RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617928.4

CYFIP1-208, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYFIP1, Length 6,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-208ENST00000617928 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CYFIP1-208ENST00000617928 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CYFIP1-208ENST00000617928 FREM2Q5SZK8 3169 aa5.38□□□□□ -1.55
CYFIP1-208ENST00000617928 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CYFIP1-208ENST00000617928 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CYFIP1-208ENST00000617928 CFAP54Q96N23 3096 aa5.37□□□□□ -1.55
CYFIP1-208ENST00000617928 OCR1Q9BZK8 76 aa5.37□□□□□ -1.55
CYFIP1-208ENST00000617928 CDH23Q9H251 3354 aa5.36□□□□□ -1.55
CYFIP1-208ENST00000617928 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.36□□□□□ -1.55
CYFIP1-208ENST00000617928 R4GN34 69 aa5.35□□□□□ -1.55
CYFIP1-208ENST00000617928 CR1P17927 2039 aa5.35□□□□□ -1.55
CYFIP1-208ENST00000617928 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
CYFIP1-208ENST00000617928 SPINK7P58062 85 aa5.34□□□□□ -1.55
CYFIP1-208ENST00000617928 DNAH14Q0VDD8 3507 aa5.34□□□□□ -1.55
CYFIP1-208ENST00000617928 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa5.34□□□□□ -1.55
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.34□□□□□ -1.56
CYFIP1-208ENST00000617928 BPTFQ12830 3046 aa5.33□□□□□ -1.56
CYFIP1-208ENST00000617928 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CYFIP1-208ENST00000617928 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.31□□□□□ -1.56
CYFIP1-208ENST00000617928 LCE6AA0A183 80 aa5.3□□□□□ -1.56
CYFIP1-208ENST00000617928 MGAM2Q2M2H8 2515 aa5.29□□□□□ -1.56
CYFIP1-208ENST00000617928 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
CYFIP1-208ENST00000617928 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
CYFIP1-208ENST00000617928 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.27□□□□□ -1.57
CYFIP1-208ENST00000617928 KRTAP10-1P60331 282 aa5.27□□□□□ -1.57
CYFIP1-208ENST00000617928 Q5W150 140 aa5.27□□□□□ -1.57
CYFIP1-208ENST00000617928 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CYFIP1-208ENST00000617928 KRTAP10-2P60368 255 aa5.26□□□□□ -1.57
CYFIP1-208ENST00000617928 ATRQ13535 2644 aa5.25□□□□□ -1.57
CYFIP1-208ENST00000617928 IGSF10Q6WRI0 2623 aa5.25□□□□□ -1.57
CYFIP1-208ENST00000617928 M0QZ58 72 aa5.25□□□□□ -1.57
CYFIP1-208ENST00000617928 SZT2Q5T011 3432 aa5.24□□□□□ -1.57
CYFIP1-208ENST00000617928 CHD6Q8TD26 2715 aa5.24□□□□□ -1.57
CYFIP1-208ENST00000617928 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.22□□□□□ -1.57
CYFIP1-208ENST00000617928 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.22□□□□□ -1.57
CYFIP1-208ENST00000617928 ITPR3Q14573 2671 aa5.21□□□□□ -1.57
CYFIP1-208ENST00000617928 USP34Q70CQ2 3546 aa5.21□□□□□ -1.58
CYFIP1-208ENST00000617928 UNC80Q8N2C7 3258 aa5.21□□□□□ -1.58
CYFIP1-208ENST00000617928 NDUFAF8A1L188 74 aa5.2□□□□□ -1.58
CYFIP1-208ENST00000617928 REV3LO60673 3130 aa5.2□□□□□ -1.58
CYFIP1-208ENST00000617928 VPS13AQ96RL7 3174 aa5.2□□□□□ -1.58
CYFIP1-208ENST00000617928 TRIOO75962 3097 aa5.19□□□□□ -1.58
CYFIP1-208ENST00000617928 Q8NDZ9 215 aa5.19□□□□□ -1.58
CYFIP1-208ENST00000617928 SPRR1AP35321 89 aa5.19□□□□□ -1.58
CYFIP1-208ENST00000617928 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.18□□□□□ -1.58
CYFIP1-208ENST00000617928 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.18□□□□□ -1.58
CYFIP1-208ENST00000617928 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.18□□□□□ -1.58
CYFIP1-208ENST00000617928 A6NN06 94 aa5.18□□□□□ -1.58
CYFIP1-208ENST00000617928 CENPEQ02224 2701 aa5.17□□□□□ -1.58
CYFIP1-208ENST00000617928 MAST4O15021 2626 aa5.17□□□□□ -1.58
