RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490088.2

HOXD10-202, Transcript of homeobox D10, humanhuman

TSL 2

Gene HOXD10, Length 1,010 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-202ENST00000490088 SMIM29Q86T20 159 aa12.62□□□□□ -0.39
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HOXD10-202ENST00000490088 LINC00304Q8N9R0 145 aa12.58□□□□□ -0.4
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HOXD10-202ENST00000490088 HERC1Q15751 4861 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXD10-202ENST00000490088 H3BUT2 72 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXD10-202ENST00000490088 LST1O00453 97 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXD10-202ENST00000490088 OCIAD2Q56VL3 154 aa12.56□□□□□ -0.4
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HOXD10-202ENST00000490088 UBE2V1Q13404 147 aa12.35□□□□□ -0.43
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HOXD10-202ENST00000490088 K7EP34 96 aa12.24□□□□□ -0.45
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HOXD10-202ENST00000490088 TEN1Q86WV5 123 aa12.21□□□□□ -0.45
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HOXD10-202ENST00000490088 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa12.19□□□□□ -0.46
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HOXD10-202ENST00000490088 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
HOXD10-202ENST00000490088 VPS25Q9BRG1 176 aa12.13□□□□□ -0.47
HOXD10-202ENST00000490088 PRO0461Q9UI25 63 aa12.13□□□□□ -0.47
HOXD10-202ENST00000490088 C1orf195Q5TG92 126 aa12.12□□□□□ -0.47
HOXD10-202ENST00000490088 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa12.12□□□□□ -0.47
HOXD10-202ENST00000490088 C14orf132Q9NPU4 83 aa12.11□□□□□ -0.47
HOXD10-202ENST00000490088 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa12.09□□□□□ -0.47
HOXD10-202ENST00000490088 SS18L2Q9UHA2 77 aa12.09□□□□□ -0.47
HOXD10-202ENST00000490088 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa12.08□□□□□ -0.48
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HOXD10-202ENST00000490088 LPAP08519 4548 aa12.07□□□□□ -0.48
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HOXD10-202ENST00000490088 TPRXLQ17RH7 258 aa12.03□□□□□ -0.48
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HOXD10-202ENST00000490088 UBR4Q5T4S7 5183 aa11.8□□□□□ -0.52
HOXD10-202ENST00000490088 J3KT08 172 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXD10-202ENST00000490088 DSCR10P59022 87 aa11.73□□□□□ -0.53
HOXD10-202ENST00000490088 LINC00846Q9NV44 126 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXD10-202ENST00000490088 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa11.71□□□□□ -0.53
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HOXD10-202ENST00000490088 A0A1B0GVX0 72 aa11.69□□□□□ -0.54
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