RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497815.5

CUX1-210, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

TSL 2

Gene CUX1, Length 947 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-210ENST00000497815 Q6ZQY7 126 aa7.03□□□□□ -1.28
CUX1-210ENST00000497815 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.03□□□□□ -1.28
CUX1-210ENST00000497815 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.03□□□□□ -1.28
CUX1-210ENST00000497815 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.02□□□□□ -1.29
CUX1-210ENST00000497815 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.02□□□□□ -1.29
CUX1-210ENST00000497815 SPRR1BP22528 89 aa7.01□□□□□ -1.29
CUX1-210ENST00000497815 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CUX1-210ENST00000497815 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7□□□□□ -1.29
CUX1-210ENST00000497815 MOBPQ13875 183 aa7□□□□□ -1.29
CUX1-210ENST00000497815 C9orf153Q5TBE3 101 aa7□□□□□ -1.29
CUX1-210ENST00000497815 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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CUX1-210ENST00000497815 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX1-210ENST00000497815 A0A1B0GX51 115 aa6.98□□□□□ -1.29
CUX1-210ENST00000497815 H3BUT2 72 aa6.98□□□□□ -1.29
CUX1-210ENST00000497815 TAX1BP3O14907 124 aa6.98□□□□□ -1.29
CUX1-210ENST00000497815 DNAL4O96015 105 aa6.97□□□□□ -1.29
CUX1-210ENST00000497815 SMIM29Q86T20 159 aa6.97□□□□□ -1.29
CUX1-210ENST00000497815 C9orf118A6NHY6 69 aa6.96□□□□□ -1.3
CUX1-210ENST00000497815 Q8NBF4 154 aa6.96□□□□□ -1.3
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CUX1-210ENST00000497815 LCE3BQ5TA77 95 aa6.95□□□□□ -1.3
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CUX1-210ENST00000497815 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.94□□□□□ -1.3
CUX1-210ENST00000497815 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.94□□□□□ -1.3
CUX1-210ENST00000497815 F8WEM9 126 aa6.93□□□□□ -1.3
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CUX1-210ENST00000497815 A0A1W2PPM0 123 aa6.92□□□□□ -1.3
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CUX1-210ENST00000497815 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.91□□□□□ -1.3
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CUX1-210ENST00000497815 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
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CUX1-210ENST00000497815 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.89□□□□□ -1.31
CUX1-210ENST00000497815 A0A1B0GV72 72 aa6.89□□□□□ -1.31
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CUX1-210ENST00000497815 H3BQ85 93 aa6.87□□□□□ -1.31
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CUX1-210ENST00000497815 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.86□□□□□ -1.31
CUX1-210ENST00000497815 C9JAW5 83 aa6.85□□□□□ -1.31
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CUX1-210ENST00000497815 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.84□□□□□ -1.31
CUX1-210ENST00000497815 SPINK1P00995 79 aa6.84□□□□□ -1.31
CUX1-210ENST00000497815 Q6JHZ5 121 aa6.84□□□□□ -1.31
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CUX1-210ENST00000497815 MTURNQ8N3F0 131 aa6.84□□□□□ -1.31
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CUX1-210ENST00000497815 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.76□□□□□ -1.33
CUX1-210ENST00000497815 DSCR8Q96T75 97 aa6.76□□□□□ -1.33
CUX1-210ENST00000497815 A0A1W2PNM2 257 aa6.75□□□□□ -1.33
CUX1-210ENST00000497815 TEN1Q86WV5 123 aa6.75□□□□□ -1.33
CUX1-210ENST00000497815 VPS25Q9BRG1 176 aa6.75□□□□□ -1.33
CUX1-210ENST00000497815 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.74□□□□□ -1.33
CUX1-210ENST00000497815 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.74□□□□□ -1.33
CUX1-210ENST00000497815 CCKP06307 115 aa6.74□□□□□ -1.33
CUX1-210ENST00000497815 Q6Q795 121 aa6.73□□□□□ -1.33
CUX1-210ENST00000497815 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.73□□□□□ -1.33
CUX1-210ENST00000497815 A0A087WSZ3 146 aa6.72□□□□□ -1.33
CUX1-210ENST00000497815 PRO0461Q9UI25 63 aa6.72□□□□□ -1.33
CUX1-210ENST00000497815 Q5XG85 94 aa6.71□□□□□ -1.34
CUX1-210ENST00000497815 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.71□□□□□ -1.34
CUX1-210ENST00000497815 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX1-210ENST00000497815 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX1-210ENST00000497815 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX1-210ENST00000497815 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX1-210ENST00000497815 A0A1B0GV90 55 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX1-210ENST00000497815 C1orf195Q5TG92 126 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX1-210ENST00000497815 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CUX1-210ENST00000497815 Q6ZQT0 140 aa6.68□□□□□ -1.34
CUX1-210ENST00000497815 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.68□□□□□ -1.34
CUX1-210ENST00000497815 F8W1H4 67 aa6.66□□□□□ -1.34
CUX1-210ENST00000497815 PDE6GP18545 87 aa6.66□□□□□ -1.34
CUX1-210ENST00000497815 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.66□□□□□ -1.34
CUX1-210ENST00000497815 TPRXLQ17RH7 258 aa6.61□□□□□ -1.35
CUX1-210ENST00000497815 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.61□□□□□ -1.35
CUX1-210ENST00000497815 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.61□□□□□ -1.35
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