RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 A0A087X002 238 aa4.94□□□□□ -1.62
TMOD3-211ENST00000561438 H0Y9J4 135 aa4.94□□□□□ -1.62
TMOD3-211ENST00000561438 M0R143 59 aa4.94□□□□□ -1.62
TMOD3-211ENST00000561438 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
TMOD3-211ENST00000561438 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.94□□□□□ -1.62
TMOD3-211ENST00000561438 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.93□□□□□ -1.62
TMOD3-211ENST00000561438 COX7BP24311 80 aa4.93□□□□□ -1.62
TMOD3-211ENST00000561438 HERC1Q15751 4861 aa4.92□□□□□ -1.62
TMOD3-211ENST00000561438 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.92□□□□□ -1.62
TMOD3-211ENST00000561438 MT1HL1P0DM35 61 aa4.92□□□□□ -1.62
TMOD3-211ENST00000561438 UBE2AP49459 152 aa4.92□□□□□ -1.62
TMOD3-211ENST00000561438 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.92□□□□□ -1.62
TMOD3-211ENST00000561438 LINC00575Q6W349 94 aa4.92□□□□□ -1.62
TMOD3-211ENST00000561438 Q1RN00 199 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-211ENST00000561438 SPRR4Q96PI1 79 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-211ENST00000561438 H3BUT2 72 aa4.9□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.9□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.9□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 TCL1BO95988 128 aa4.89□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 SMIM29Q86T20 159 aa4.89□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 A0A0G2JQZ4 141 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 UBE2V1Q13404 147 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 LINC00483Q53H64 154 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 Q6ZQY7 126 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 Q8N377 158 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 A0A1W2PPM0 123 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 LST1O00453 97 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 SPRR1BP22528 89 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 PSMB2P49721 201 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 KRTAP10-8P60410 259 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 MTURNQ8N3F0 131 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 hADV29S1A0JD25 119 aa4.85□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa4.85□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 Q75L30 129 aa4.85□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.85□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 LINC01600Q96MT4 127 aa4.85□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.85□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.84□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 LPAP08519 4548 aa4.84□□□□□ -1.63
TMOD3-211ENST00000561438 H0YGX0 51 aa4.83□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 VAMP3Q15836 100 aa4.82□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 PRO0461Q9UI25 63 aa4.82□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 CBY1Q9Y3M2 126 aa4.82□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 A0A1B0GV90 55 aa4.81□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 H3BMG7 143 aa4.81□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.81□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.8□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 A0A1B0GV72 72 aa4.8□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 TRACP01848 142 aa4.8□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.8□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 MOBPQ13875 183 aa4.8□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.79□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.79□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 A0A1B0GX51 115 aa4.79□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 K7EP34 96 aa4.79□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 SPCS1Q9Y6A9 102 aa4.79□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 C9JAW5 83 aa4.78□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 SLC25A20O43772 301 aa4.78□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 COX6CP09669 75 aa4.78□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 FABP2P12104 132 aa4.78□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 ATXN8Q156A1 80 aa4.78□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
TMOD3-211ENST00000561438 OXTP01178 125 aa4.77□□□□□ -1.65
TMOD3-211ENST00000561438 CRYGAP11844 174 aa4.77□□□□□ -1.65
TMOD3-211ENST00000561438 Q8NBF4 154 aa4.77□□□□□ -1.65
TMOD3-211ENST00000561438 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-211ENST00000561438 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-211ENST00000561438 IGFL1Q6UW32 110 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-211ENST00000561438 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-211ENST00000561438 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-211ENST00000561438 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-211ENST00000561438 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-211ENST00000561438 A0A1W2PNM2 257 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-211ENST00000561438 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-211ENST00000561438 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-211ENST00000561438 DNAL4O96015 105 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-211ENST00000561438 OCIAD2Q56VL3 154 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-211ENST00000561438 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-211ENST00000561438 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-211ENST00000561438 LYRM7Q5U5X0 104 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-211ENST00000561438 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-211ENST00000561438 PPDPFLQ8WWR9 84 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-211ENST00000561438 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-211ENST00000561438 LRP2P98164 4655 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-211ENST00000561438 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-211ENST00000561438 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-211ENST00000561438 H3BT86 120 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-211ENST00000561438 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-211ENST00000561438 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD3-211ENST00000561438 Q6ZQT0 140 aa4.68□□□□□ -1.66
TMOD3-211ENST00000561438 Q96NJ1 140 aa4.67□□□□□ -1.66
TMOD3-211ENST00000561438 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.66□□□□□ -1.66
TMOD3-211ENST00000561438 F8WEM9 126 aa4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms