RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa10.69□□□□□ -0.7
PTDSS1-202ENST00000517309 LAMA3Q16787 3333 aa10.67□□□□□ -0.7
PTDSS1-202ENST00000517309 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa10.64□□□□□ -0.71
PTDSS1-202ENST00000517309 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTDSS1-202ENST00000517309 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PTDSS1-202ENST00000517309 SPINT4Q6UDR6 99 aa10.62□□□□□ -0.71
PTDSS1-202ENST00000517309 CFAP54Q96N23 3096 aa10.61□□□□□ -0.71
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC01554Q52M75 96 aa10.6□□□□□ -0.71
PTDSS1-202ENST00000517309 WDFY4Q6ZS81 3184 aa10.6□□□□□ -0.71
PTDSS1-202ENST00000517309 HRES1P13985 223 aa10.6□□□□□ -0.71
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC00472Q9H8W2 130 aa10.59□□□□□ -0.71
PTDSS1-202ENST00000517309 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP10-1P60331 282 aa10.58□□□□□ -0.72
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A0C4DFX4 3053 aa10.57□□□□□ -0.72
PTDSS1-202ENST00000517309 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
PTDSS1-202ENST00000517309 Q5VSD8 79 aa10.56□□□□□ -0.72
PTDSS1-202ENST00000517309 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa10.54□□□□□ -0.72
PTDSS1-202ENST00000517309 Q6ZR54 194 aa10.54□□□□□ -0.72
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP10-2P60368 255 aa10.54□□□□□ -0.72
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A0D9SG42 100 aa10.54□□□□□ -0.72
PTDSS1-202ENST00000517309 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PTDSS1-202ENST00000517309 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC00483Q53H64 154 aa10.49□□□□□ -0.73
PTDSS1-202ENST00000517309 CSAG1Q6PB30 78 aa10.48□□□□□ -0.73
PTDSS1-202ENST00000517309 M0R2T5 61 aa10.48□□□□□ -0.73
PTDSS1-202ENST00000517309 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
PTDSS1-202ENST00000517309 Q1T7F1 81 aa10.47□□□□□ -0.73
PTDSS1-202ENST00000517309 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A1B0GU33 70 aa10.45□□□□□ -0.74
PTDSS1-202ENST00000517309 Q5W150 140 aa10.45□□□□□ -0.74
PTDSS1-202ENST00000517309 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa10.44□□□□□ -0.74
PTDSS1-202ENST00000517309 ITPR2Q14571 2701 aa10.43□□□□□ -0.74
PTDSS1-202ENST00000517309 SPINK7P58062 85 aa10.43□□□□□ -0.74
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
PTDSS1-202ENST00000517309 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa10.4□□□□□ -0.74
PTDSS1-202ENST00000517309 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.75
PTDSS1-202ENST00000517309 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PTDSS1-202ENST00000517309 S4R3F8 94 aa10.39□□□□□ -0.75
PTDSS1-202ENST00000517309 BRCA2P51587 3418 aa10.39□□□□□ -0.75
PTDSS1-202ENST00000517309 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa10.38□□□□□ -0.75
PTDSS1-202ENST00000517309 TRIOO75962 3097 aa10.38□□□□□ -0.75
PTDSS1-202ENST00000517309 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa10.37□□□□□ -0.75
PTDSS1-202ENST00000517309 PANO1I0J062 215 aa10.37□□□□□ -0.75
PTDSS1-202ENST00000517309 ITPR1Q14643 2758 aa10.36□□□□□ -0.75
PTDSS1-202ENST00000517309 FLNCQ14315 2725 aa10.35□□□□□ -0.75
PTDSS1-202ENST00000517309 STAB2Q8WWQ8 2551 aa10.34□□□□□ -0.75
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa10.34□□□□□ -0.75
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa10.32□□□□□ -0.76
PTDSS1-202ENST00000517309 Q75L30 129 aa10.32□□□□□ -0.76
PTDSS1-202ENST00000517309 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
