RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512716.1

RASGEF1B-210, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 516 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-210ENST00000512716 A0A0G2JQZ4 141 aa13.38□□□□□ -0.27
RASGEF1B-210ENST00000512716 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa13.38□□□□□ -0.27
RASGEF1B-210ENST00000512716 A6NJY4 79 aa13.38□□□□□ -0.27
RASGEF1B-210ENST00000512716 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
RASGEF1B-210ENST00000512716 FXYD2P54710 66 aa13.33□□□□□ -0.28
RASGEF1B-210ENST00000512716 MUC17Q685J3 4493 aa13.32□□□□□ -0.28
RASGEF1B-210ENST00000512716 PRO1854Q9UHT4 67 aa13.32□□□□□ -0.28
RASGEF1B-210ENST00000512716 MUC2Q02817 5179 aa13.31□□□□□ -0.28
RASGEF1B-210ENST00000512716 H0YGX0 51 aa13.31□□□□□ -0.28
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RASGEF1B-210ENST00000512716 Q5XG85 94 aa13.31□□□□□ -0.28
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RASGEF1B-210ENST00000512716 FAM218AQ96MZ4 157 aa13.26□□□□□ -0.29
RASGEF1B-210ENST00000512716 CLEC2BQ92478 149 aa13.25□□□□□ -0.29
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RASGEF1B-210ENST00000512716 IGFL1Q6UW32 110 aa13.24□□□□□ -0.29
RASGEF1B-210ENST00000512716 UQCR10Q9UDW1 63 aa13.24□□□□□ -0.29
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RASGEF1B-210ENST00000512716 C1orf195Q5TG92 126 aa13.22□□□□□ -0.29
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RASGEF1B-210ENST00000512716 DNAL4O96015 105 aa13.08□□□□□ -0.32
RASGEF1B-210ENST00000512716 H3BMG7 143 aa13.05□□□□□ -0.32
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa13.05□□□□□ -0.32
RASGEF1B-210ENST00000512716 ORMDL1Q9P0S3 153 aa13.03□□□□□ -0.32
RASGEF1B-210ENST00000512716 Q6Q795 121 aa13.02□□□□□ -0.33
RASGEF1B-210ENST00000512716 TEN1Q86WV5 123 aa13.02□□□□□ -0.33
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RASGEF1B-210ENST00000512716 H3BQ85 93 aa13□□□□□ -0.33
RASGEF1B-210ENST00000512716 SS18L2Q9UHA2 77 aa13□□□□□ -0.33
RASGEF1B-210ENST00000512716 LST1O00453 97 aa12.99□□□□□ -0.33
RASGEF1B-210ENST00000512716 PCOTHQ58A44 107 aa12.99□□□□□ -0.33
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RASGEF1B-210ENST00000512716 SCGB1C2P0DMR2 95 aa12.97□□□□□ -0.33
RASGEF1B-210ENST00000512716 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa12.95□□□□□ -0.34
RASGEF1B-210ENST00000512716 A0A087WSZ3 146 aa12.94□□□□□ -0.34
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RASGEF1B-210ENST00000512716 Q96NJ1 140 aa12.81□□□□□ -0.36
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RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa12.78□□□□□ -0.36
RASGEF1B-210ENST00000512716 BAALC-AS2P0C853 105 aa12.76□□□□□ -0.37
RASGEF1B-210ENST00000512716 RBM3P98179 157 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
RASGEF1B-210ENST00000512716 ATXN8Q156A1 80 aa12.75□□□□□ -0.37
RASGEF1B-210ENST00000512716 Q75L30 129 aa12.75□□□□□ -0.37
RASGEF1B-210ENST00000512716 SIGMAR1Q99720 223 aa12.75□□□□□ -0.37
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RASGEF1B-210ENST00000512716 DSCR8Q96T75 97 aa12.73□□□□□ -0.37
RASGEF1B-210ENST00000512716 VPS25Q9BRG1 176 aa12.72□□□□□ -0.37
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RASGEF1B-210ENST00000512716 IGKV4-1P06312 121 aa12.7□□□□□ -0.38
RASGEF1B-210ENST00000512716 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa12.7□□□□□ -0.38
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa12.67□□□□□ -0.38
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RASGEF1B-210ENST00000512716 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa12.64□□□□□ -0.39
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RASGEF1B-210ENST00000512716 A8MUU9 505 aa12.61□□□□□ -0.39
RASGEF1B-210ENST00000512716 LINC00313P59037 77 aa12.6□□□□□ -0.39
RASGEF1B-210ENST00000512716 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa12.59□□□□□ -0.39
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RASGEF1B-210ENST00000512716 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa12.57□□□□□ -0.4
RASGEF1B-210ENST00000512716 COX6B2Q6YFQ2 88 aa12.54□□□□□ -0.4
RASGEF1B-210ENST00000512716 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa12.53□□□□□ -0.4
RASGEF1B-210ENST00000512716 C9orf118A6NHY6 69 aa12.53□□□□□ -0.4
RASGEF1B-210ENST00000512716 Q6ZQT0 140 aa12.53□□□□□ -0.4
RASGEF1B-210ENST00000512716 MT1HP80294 61 aa12.52□□□□□ -0.41
RASGEF1B-210ENST00000512716 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa12.51□□□□□ -0.41
RASGEF1B-210ENST00000512716 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa12.51□□□□□ -0.41
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa12.5□□□□□ -0.41
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