RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 PRR15Q8IV56 129 aa6.42□□□□□ -1.38
POLR1B-217ENST00000541869 K7EQZ3 153 aa6.42□□□□□ -1.38
POLR1B-217ENST00000541869 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
POLR1B-217ENST00000541869 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.4□□□□□ -1.39
POLR1B-217ENST00000541869 Q8N1X5 172 aa6.38□□□□□ -1.39
POLR1B-217ENST00000541869 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
POLR1B-217ENST00000541869 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
POLR1B-217ENST00000541869 A0A0G2JQZ4 141 aa6.37□□□□□ -1.39
POLR1B-217ENST00000541869 PMAIP1Q13794 54 aa6.37□□□□□ -1.39
POLR1B-217ENST00000541869 TRIOO75962 3097 aa6.36□□□□□ -1.39
POLR1B-217ENST00000541869 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
POLR1B-217ENST00000541869 PRO0461Q9UI25 63 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1B-217ENST00000541869 ITPR1Q14643 2758 aa6.34□□□□□ -1.39
POLR1B-217ENST00000541869 CSAG1Q6PB30 78 aa6.34□□□□□ -1.39
POLR1B-217ENST00000541869 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
POLR1B-217ENST00000541869 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1B-217ENST00000541869 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1W2PNM2 257 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR1B-217ENST00000541869 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
POLR1B-217ENST00000541869 FRYQ5TBA9 3013 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1B-217ENST00000541869 HRES1P13985 223 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR1B-217ENST00000541869 FAM104AQ969W3 186 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1B-217ENST00000541869 SPRR1AP35321 89 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-217ENST00000541869 LINC01600Q96MT4 127 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1B-217ENST00000541869 CFAP54Q96N23 3096 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1B-217ENST00000541869 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.24□□□□□ -1.41
POLR1B-217ENST00000541869 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
POLR1B-217ENST00000541869 SPRR1BP22528 89 aa6.24□□□□□ -1.41
POLR1B-217ENST00000541869 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.24□□□□□ -1.41
POLR1B-217ENST00000541869 PSPHP1O15172 72 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR1B-217ENST00000541869 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR1B-217ENST00000541869 FRYLO94915 3013 aa6.22□□□□□ -1.41
POLR1B-217ENST00000541869 CDH23Q9H251 3354 aa6.21□□□□□ -1.42
POLR1B-217ENST00000541869 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
POLR1B-217ENST00000541869 APCP25054 2843 aa6.19□□□□□ -1.42
POLR1B-217ENST00000541869 A8MUN3 132 aa6.19□□□□□ -1.42
POLR1B-217ENST00000541869 S4R3F8 94 aa6.19□□□□□ -1.42
POLR1B-217ENST00000541869 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
POLR1B-217ENST00000541869 SPINK7P58062 85 aa6.18□□□□□ -1.42
POLR1B-217ENST00000541869 SZT2Q5T011 3432 aa6.18□□□□□ -1.42
POLR1B-217ENST00000541869 COL12A1Q99715 3063 aa6.18□□□□□ -1.42
POLR1B-217ENST00000541869 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.17□□□□□ -1.42
POLR1B-217ENST00000541869 ATMQ13315 3056 aa6.17□□□□□ -1.42
POLR1B-217ENST00000541869 CRIPTQ9P021 101 aa6.17□□□□□ -1.42
POLR1B-217ENST00000541869 TACC2O95359 2948 aa6.17□□□□□ -1.42
POLR1B-217ENST00000541869 PLAC4Q8WY50 150 aa6.17□□□□□ -1.42
POLR1B-217ENST00000541869 UQCR11O14957 56 aa6.16□□□□□ -1.42
POLR1B-217ENST00000541869 PANO1I0J062 215 aa6.15□□□□□ -1.42
POLR1B-217ENST00000541869 R4GN34 69 aa6.15□□□□□ -1.42
POLR1B-217ENST00000541869 A0A0D9SG42 100 aa6.15□□□□□ -1.43
POLR1B-217ENST00000541869 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.15□□□□□ -1.43
POLR1B-217ENST00000541869 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.14□□□□□ -1.43
POLR1B-217ENST00000541869 Q8NDZ9 215 aa6.14□□□□□ -1.43
POLR1B-217ENST00000541869 COL6A3P12111 3177 aa6.14□□□□□ -1.43
POLR1B-217ENST00000541869 COA5Q86WW8 74 aa6.14□□□□□ -1.43
POLR1B-217ENST00000541869 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.13□□□□□ -1.43
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00483Q53H64 154 aa6.13□□□□□ -1.43
POLR1B-217ENST00000541869 EYSQ5T1H1 3165 aa6.12□□□□□ -1.43
POLR1B-217ENST00000541869 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.09□□□□□ -1.43
POLR1B-217ENST00000541869 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-217ENST00000541869 TENM3Q9P273 2699 aa6.06□□□□□ -1.44
POLR1B-217ENST00000541869 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-217ENST00000541869 LCA10Q71F78 164 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-217ENST00000541869 A0A087X002 238 aa6.04□□□□□ -1.44
POLR1B-217ENST00000541869 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.04□□□□□ -1.44
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.04□□□□□ -1.44
POLR1B-217ENST00000541869 KLKP1Q107X0 134 aa6.03□□□□□ -1.44
POLR1B-217ENST00000541869 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.03□□□□□ -1.44
POLR1B-217ENST00000541869 H3BS24 57 aa6.02□□□□□ -1.45
POLR1B-217ENST00000541869 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.02□□□□□ -1.45
POLR1B-217ENST00000541869 TENM2Q9NT68 2774 aa6.02□□□□□ -1.45
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
POLR1B-217ENST00000541869 LRBAP50851 2863 aa6.01□□□□□ -1.45
POLR1B-217ENST00000541869 KALRNO60229 2985 aa6□□□□□ -1.45
POLR1B-217ENST00000541869 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.99□□□□□ -1.45
POLR1B-217ENST00000541869 LAMA1P25391 3075 aa5.98□□□□□ -1.45
POLR1B-217ENST00000541869 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.97□□□□□ -1.45
POLR1B-217ENST00000541869 ZZEF1O43149 2961 aa5.97□□□□□ -1.45
POLR1B-217ENST00000541869 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
POLR1B-217ENST00000541869 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.97□□□□□ -1.45
POLR1B-217ENST00000541869 M0QZ58 72 aa5.96□□□□□ -1.46
POLR1B-217ENST00000541869 Q5W150 140 aa5.96□□□□□ -1.46
POLR1B-217ENST00000541869 TENM1Q9UKZ4 2725 aa5.96□□□□□ -1.46
POLR1B-217ENST00000541869 DMXL1Q9Y485 3027 aa5.95□□□□□ -1.46
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1B0GU33 70 aa5.95□□□□□ -1.46
POLR1B-217ENST00000541869 OCR1Q9BZK8 76 aa5.95□□□□□ -1.46
POLR1B-217ENST00000541869 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.94□□□□□ -1.46
POLR1B-217ENST00000541869 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa5.94□□□□□ -1.46
POLR1B-217ENST00000541869 Q5XG85 94 aa5.94□□□□□ -1.46
POLR1B-217ENST00000541869 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
POLR1B-217ENST00000541869 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa5.92□□□□□ -1.46
POLR1B-217ENST00000541869 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1B-217ENST00000541869 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1B-217ENST00000541869 H7BZZ5 65 aa5.9□□□□□ -1.46
POLR1B-217ENST00000541869 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
POLR1B-217ENST00000541869 Q75L30 129 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-217ENST00000541869 DMAC1Q96GE9 116 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.88□□□□□ -1.47
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