4-201ENST00000246024 FBN3Q75N90 2809 aa6.47□□□□□ -1.37
TMX4-201ENST00000246024 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.47□□□□□ -1.37
TMX4-201ENST00000246024 COL7A1Q02388 2944 aa6.44□□□□□ -1.38
TMX4-201ENST00000246024 VPS13CQ709C8 3753 aa6.42□□□□□ -1.38
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP12-1P59990 96 aa6.42□□□□□ -1.38
TMX4-201ENST00000246024 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.35□□□□□ -1.39
TMX4-201ENST00000246024 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.32□□□□□ -1.4
TMX4-201ENST00000246024 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.27□□□□□ -1.41
TMX4-201ENST00000246024 MT1HL1P0DM35 61 aa6.26□□□□□ -1.41
TMX4-201ENST00000246024 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP10-12P60413 245 aa6.13□□□□□ -1.43
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TMX4-201ENST00000246024 AKAP9Q99996 3911 aa6.02□□□□□ -1.45
TMX4-201ENST00000246024 INE1O15225 51 aa5.99□□□□□ -1.45
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
TMX4-201ENST00000246024 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.96□□□□□ -1.46
TMX4-201ENST00000246024 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.92□□□□□ -1.46
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP12-3P60328 96 aa5.92□□□□□ -1.46
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