PTDSS1-202ENST00000517309 LCA10Q71F78 164 aa10.32□□□□□ -0.76
PTDSS1-202ENST00000517309 DMAC1Q96GE9 116 aa10.3□□□□□ -0.76
PTDSS1-202ENST00000517309 OXTP01178 125 aa10.28□□□□□ -0.76
PTDSS1-202ENST00000517309 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 CYSTM1Q9H1C7 97 aa10.26□□□□□ -0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 VPS13AQ96RL7 3174 aa10.25□□□□□ -0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 FRYQ5TBA9 3013 aa10.23□□□□□ -0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A087X002 238 aa10.22□□□□□ -0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 UNC80Q8N2C7 3258 aa10.21□□□□□ -0.78
PTDSS1-202ENST00000517309 R4GN34 69 aa10.2□□□□□ -0.78
PTDSS1-202ENST00000517309 RPS29P62273 56 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PTDSS1-202ENST00000517309 Q5XG85 94 aa10.19□□□□□ -0.78
PTDSS1-202ENST00000517309 XIRP2A4UGR9 3374 aa10.18□□□□□ -0.78
PTDSS1-202ENST00000517309 HIVEP1P15822 2718 aa10.18□□□□□ -0.78
PTDSS1-202ENST00000517309 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa10.17□□□□□ -0.78
PTDSS1-202ENST00000517309 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PTDSS1-202ENST00000517309 TACC2O95359 2948 aa10.11□□□□□ -0.79
PTDSS1-202ENST00000517309 ATMQ13315 3056 aa10.11□□□□□ -0.79
PTDSS1-202ENST00000517309 LUZP6Q538Z0 58 aa10.1□□□□□ -0.79
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa10.08□□□□□ -0.8
PTDSS1-202ENST00000517309 COL12A1Q99715 3063 aa10.07□□□□□ -0.8
PTDSS1-202ENST00000517309 CDH23Q9H251 3354 aa10.06□□□□□ -0.8
PTDSS1-202ENST00000517309 FRYLO94915 3013 aa10.05□□□□□ -0.8
PTDSS1-202ENST00000517309 Q5VV11 94 aa10.04□□□□□ -0.8
PTDSS1-202ENST00000517309 TENM4Q6N022 2769 aa10.04□□□□□ -0.8
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa10.04□□□□□ -0.8
PTDSS1-202ENST00000517309 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTDSS1-202ENST00000517309 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP10.01□□□□□ -0.81
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa10.01□□□□□ -0.81
PTDSS1-202ENST00000517309 RPL37P61927 97 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PTDSS1-202ENST00000517309 M0QZ58 72 aa9.97□□□□□ -0.81
PTDSS1-202ENST00000517309 APCP25054 2843 aa9.97□□□□□ -0.81
PTDSS1-202ENST00000517309 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa9.95□□□□□ -0.82
PTDSS1-202ENST00000517309 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.95□□□□□ -0.82
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.94□□□□□ -0.82
PTDSS1-202ENST00000517309 REV3LO60673 3130 aa9.93□□□□□ -0.82
PTDSS1-202ENST00000517309 KALRNO60229 2985 aa9.92□□□□□ -0.82
PTDSS1-202ENST00000517309 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa9.89□□□□□ -0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 LRBAP50851 2863 aa9.88□□□□□ -0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa9.87□□□□□ -0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.87□□□□□ -0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 SZT2Q5T011 3432 aa9.86□□□□□ -0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 LAMA1P25391 3075 aa9.85□□□□□ -0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 PLAC4Q8WY50 150 aa9.83□□□□□ -0.84
PTDSS1-202ENST00000517309 ROMO1P60602 79 aa9.83□□□□□ -0.84
PTDSS1-202ENST00000517309 ZZEF1O43149 2961 aa9.82□□□□□ -0.84
PTDSS1-202ENST00000517309 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.8□□□□□ -0.84
PTDSS1-202ENST00000517309 VCANP13611 3396 aa9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87 ms