RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541005.1

LTBR-208, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 2

Gene LTBR, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-208ENST00000541005 FXYD2P54710 66 aa7.33□□□□□ -1.24
LTBR-208ENST00000541005 Q5XG85 94 aa7.33□□□□□ -1.24
LTBR-208ENST00000541005 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.33□□□□□ -1.24
LTBR-208ENST00000541005 HSD52Q0P140 79 aa7.32□□□□□ -1.24
LTBR-208ENST00000541005 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.31□□□□□ -1.24
LTBR-208ENST00000541005 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.31□□□□□ -1.24
LTBR-208ENST00000541005 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.31□□□□□ -1.24
LTBR-208ENST00000541005 RNF213Q63HN8 5207 aa7.31□□□□□ -1.24
LTBR-208ENST00000541005 F8WEM9 126 aa7.3□□□□□ -1.24
LTBR-208ENST00000541005 H0YGX0 51 aa7.3□□□□□ -1.24
LTBR-208ENST00000541005 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.3□□□□□ -1.24
LTBR-208ENST00000541005 Q6JHZ5 121 aa7.28□□□□□ -1.24
LTBR-208ENST00000541005 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.28□□□□□ -1.24
LTBR-208ENST00000541005 A0A0G2JQZ4 141 aa7.27□□□□□ -1.25
LTBR-208ENST00000541005 A0A1B0GX51 115 aa7.27□□□□□ -1.25
LTBR-208ENST00000541005 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.27□□□□□ -1.25
LTBR-208ENST00000541005 SNCGO76070 127 aa7.26□□□□□ -1.25
LTBR-208ENST00000541005 CLEC2BQ92478 149 aa7.26□□□□□ -1.25
LTBR-208ENST00000541005 TRIAP1O43715 76 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBR-208ENST00000541005 IGFL1Q6UW32 110 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBR-208ENST00000541005 MUC17Q685J3 4493 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBR-208ENST00000541005 K7ERJ3 54 aa7.23□□□□□ -1.25
LTBR-208ENST00000541005 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.23□□□□□ -1.25
LTBR-208ENST00000541005 XP32Q5T750 250 aa7.23□□□□□ -1.25
LTBR-208ENST00000541005 C1orf195Q5TG92 126 aa7.23□□□□□ -1.25
LTBR-208ENST00000541005 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.23□□□□□ -1.25
LTBR-208ENST00000541005 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.21□□□□□ -1.26
LTBR-208ENST00000541005 TCL1BO95988 128 aa7.21□□□□□ -1.26
LTBR-208ENST00000541005 GHRHP01286 108 aa7.21□□□□□ -1.26
LTBR-208ENST00000541005 A0A0U1RQV1 116 aa7.2□□□□□ -1.26
LTBR-208ENST00000541005 SMIM6P0DI80 62 aa7.2□□□□□ -1.26
LTBR-208ENST00000541005 H3BUT2 72 aa7.19□□□□□ -1.26
LTBR-208ENST00000541005 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
LTBR-208ENST00000541005 MUC2Q02817 5179 aa7.18□□□□□ -1.26
LTBR-208ENST00000541005 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
LTBR-208ENST00000541005 Q6Q795 121 aa7.18□□□□□ -1.26
LTBR-208ENST00000541005 COX6CP09669 75 aa7.17□□□□□ -1.26
LTBR-208ENST00000541005 PSMB2P49721 201 aa7.17□□□□□ -1.26
LTBR-208ENST00000541005 H3BQ85 93 aa7.16□□□□□ -1.26
LTBR-208ENST00000541005 DNAL4O96015 105 aa7.15□□□□□ -1.26
LTBR-208ENST00000541005 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.14□□□□□ -1.27
LTBR-208ENST00000541005 C9orf92A6NGG3 77 aa7.13□□□□□ -1.27
LTBR-208ENST00000541005 H3BMG7 143 aa7.13□□□□□ -1.27
LTBR-208ENST00000541005 FABP2P12104 132 aa7.13□□□□□ -1.27
LTBR-208ENST00000541005 TEN1Q86WV5 123 aa7.13□□□□□ -1.27
LTBR-208ENST00000541005 M0R143 59 aa7.12□□□□□ -1.27
LTBR-208ENST00000541005 TRACP01848 142 aa7.12□□□□□ -1.27
LTBR-208ENST00000541005 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.11□□□□□ -1.27
LTBR-208ENST00000541005 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.11□□□□□ -1.27
LTBR-208ENST00000541005 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.1□□□□□ -1.27
