RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490081.5

HDAC1-210, Transcript of histone deacetylase 1, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC1, Length 1,047 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1-210ENST00000490081 Q6ZQY7 126 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC1-210ENST00000490081 BATFQ16520 125 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC1-210ENST00000490081 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC1-210ENST00000490081 Q8N377 158 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC1-210ENST00000490081 C9orf118A6NHY6 69 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC1-210ENST00000490081 TRACP01848 142 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC1-210ENST00000490081 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC1-210ENST00000490081 SMIM29Q86T20 159 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC1-210ENST00000490081 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC1-210ENST00000490081 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC1-210ENST00000490081 LST1O00453 97 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC1-210ENST00000490081 TAX1BP3O14907 124 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC1-210ENST00000490081 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC1-210ENST00000490081 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC1-210ENST00000490081 CLEC2BQ92478 149 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC1-210ENST00000490081 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC1-210ENST00000490081 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC1-210ENST00000490081 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC1-210ENST00000490081 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC1-210ENST00000490081 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC1-210ENST00000490081 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC1-210ENST00000490081 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC1-210ENST00000490081 H3BUT2 72 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC1-210ENST00000490081 DNAL4O96015 105 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC1-210ENST00000490081 Q8NBF4 154 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC1-210ENST00000490081 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC1-210ENST00000490081 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC1-210ENST00000490081 ATXN8Q156A1 80 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC1-210ENST00000490081 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC1-210ENST00000490081 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC1-210ENST00000490081 A0A1W2PPM0 123 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC1-210ENST00000490081 TCL1BO95988 128 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC1-210ENST00000490081 MOBPQ13875 183 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC1-210ENST00000490081 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HDAC1-210ENST00000490081 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC1-210ENST00000490081 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HDAC1-210ENST00000490081 F8WEM9 126 aa7.24□□□□□ -1.25
HDAC1-210ENST00000490081 FABP2P12104 132 aa7.24□□□□□ -1.25
HDAC1-210ENST00000490081 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
HDAC1-210ENST00000490081 CD164Q04900 197 aa7.24□□□□□ -1.25
HDAC1-210ENST00000490081 UBE2V1Q13404 147 aa7.24□□□□□ -1.25
HDAC1-210ENST00000490081 Q6JHZ5 121 aa7.24□□□□□ -1.25
HDAC1-210ENST00000490081 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.23□□□□□ -1.25
HDAC1-210ENST00000490081 SPINK1P00995 79 aa7.23□□□□□ -1.25
HDAC1-210ENST00000490081 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.23□□□□□ -1.25
HDAC1-210ENST00000490081 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC1-210ENST00000490081 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC1-210ENST00000490081 Q5XG85 94 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC1-210ENST00000490081 H3BMG7 143 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC1-210ENST00000490081 Q6Q795 121 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC1-210ENST00000490081 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC1-210ENST00000490081 IGFL1Q6UW32 110 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC1-210ENST00000490081 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC1-210ENST00000490081 C9JAW5 83 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC1-210ENST00000490081 H3BT86 120 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC1-210ENST00000490081 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC1-210ENST00000490081 K7EP34 96 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC1-210ENST00000490081 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HDAC1-210ENST00000490081 TEN1Q86WV5 123 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC1-210ENST00000490081 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC1-210ENST00000490081 LIMD2Q9BT23 127 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC1-210ENST00000490081 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC1-210ENST00000490081 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC1-210ENST00000490081 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC1-210ENST00000490081 A0A0G2JQZ4 141 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC1-210ENST00000490081 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC1-210ENST00000490081 PDE6GP18545 87 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC1-210ENST00000490081 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC1-210ENST00000490081 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HDAC1-210ENST00000490081 DSCR8Q96T75 97 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC1-210ENST00000490081 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.08□□□□□ -1.28
HDAC1-210ENST00000490081 A0A1B0GW54 56 aa7.08□□□□□ -1.28
HDAC1-210ENST00000490081 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.08□□□□□ -1.28
HDAC1-210ENST00000490081 PRO0461Q9UI25 63 aa7.08□□□□□ -1.28
HDAC1-210ENST00000490081 A0A1W2PNM2 257 aa7.07□□□□□ -1.28
HDAC1-210ENST00000490081 F8W1H4 67 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC1-210ENST00000490081 LRP2P98164 4655 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC1-210ENST00000490081 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC1-210ENST00000490081 CCKP06307 115 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC1-210ENST00000490081 Q6ZQT0 140 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC1-210ENST00000490081 C1orf195Q5TG92 126 aa7.02□□□□□ -1.29
HDAC1-210ENST00000490081 MTURNQ8N3F0 131 aa7.02□□□□□ -1.29
HDAC1-210ENST00000490081 RNF213Q63HN8 5207 aa7.01□□□□□ -1.29
HDAC1-210ENST00000490081 PRR4Q16378 134 aa7.01□□□□□ -1.29
HDAC1-210ENST00000490081 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.01□□□□□ -1.29
HDAC1-210ENST00000490081 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7□□□□□ -1.29
HDAC1-210ENST00000490081 A0A087WSZ3 146 aa7□□□□□ -1.29
HDAC1-210ENST00000490081 A0A1B0GV72 72 aa7□□□□□ -1.29
HDAC1-210ENST00000490081 C14orf132Q9NPU4 83 aa7□□□□□ -1.29
HDAC1-210ENST00000490081 TPRXLQ17RH7 258 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC1-210ENST00000490081 A0A1B0GV90 55 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC1-210ENST00000490081 Q96NJ1 140 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC1-210ENST00000490081 VPS25Q9BRG1 176 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC1-210ENST00000490081 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC1-210ENST00000490081 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC1-210ENST00000490081 ETDBQ3ZM63 59 aa6.92□□□□□ -1.3
HDAC1-210ENST00000490081 LPAP08519 4548 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC1-210ENST00000490081 J3KT08 172 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC1-210ENST00000490081 NREPQ16612 68 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC1-210ENST00000490081 IGKV4-1P06312 121 aa6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms