RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.92□□□□□ -1.14
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00575Q6W349 94 aa7.92□□□□□ -1.14
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00483Q53H64 154 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-204ENST00000503638 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-204ENST00000503638 H0YGX0 51 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-204ENST00000503638 TRIAP1O43715 76 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-204ENST00000503638 TSPAN13O95857 204 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-204ENST00000503638 COX6CP09669 75 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-204ENST00000503638 MOBPQ13875 183 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-204ENST00000503638 LRP2P98164 4655 aa7.88□□□□□ -1.15
PGGT1B-204ENST00000503638 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.88□□□□□ -1.15
PGGT1B-204ENST00000503638 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.88□□□□□ -1.15
PGGT1B-204ENST00000503638 Q6ZQY7 126 aa7.88□□□□□ -1.15
PGGT1B-204ENST00000503638 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.88□□□□□ -1.15
PGGT1B-204ENST00000503638 RNF213Q63HN8 5207 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-204ENST00000503638 CLEC2BQ92478 149 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-204ENST00000503638 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-204ENST00000503638 Q8NBF4 154 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-204ENST00000503638 TNXBP22105 4242 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-204ENST00000503638 F8WEM9 126 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-204ENST00000503638 DNAL4O96015 105 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-204ENST00000503638 SPRR1BP22528 89 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-204ENST00000503638 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-204ENST00000503638 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-204ENST00000503638 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-204ENST00000503638 Q8N377 158 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-204ENST00000503638 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PGGT1B-204ENST00000503638 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.8□□□□□ -1.16
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1B0GX51 115 aa7.79□□□□□ -1.16
PGGT1B-204ENST00000503638 FABP2P12104 132 aa7.79□□□□□ -1.16
PGGT1B-204ENST00000503638 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.79□□□□□ -1.16
PGGT1B-204ENST00000503638 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.78□□□□□ -1.16
PGGT1B-204ENST00000503638 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.78□□□□□ -1.16
PGGT1B-204ENST00000503638 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-204ENST00000503638 SMIM29Q86T20 159 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-204ENST00000503638 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-204ENST00000503638 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-204ENST00000503638 H3BUT2 72 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-204ENST00000503638 LST1O00453 97 aa7.74□□□□□ -1.17
PGGT1B-204ENST00000503638 SPINK1P00995 79 aa7.74□□□□□ -1.17
PGGT1B-204ENST00000503638 ATXN8Q156A1 80 aa7.74□□□□□ -1.17
PGGT1B-204ENST00000503638 PRR4Q16378 134 aa7.74□□□□□ -1.17
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1B0GV72 72 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-204ENST00000503638 TRACP01848 142 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A0G2JQZ4 141 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-204ENST00000503638 C9orf118A6NHY6 69 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-204ENST00000503638 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-204ENST00000503638 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-204ENST00000503638 H3BQ85 93 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-204ENST00000503638 TAX1BP3O14907 124 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-204ENST00000503638 TCL1BO95988 128 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-204ENST00000503638 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-204ENST00000503638 Q6JHZ5 121 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-204ENST00000503638 H3BMG7 143 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1W2PPM0 123 aa7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-204ENST00000503638 LIMD2Q9BT23 127 aa7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-204ENST00000503638 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-204ENST00000503638 LCE1DQ5T752 114 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-204ENST00000503638 IGFL1Q6UW32 110 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-204ENST00000503638 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-204ENST00000503638 CD164Q04900 197 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-204ENST00000503638 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-204ENST00000503638 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-204ENST00000503638 LCE4AQ5TA78 99 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-204ENST00000503638 C9JAW5 83 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-204ENST00000503638 UBE2V1Q13404 147 aa7.63□□□□□ -1.19
PGGT1B-204ENST00000503638 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.63□□□□□ -1.19
PGGT1B-204ENST00000503638 LPAP08519 4548 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-204ENST00000503638 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-204ENST00000503638 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-204ENST00000503638 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-204ENST00000503638 MTURNQ8N3F0 131 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-204ENST00000503638 DSCR8Q96T75 97 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-204ENST00000503638 VPS25Q9BRG1 176 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-204ENST00000503638 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-204ENST00000503638 TEN1Q86WV5 123 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-204ENST00000503638 CCKP06307 115 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-204ENST00000503638 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A087WSZ3 146 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-204ENST00000503638 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1W2PNM2 257 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-204ENST00000503638 H3BT86 120 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-204ENST00000503638 K7EP34 96 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-204ENST00000503638 Q5XG85 94 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-204ENST00000503638 Q6Q795 121 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-204ENST00000503638 CDIP1Q9H305 208 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-204ENST00000503638 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-204ENST00000503638 C1orf195Q5TG92 126 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1B-204ENST00000503638 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1B-204ENST00000503638 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.5□□□□□ -1.21
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