LTBR-208ENST00000541005 LST1O00453 97 aa7.1□□□□□ -1.27
LTBR-208ENST00000541005 UBE2V1Q13404 147 aa7.08□□□□□ -1.28
LTBR-208ENST00000541005 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.07□□□□□ -1.28
LTBR-208ENST00000541005 A0A1W2PNM2 257 aa7.07□□□□□ -1.28
LTBR-208ENST00000541005 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
LTBR-208ENST00000541005 A0A087WSZ3 146 aa7.06□□□□□ -1.28
LTBR-208ENST00000541005 TSTD3H0UI37 97 aa7.06□□□□□ -1.28
LTBR-208ENST00000541005 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.06□□□□□ -1.28
LTBR-208ENST00000541005 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
LTBR-208ENST00000541005 PCOTHQ58A44 107 aa7.05□□□□□ -1.28
LTBR-208ENST00000541005 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.05□□□□□ -1.28
LTBR-208ENST00000541005 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.04□□□□□ -1.28
LTBR-208ENST00000541005 Q96NJ1 140 aa7.04□□□□□ -1.28
LTBR-208ENST00000541005 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.02□□□□□ -1.29
LTBR-208ENST00000541005 A0A1B0GV72 72 aa7.01□□□□□ -1.29
LTBR-208ENST00000541005 ATXN8Q156A1 80 aa7□□□□□ -1.29
LTBR-208ENST00000541005 CCKP06307 115 aa6.99□□□□□ -1.29
LTBR-208ENST00000541005 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.99□□□□□ -1.29
LTBR-208ENST00000541005 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.99□□□□□ -1.29
LTBR-208ENST00000541005 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LTBR-208ENST00000541005 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
LTBR-208ENST00000541005 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.98□□□□□ -1.29
LTBR-208ENST00000541005 Q75L30 129 aa6.98□□□□□ -1.29
LTBR-208ENST00000541005 DSCR8Q96T75 97 aa6.96□□□□□ -1.3
LTBR-208ENST00000541005 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.95□□□□□ -1.3
LTBR-208ENST00000541005 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.95□□□□□ -1.3
LTBR-208ENST00000541005 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.94□□□□□ -1.3
LTBR-208ENST00000541005 BATFQ16520 125 aa6.94□□□□□ -1.3
LTBR-208ENST00000541005 SIGMAR1Q99720 223 aa6.94□□□□□ -1.3
LTBR-208ENST00000541005 C9JAW5 83 aa6.93□□□□□ -1.3
LTBR-208ENST00000541005 LCE2CQ5TA81 110 aa6.93□□□□□ -1.3
LTBR-208ENST00000541005 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.93□□□□□ -1.3
LTBR-208ENST00000541005 A8MUU9 505 aa6.92□□□□□ -1.3
LTBR-208ENST00000541005 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.92□□□□□ -1.3
LTBR-208ENST00000541005 IGKV4-1P06312 121 aa6.92□□□□□ -1.3
LTBR-208ENST00000541005 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.92□□□□□ -1.3
LTBR-208ENST00000541005 C9orf118A6NHY6 69 aa6.91□□□□□ -1.3
LTBR-208ENST00000541005 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.9□□□□□ -1.3
LTBR-208ENST00000541005 VPS25Q9BRG1 176 aa6.9□□□□□ -1.3
LTBR-208ENST00000541005 TAX1BP3O14907 124 aa6.89□□□□□ -1.31
LTBR-208ENST00000541005 DSCR10P59022 87 aa6.89□□□□□ -1.31
LTBR-208ENST00000541005 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.89□□□□□ -1.31
LTBR-208ENST00000541005 Q6ZQT0 140 aa6.89□□□□□ -1.31
LTBR-208ENST00000541005 A0A1B0GW54 56 aa6.88□□□□□ -1.31
LTBR-208ENST00000541005 PDE6GP18545 87 aa6.88□□□□□ -1.31
LTBR-208ENST00000541005 A0A1W2PPM0 123 aa6.87□□□□□ -1.31
LTBR-208ENST00000541005 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.87□□□□□ -1.31
LTBR-208ENST00000541005 LINC00313P59037 77 aa6.87□□□□□ -1.31
LTBR-208ENST00000541005 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.86□□□□□ -1.31
LTBR-208ENST00000541005 H3BT86 120 aa6.84□□□□□ -1.31
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