CYFIP1-208ENST00000617928 STAB1Q9NY15 2570 aa5.17□□□□□ -1.58
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.17□□□□□ -1.58
CYFIP1-208ENST00000617928 VCANP13611 3396 aa5.16□□□□□ -1.58
CYFIP1-208ENST00000617928 ROMO1P60602 79 aa5.15□□□□□ -1.59
CYFIP1-208ENST00000617928 BAHCC1Q9P281 2608 aa5.15□□□□□ -1.59
CYFIP1-208ENST00000617928 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CYFIP1-208ENST00000617928 SPRR1BP22528 89 aa5.15□□□□□ -1.59
CYFIP1-208ENST00000617928 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa5.13□□□□□ -1.59
CYFIP1-208ENST00000617928 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.12□□□□□ -1.59
CYFIP1-208ENST00000617928 AKAP13Q12802 2813 aa5.12□□□□□ -1.59
CYFIP1-208ENST00000617928 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.1□□□□□ -1.59
CYFIP1-208ENST00000617928 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.09□□□□□ -1.59
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6ZR54 194 aa5.09□□□□□ -1.59
CYFIP1-208ENST00000617928 PANO1I0J062 215 aa5.09□□□□□ -1.59
CYFIP1-208ENST00000617928 SPEGQ15772 3267 aa5.08□□□□□ -1.6
CYFIP1-208ENST00000617928 DSPP15924 2871 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CYFIP1-208ENST00000617928 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A087X002 238 aa5.07□□□□□ -1.6
CYFIP1-208ENST00000617928 A8MU10 97 aa5.07□□□□□ -1.6
CYFIP1-208ENST00000617928 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CYFIP1-208ENST00000617928 COL6A5A8TX70 2615 aa5.05□□□□□ -1.6
CYFIP1-208ENST00000617928 MYO15AQ9UKN7 3530 aa5.04□□□□□ -1.6
CYFIP1-208ENST00000617928 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa5.04□□□□□ -1.6
CYFIP1-208ENST00000617928 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CYFIP1-208ENST00000617928 FLNCQ14315 2725 aa5.02□□□□□ -1.61
CYFIP1-208ENST00000617928 A8MUU9 505 aa4.99□□□□□ -1.61
CYFIP1-208ENST00000617928 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.99□□□□□ -1.61
CYFIP1-208ENST00000617928 COL6A3P12111 3177 aa4.99□□□□□ -1.61
CYFIP1-208ENST00000617928 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CYFIP1-208ENST00000617928 MGAQ8IWI9 3026 aa4.98□□□□□ -1.61
CYFIP1-208ENST00000617928 WDFY4Q6ZS81 3184 aa4.98□□□□□ -1.61
CYFIP1-208ENST00000617928 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.96□□□□□ -1.62
CYFIP1-208ENST00000617928 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa4.95□□□□□ -1.62
CYFIP1-208ENST00000617928 EYSQ5T1H1 3165 aa4.95□□□□□ -1.62
CYFIP1-208ENST00000617928 LAMA1P25391 3075 aa4.93□□□□□ -1.62
CYFIP1-208ENST00000617928 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CYFIP1-208ENST00000617928 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CYFIP1-208ENST00000617928 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CYFIP1-208ENST00000617928 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.91□□□□□ -1.62
CYFIP1-208ENST00000617928 FRYQ5TBA9 3013 aa4.9□□□□□ -1.62
CYFIP1-208ENST00000617928 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
CYFIP1-208ENST00000617928 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa4.9□□□□□ -1.63
CYFIP1-208ENST00000617928 ITPR1Q14643 2758 aa4.89□□□□□ -1.63
CYFIP1-208ENST00000617928 NOTCH1P46531 2555 aa4.89□□□□□ -1.63
CYFIP1-208ENST00000617928 TEX15Q9BXT5 2789 aa4.89□□□□□ -1.63
CYFIP1-208ENST00000617928 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CYFIP1-208ENST00000617928 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa4.88□□□□□ -1.63
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CYFIP1-208ENST00000617928 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CYFIP1-208ENST00000617928 HIVEP1P15822 2718 aa4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.8 ms