RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 ACANP16112 2415 aa4.84□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 UNC79Q9P2D8 2635 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A096LNI7 61 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 Q75L30 129 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 PRLHP81277 87 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 Q6ZR54 194 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 CSMD2Q7Z408 3487 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 CDK2AP2O75956 126 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC00483Q53H64 154 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 CASC10Q5T4H9 136 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PNN7 141 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 PSPHP1O15172 72 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 NDUFS5O43920 106 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 SEC61GP60059 68 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 Q5VV11 94 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 HIVEP1P15822 2718 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-202ENST00000586851 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 A8MUN3 132 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 COA5Q86WW8 74 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1B0GVX0 72 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 CD164Q04900 197 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 ITPR2Q14571 2701 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 FASNP49327 2511 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 PRR15LQ9BU68 103 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 HECTD1Q9ULT8 2610 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 NUPR2A6NF83 97 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 MDFIQ99750 246 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 VWFP04275 2813 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 C8orf87E5RJ46 101 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 PRR4Q16378 134 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 LCE2CQ5TA81 110 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 APLNQ9ULZ1 77 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 A6NED7 52 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 ATRQ13535 2644 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A087X002 238 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-202ENST00000586851 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-202ENST00000586851 K7EIL1 84 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-202ENST00000586851 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-202ENST00000586851 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-202ENST00000586851 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-202ENST00000586851 Q96NJ1 140 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPNS1-202ENST00000586851 ACYP2P14621 99 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-202ENST00000586851 TENM1Q9UKZ4 2725 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A0G2JQZ4 141 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF861PO60384 105 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-202ENST00000586851 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-202ENST00000586851 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa4.67□□□□□ -1.66
CAPNS1-202ENST00000586851 OTOGQ6ZRI0 2925 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-202ENST00000586851 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-202ENST00000586851 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-202ENST00000586851 CHTF8P0CG12 524 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-202ENST00000586851 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-202ENST00000586851 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.66
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM229AH3BQW9 127 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-202ENST00000586851 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-202ENST00000586851 CUBNO60494 3623 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-202ENST00000586851 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-202ENST00000586851 PCOTHQ58A44 107 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-202ENST00000586851 A6NN06 94 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-202ENST00000586851 HRES1P13985 223 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-202ENST00000586851 LCA10Q71F78 164 aa4.62□□□□□ -1.67
CAPNS1-202ENST00000586851 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.62□□□□□ -1.67
CAPNS1-202ENST00000586851 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.62□□□□□ -1.67
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A087WTM6 91 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-202ENST00000586851 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-202ENST00000586851 DMAC1Q96GE9 116 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-202ENST00000586851 TENM3Q9P273 2699 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-202ENST00000586851 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-202ENST00000586851 RTL8CO15255 209 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-202ENST00000586851 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-202ENST00000586851 MAST4O15021 2626 aa4.59□□□□□ -1.68
CAPNS1-202ENST00000586851 IGLV7-43P04211 117 aa4.58□□□□□ -1.68
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