RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		14.45	□□□□□ -0.1
GPS1-223	ENST00000584229		F8WEM9	126 aa		14.43	□□□□□ -0.1
GPS1-223	ENST00000584229	SMIM29	Q86T20	159 aa		14.43	□□□□□ -0.1
GPS1-223	ENST00000584229	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		14.42	□□□□□ -0.1
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1B0GX51	115 aa		14.39	□□□□□ -0.11
GPS1-223	ENST00000584229	DNAL4	O96015	105 aa		14.39	□□□□□ -0.11
GPS1-223	ENST00000584229	PRR4	Q16378	134 aa		14.37	□□□□□ -0.11
GPS1-223	ENST00000584229	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		14.37	□□□□□ -0.11
GPS1-223	ENST00000584229	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		14.37	□□□□□ -0.11
GPS1-223	ENST00000584229	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		14.37	□□□□□ -0.11
GPS1-223	ENST00000584229	SPINK1	P00995	79 aa		14.36	□□□□□ -0.11
GPS1-223	ENST00000584229	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		14.36	□□□□□ -0.11
GPS1-223	ENST00000584229	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		14.36	□□□□□ -0.11
GPS1-223	ENST00000584229	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	14.36	□□□□□ -0.11
GPS1-223	ENST00000584229	GHRH	P01286	108 aa		14.31	□□□□□ -0.12
GPS1-223	ENST00000584229	FABP2	P12104	132 aa		14.31	□□□□□ -0.12
GPS1-223	ENST00000584229	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		14.3	□□□□□ -0.12
GPS1-223	ENST00000584229		A0A0G2JQZ4	141 aa		14.29	□□□□□ -0.12
GPS1-223	ENST00000584229	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		14.28	□□□□□ -0.12
GPS1-223	ENST00000584229	LST1	O00453	97 aa		14.25	□□□□□ -0.13
GPS1-223	ENST00000584229		H3BUT2	72 aa		14.24	□□□□□ -0.13
GPS1-223	ENST00000584229	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	14.24	□□□□□ -0.13
GPS1-223	ENST00000584229	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	14.24	□□□□□ -0.13
GPS1-223	ENST00000584229	TRAC	P01848	142 aa		14.22	□□□□□ -0.13
GPS1-223	ENST00000584229		Q6JHZ5	121 aa		14.22	□□□□□ -0.13
GPS1-223	ENST00000584229	LIMD2	Q9BT23	127 aa		14.22	□□□□□ -0.13
GPS1-223	ENST00000584229	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		14.21	□□□□□ -0.13
GPS1-223	ENST00000584229	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		14.2	□□□□□ -0.14
GPS1-223	ENST00000584229	CD164	Q04900	197 aa		14.2	□□□□□ -0.14
GPS1-223	ENST00000584229	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		14.19	□□□□□ -0.14
GPS1-223	ENST00000584229	ATXN8	Q156A1	80 aa		14.19	□□□□□ -0.14
GPS1-223	ENST00000584229	IGFL1	Q6UW32	110 aa		14.19	□□□□□ -0.14
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1B0GV72	72 aa		14.18	□□□□□ -0.14
GPS1-223	ENST00000584229		H3BQ85	93 aa		14.18	□□□□□ -0.14
GPS1-223	ENST00000584229	TCL1B	O95988	128 aa		14.18	□□□□□ -0.14
GPS1-223	ENST00000584229		H3BMG7	143 aa		14.17	□□□□□ -0.14
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		14.17	□□□□□ -0.14
GPS1-223	ENST00000584229	TAX1BP3	O14907	124 aa		14.15	□□□□□ -0.14
GPS1-223	ENST00000584229	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		14.14	□□□□□ -0.15
GPS1-223	ENST00000584229	C9orf118	A6NHY6	69 aa		14.14	□□□□□ -0.15
GPS1-223	ENST00000584229	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	14.1	□□□□□ -0.15
GPS1-223	ENST00000584229	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GPS1-223	ENST00000584229	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		14.07	□□□□□ -0.16
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1W2PPM0	123 aa		14.07	□□□□□ -0.16
GPS1-223	ENST00000584229	UBE2V1	Q13404	147 aa		14.07	□□□□□ -0.16
GPS1-223	ENST00000584229	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		14.07	□□□□□ -0.16
GPS1-223	ENST00000584229	LPA	P08519	4548 aa		14.05	□□□□□ -0.16
GPS1-223	ENST00000584229	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		14.05	□□□□□ -0.16
GPS1-223	ENST00000584229	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		14.05	□□□□□ -0.16
GPS1-223	ENST00000584229		C9JAW5	83 aa		14.01	□□□□□ -0.17
GPS1-223	ENST00000584229		Q5XG85	94 aa		14	□□□□□ -0.17
GPS1-223	ENST00000584229	TEN1	Q86WV5	123 aa		14	□□□□□ -0.17
GPS1-223	ENST00000584229	LRP2	P98164	4655 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GPS1-223	ENST00000584229	TPRXL	Q17RH7	258 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GPS1-223	ENST00000584229	CDIP1	Q9H305	208 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GPS1-223	ENST00000584229	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GPS1-223	ENST00000584229		Q6Q795	121 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GPS1-223	ENST00000584229	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GPS1-223	ENST00000584229	C1orf195	Q5TG92	126 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GPS1-223	ENST00000584229	DSCR8	Q96T75	97 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GPS1-223	ENST00000584229		A0A087WSZ3	146 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GPS1-223	ENST00000584229	VPS25	Q9BRG1	176 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GPS1-223	ENST00000584229	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1W2PNM2	257 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GPS1-223	ENST00000584229	MTURN	Q8N3F0	131 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GPS1-223	ENST00000584229	CCK	P06307	115 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GPS1-223	ENST00000584229	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-223	ENST00000584229	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-223	ENST00000584229	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-223	ENST00000584229		H3BT86	120 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GPS1-223	ENST00000584229	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GPS1-223	ENST00000584229	C9orf92	A6NGG3	77 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GPS1-223	ENST00000584229	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GPS1-223	ENST00000584229		K7EP34	96 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GPS1-223	ENST00000584229		Q6ZQT0	140 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GPS1-223	ENST00000584229	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GPS1-223	ENST00000584229	PDE6G	P18545	87 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GPS1-223	ENST00000584229	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GPS1-223	ENST00000584229	SIGMAR1	Q99720	223 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GPS1-223	ENST00000584229	XP32	Q5T750	250 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GPS1-223	ENST00000584229	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GPS1-223	ENST00000584229		Q96NJ1	140 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GPS1-223	ENST00000584229	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GPS1-223	ENST00000584229	IGKV4-1	P06312	121 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GPS1-223	ENST00000584229	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
GPS1-223	ENST00000584229	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GPS1-223	ENST00000584229	PRO0461	Q9UI25	63 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GPS1-223	ENST00000584229	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GPS1-223	ENST00000584229	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1B0GW54	56 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-223	ENST00000584229	MUC17	Q685J3	4493 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-223	ENST00000584229	RNF213	Q63HN8	5207 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-223	ENST00000584229		F8W1H4	67 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GPS1-223	ENST00000584229	DSCR10	P59022	87 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GPS1-223	ENST00000584229	NREP	Q16612	68 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GPS1-223	ENST00000584229	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GPS1-223	ENST00000584229		J3KT08	172 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GPS1-223	ENST00000584229	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
GPS1-223	ENST00000584229	LINC00313	P59037	77 aa		13.44	□□□□□ -0.26

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