RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 CLIP1P30622 1438 aa-1.38□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 NAP1L6A6NFF2 107 aa-1.38□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP-1.38□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 CHD1O14646 1710 aa-1.38□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 VPS13AQ96RL7 3174 aa-1.39□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 EEA1Q15075 1411 aa-1.39□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 LRRC37AA6NMS7 1700 aa-1.39□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa-1.39□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-1.39□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa-1.39□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 C12orf57Q99622 126 aa-1.39□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 ATP10BO94823 1461 aa-1.39□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 NRKQ7Z2Y5 1582 aa-1.39□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 MAPKBP1O60336 1514 aa-1.4□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 ARHGAP5Q13017 1502 aa-1.4□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-1.4□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 DEPDC5O75140 1603 aa-1.4□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa-1.4□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-1.4□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa-1.4□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 SPART-AS1P0CW21 52 aa-1.4□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-1.4□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 PREX1Q8TCU6 1659 aa-1.4□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-1.4□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa-1.4□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 LRRC7Q96NW7 1537 aa-1.4□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-1.41□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 CCDC141Q6ZP82 1450 aa-1.41□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-1.42□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 A0A1B0GU69 56 aa-1.42□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 DLEU1O43261 78 aa-1.42□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 MT-ATP8P03928 68 aa-1.42□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 IAPPP10997 89 aa-1.42□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-1.42□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 LINC00158P58513 81 aa-1.42□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 WT1-ASQ06250 92 aa-1.42□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-1.42□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 SVBPQ8N300 66 aa-1.42□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-1.42□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 UTRNP46939 3433 aa-1.42□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 A0A1B0GUL6 1792 aa-1.42□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 ERVK-7P63135 1459 aa-1.43□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 NCOA2Q15596 1464 aa-1.43□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 CLASP1Q7Z460 1538 aa-1.43□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-1.43□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 F8WEM9 126 aa-1.43□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 C3orf79P0CE67 100 aa-1.43□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 GNG4P50150 75 aa-1.43□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-1.43□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa-1.43□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 TEX14Q8IWB6 1497 aa-1.43□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 RGPD2P0DJD1 1756 aa-1.44□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-1.44□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-1.44□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 A0A1B0GV90 55 aa-1.44□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 C20orf202A1L168 122 aa-1.44□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa-1.44□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 H3BQ15 152 aa-1.44□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 PPP3R1P63098 170 aa-1.44□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 NMSQ5H8A3 153 aa-1.44□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 TTTY10Q9BZA0 68 aa-1.44□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 MLH3Q9UHC1 1453 aa-1.44□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-1.45□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 CORTO00230 105 aa-1.45□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 C6orf201Q7Z4U5 140 aa-1.45□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 DOT1LQ8TEK3 1739 aa-1.46□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 SAMD9Q5K651 1589 aa-1.46□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP-1.46□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 RGPD5Q99666 1765 aa-1.46□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 M0QY20 66 aa-1.46□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 COX7BP24311 80 aa-1.46□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-1.46□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 PZPP20742 1482 aa-1.46□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 NRXN1Q9ULB1 1477 aa-1.46□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 QSER1Q2KHR3 1735 aa-1.46□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 ABCA3Q99758 1704 aa-1.46□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 PLIN4Q96Q06 1357 aa-1.47□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 KIF1AQ12756 1690 aa-1.47□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 CD163L1Q9NR16 1453 aa-1.47□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa-1.47□□□□□ -2.64
ITGA4-211ENST00000490435 SHPRHQ149N8 1683 aa-1.48□□□□□ -2.65
ITGA4-211ENST00000490435 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
ITGA4-211ENST00000490435 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-1.48□□□□□ -2.65
ITGA4-211ENST00000490435 FAM135AQ9P2D6 1515 aa-1.48□□□□□ -2.65
ITGA4-211ENST00000490435 EFCAB10A6NFE3 127 aa-1.48□□□□□ -2.65
ITGA4-211ENST00000490435 IFI6P09912 130 aa-1.48□□□□□ -2.65
ITGA4-211ENST00000490435 SNCAP37840 140 aa-1.48□□□□□ -2.65
ITGA4-211ENST00000490435 HSD52Q0P140 79 aa-1.48□□□□□ -2.65
ITGA4-211ENST00000490435 TRGV9Q99603 122 aa-1.48□□□□□ -2.65
ITGA4-211ENST00000490435 CGREF1Q99674 301 aa-1.48□□□□□ -2.65
ITGA4-211ENST00000490435 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
ITGA4-211ENST00000490435 NESP48681 1621 aa-1.48□□□□□ -2.65
ITGA4-211ENST00000490435 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
ITGA4-211ENST00000490435 A0A0G2JND7 137 aa-1.49□□□□□ -2.65
ITGA4-211ENST00000490435 C7orf77A4D0Y5 90 aa-1.49□□□□□ -2.65
ITGA4-211ENST00000490435 PSMG4Q5JS54 123 aa-1.49□□□□□ -2.65
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