RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532353.1

TRAF3IP2-AS1-210, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 576 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 Q8NBF4 154 aa7.17□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.17□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SNCGO76070 127 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LST1O00453 97 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 TAX1BP3O14907 124 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 TRACP01848 142 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 C9orf118A6NHY6 69 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 H3BUT2 72 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 DNAL4O96015 105 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 A0A0G2JQZ4 141 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 F8WEM9 126 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 TCL1BO95988 128 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SPINK1P00995 79 aa7.07□□□□□ -1.28
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 GHRHP01286 108 aa7.06□□□□□ -1.28
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 FABP2P12104 132 aa7.06□□□□□ -1.28
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 H3BQ85 93 aa7.05□□□□□ -1.28
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 CD164Q04900 197 aa7.05□□□□□ -1.28
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 ATXN8Q156A1 80 aa7.05□□□□□ -1.28
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.05□□□□□ -1.28
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.05□□□□□ -1.28
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 A0A1W2PPM0 123 aa7.04□□□□□ -1.28
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.04□□□□□ -1.28
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 Q6JHZ5 121 aa7.04□□□□□ -1.28
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 IGFL1Q6UW32 110 aa7.04□□□□□ -1.28
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.03□□□□□ -1.28
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.03□□□□□ -1.28
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.03□□□□□ -1.28
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.02□□□□□ -1.29
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 H3BMG7 143 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 UBE2V1Q13404 147 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 PRR4Q16378 134 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 A0A1B0GV72 72 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 C9JAW5 83 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 Q5XG85 94 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LIMD2Q9BT23 127 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 Q6Q795 121 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 A0A1W2PNM2 257 aa6.94□□□□□ -1.3
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 TEN1Q86WV5 123 aa6.94□□□□□ -1.3
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.93□□□□□ -1.3
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LRP2P98164 4655 aa6.93□□□□□ -1.3
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.92□□□□□ -1.3
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 MTURNQ8N3F0 131 aa6.92□□□□□ -1.3
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 K7EP34 96 aa6.91□□□□□ -1.3
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 C1orf195Q5TG92 126 aa6.91□□□□□ -1.3
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 H3BT86 120 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LPAP08519 4548 aa6.89□□□□□ -1.31
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.89□□□□□ -1.31
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 DSCR8Q96T75 97 aa6.89□□□□□ -1.31
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 RNF213Q63HN8 5207 aa6.89□□□□□ -1.31
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 A0A087WSZ3 146 aa6.88□□□□□ -1.31
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 CCKP06307 115 aa6.88□□□□□ -1.31
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 TPRXLQ17RH7 258 aa6.88□□□□□ -1.31
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 PRO0461Q9UI25 63 aa6.88□□□□□ -1.31
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 Q6ZQT0 140 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.84□□□□□ -1.31
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 VPS25Q9BRG1 176 aa6.84□□□□□ -1.31
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 Q96NJ1 140 aa6.83□□□□□ -1.32
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LCE2BO14633 110 aa6.82□□□□□ -1.32
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 PDE6GP18545 87 aa6.82□□□□□ -1.32
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 CDIP1Q9H305 208 aa6.8□□□□□ -1.32
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 A0A1B0GW54 56 aa6.78□□□□□ -1.32
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 F8W1H4 67 aa6.78□□□□□ -1.32
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.78□□□□□ -1.32
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 C9orf92A6NGG3 77 aa6.77□□□□□ -1.33
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.77□□□□□ -1.33
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 A0A1B0GV90 55 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 XP32Q5T750 250 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 IGKV4-1P06312 121 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 ETDBQ3ZM63 59 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SIGMAR1Q99720 223 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 J3KT08 172 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 NREPQ16612 68 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.8 ms