RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRB-210ENST00000551525 ATRQ13535 2644 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF861PO60384 105 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRB-210ENST00000551525 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRB-210ENST00000551525 CENPEQ02224 2701 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRB-210ENST00000551525 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
PTPRB-210ENST00000551525 ITPR3Q14573 2671 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRB-210ENST00000551525 USP24Q9UPU5 2620 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZRX8 168 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRB-210ENST00000551525 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRB-210ENST00000551525 MUC3AQ02505 3323 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PNM2 257 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV6-57P01721 117 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRB-210ENST00000551525 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRB-210ENST00000551525 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRB-210ENST00000551525 WDFY4Q6ZS81 3184 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRB-210ENST00000551525 FAM104AQ969W3 186 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRB-210ENST00000551525 Q8N1X5 172 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRB-210ENST00000551525 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-210ENST00000551525 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-210ENST00000551525 VPS13AQ96RL7 3174 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRB-210ENST00000551525 A8MU10 97 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZR54 194 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRB-210ENST00000551525 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRB-210ENST00000551525 UNC79Q9P2D8 2635 aa4□□□□□ -1.77
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00483Q53H64 154 aa4□□□□□ -1.77
PTPRB-210ENST00000551525 NOTCH1P46531 2555 aa4□□□□□ -1.77
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PTPRB-210ENST00000551525 MUC4Q99102 2169 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRB-210ENST00000551525 USP34Q70CQ2 3546 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRB-210ENST00000551525 HRES1P13985 223 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRB-210ENST00000551525 C15orf56Q8N910 161 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRB-210ENST00000551525 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PTPRB-210ENST00000551525 DNAH14Q0VDD8 3507 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRB-210ENST00000551525 MGAQ8IWI9 3026 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRB-210ENST00000551525 MYO15AQ9UKN7 3530 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRB-210ENST00000551525 Q96NJ1 140 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 LAMA1P25391 3075 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 DSPP15924 2871 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 FRYLO94915 3013 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV2-30P06310 120 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 DMDP11532 3685 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 DSCR10P59022 87 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 IGSF10Q6WRI0 2623 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 AKAP13Q12802 2813 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GU33 70 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 SPRR4Q96PI1 79 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 STAB1Q9NY15 2570 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 CFAP54Q96N23 3096 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 CR1P17927 2039 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 SPEGQ15772 3267 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 A8MUU9 505 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZSA8 131 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 Q8NDZ9 215 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 CHD6Q8TD26 2715 aa3.9□□□□□ -1.78
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GVX0 72 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRB-210ENST00000551525 Q8N377 158 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRB-210ENST00000551525 COL6A5A8TX70 2615 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRB-210ENST00000551525 IGFL1Q6UW32 110 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRB-210ENST00000551525 FAM168BA1KXE4 195 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRB-210ENST00000551525 TEX15Q9BXT5 2789 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRB-210ENST00000551525 DMXL1Q9Y485 3027 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PNN7 141 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRB-210ENST00000551525 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRB-210ENST00000551525 Q5W150 140 aa3.84□□□□□ -1.8
PTPRB-210ENST00000551525 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRB-210ENST00000551525 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRB-210ENST00000551525 C9orf92A6NGG3 77 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRB-210ENST00000551525 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRB-210ENST00000551525 DCHS1Q96JQ0 3298 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRB-210ENST00000551525 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRB-210ENST00000551525 FREM2Q5SZK8 3169 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRB-210ENST00000551525 FRYQ5TBA9 3013 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRB-210ENST00000551525 FLNCQ14315 2725 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRB-210ENST00000551525 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP10-1P60331 282 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRB-210ENST00000551525 ASPMQ8IZT6 3477 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0D9SG42 100 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRB-210ENST00000551525 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRB-210ENST00000551525 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRB-210ENST00000551525 SPRR1BP22528 89 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRB-210ENST00000551525 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRB-210ENST00000551525 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
PTPRB-210ENST00000551525 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRB-210ENST00000551525 PLAC4Q8WY50 150 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRB-210ENST00000551525 PANO1I0J062 215 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRB-210ENST00000551525 LAMA5O15230 3695 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRB-210ENST00000551525 SPRR1AP35321 89 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRB-210ENST00000551525 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP10-2P60368 255 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRB-210ENST00000551525 LOC400499M0QZD8 3231 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0G2JQZ4 141 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms