RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613995.4

PDE4DIP-240, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 5

Gene PDE4DIP, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-240ENST00000613995 M0R378 163 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4DIP-240ENST00000613995 TAX1BP3O14907 124 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4DIP-240ENST00000613995 NDUFS5O43920 106 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4DIP-240ENST00000613995 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4DIP-240ENST00000613995 PRR15Q8IV56 129 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4DIP-240ENST00000613995 TTTY13Q9BZ97 58 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4DIP-240ENST00000613995 PAM16Q9Y3D7 125 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4DIP-240ENST00000613995 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 MT-ATP8P03928 68 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 PRLHP81277 87 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 LYRM7Q5U5X0 104 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 Q6Q795 121 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 PCP2Q8IVA1 136 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 KRTAP10-8P60410 259 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 S100A7L2Q5SY68 101 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 VAMP8Q9BV40 100 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 TIMM17BO60830 172 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 IFITM1P13164 125 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 LINC00313P59037 77 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 LINC00308Q8TCZ7 52 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 LITAFQ99732 161 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 A8MUN3 132 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 C6orf99Q4VX62 202 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 A0A087X002 238 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 K7EP34 96 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 IGLV6-57P01721 117 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 CRYGAP11844 174 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 MP68P56378 58 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 LST1O00453 97 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 MT3P25713 68 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 SPRR1AP35321 89 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 MUSTN1Q8IVN3 82 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 BRK1Q8WUW1 75 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 COPS9Q8WXC6 57 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 UQCR10Q9UDW1 63 aa3.03□□□□□ -1.92
PDE4DIP-240ENST00000613995 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa3.02□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa3.02□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 TMEM258P61165 79 aa3.02□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.02□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.02□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 Q6ZRX8 168 aa3.02□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 SPRR4Q96PI1 79 aa3.02□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 IMUPQ9GZP8 106 aa3.02□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 PSPHP1O15172 72 aa3.01□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 ERC2-IT1O76042 136 aa3.01□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 SPATA45Q537H7 98 aa3.01□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 Q9BRP9 147 aa3.01□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 H3BMG7 143 aa3□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 UQCRQO14949 82 aa3□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 COX8AP10176 69 aa3□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 PSMB2P49721 201 aa3□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 C9orf153Q5TBE3 101 aa3□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 SLC25A34Q6PIV7 304 aa3□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 LCA10Q71F78 164 aa3□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 LINC00304Q8N9R0 145 aa3□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 HIST1H4GQ99525 98 aa3□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 COX7BP24311 80 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 PRR4Q16378 134 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 LRP2P98164 4655 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 MOBPQ13875 183 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 LINC00483Q53H64 154 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 TEN1Q86WV5 123 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 DEFB105AQ8NG35 78 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 SMIM11BQ8TCY0 68 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 H7C2G1 150 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 FABP2P12104 132 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 SMIM29Q86T20 159 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 Q8NBF4 154 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 RETNLBQ9BQ08 111 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4DIP-240ENST00000613995 F8W1H4 67 aa2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms