RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 K7EP34 96 aa-1.29□□□□□ -2.62
PTEN-204ENST00000487939 FAUP35544 74 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
PTEN-204ENST00000487939 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
PTEN-204ENST00000487939 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa-1.3□□□□□ -2.62
PTEN-204ENST00000487939 NDUFA3O95167 84 aa-1.3□□□□□ -2.62
PTEN-204ENST00000487939 DEFB1P60022 68 aa-1.3□□□□□ -2.62
PTEN-204ENST00000487939 ALKAL2Q6UX46 152 aa-1.3□□□□□ -2.62
PTEN-204ENST00000487939 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa-1.3□□□□□ -2.62
PTEN-204ENST00000487939 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-1.32□□□□□ -2.62
PTEN-204ENST00000487939 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-1.33□□□□□ -2.62
PTEN-204ENST00000487939 DEFB110Q30KQ9 67 aa-1.33□□□□□ -2.62
PTEN-204ENST00000487939 S4R3F8 94 aa-1.33□□□□□ -2.62
PTEN-204ENST00000487939 BPTFQ12830 3046 aa-1.33□□□□□ -2.62
PTEN-204ENST00000487939 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-1.34□□□□□ -2.62
PTEN-204ENST00000487939 DNAH17Q9UFH2 4485 aa-1.34□□□□□ -2.62
PTEN-204ENST00000487939 CSMD1Q96PZ7 3565 aa-1.34□□□□□ -2.62
PTEN-204ENST00000487939 UBR1Q8IWV7 1749 aa-1.34□□□□□ -2.62
PTEN-204ENST00000487939 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
PTEN-204ENST00000487939 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
PTEN-204ENST00000487939 MT1XP80297 61 aa-1.34□□□□□ -2.62
PTEN-204ENST00000487939 PLXNC1O60486 1568 aa-1.34□□□□□ -2.62
PTEN-204ENST00000487939 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-1.35□□□□□ -2.62
PTEN-204ENST00000487939 TEX14Q8IWB6 1497 aa-1.35□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-1.35□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 C14orf144Q96I85 54 aa-1.35□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 DNAH5Q8TE73 4624 aa-1.35□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP-1.35□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-1.36□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 NESP48681 1621 aa-1.36□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 LTN1O94822 1766 aa-1.36□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 LINC00032P0C843 101 aa-1.36□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 GAFA1Q96PS6 74 aa-1.36□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 CNTLNQ9NXG0 1405 aa-1.36□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 FANCAO15360 1455 aa-1.37□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa-1.37□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 IQCF6A8MYZ5 107 aa-1.37□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa-1.37□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 S100PP25815 95 aa-1.37□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-1.37□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 USP32Q8NFA0 1604 aa-1.37□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-1.38□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 A0A1B0GUT8 65 aa-1.38□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 TCEAL7Q9BRU2 100 aa-1.38□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 DPY30Q9C005 99 aa-1.38□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 MT1HL1P0DM35 61 aa-1.39□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 AKAP12Q02952 1782 aa-1.39□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 ATP10BO94823 1461 aa-1.4□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 ATP7BP35670 1465 aa-1.4□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 EYSQ5T1H1 3165 aa-1.4□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 WIZO95785 1651 aa-1.41□□□□□ -2.63
PTEN-204ENST00000487939 PRLHP81277 87 aa-1.41□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 PLGLAQ15195 96 aa-1.41□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-1.41□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 DOT1LQ8TEK3 1739 aa-1.41□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 DNAH10Q8IVF4 4471 aa-1.42□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-1.42□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 RBP2P50120 134 aa-1.42□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 NCMAPQ5T1S8 102 aa-1.42□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 DEPDC5O75140 1603 aa-1.42□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 NWD1Q149M9 1564 aa-1.42□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-1.43□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 PRO3102Q9H379 93 aa-1.43□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-1.43□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-1.44□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 CYB5AP00167 134 aa-1.44□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 PEA15Q15121 130 aa-1.44□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 WFDC9Q8NEX5 89 aa-1.44□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-1.44□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-1.45□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 PEG3Q9GZU2 1588 aa-1.45□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 TRAV21A0A0B4J279 112 aa-1.45□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 SMIM11AP58511 58 aa-1.45□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 LINC00158P58513 81 aa-1.45□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 ACBD7Q8N6N7 88 aa-1.45□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa-1.45□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-1.46□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 MT1EP04732 61 aa-1.46□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 ITPR2Q14571 2701 aa-1.46□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 MGAQ8IWI9 3026 aa-1.47□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 ZNF831Q5JPB2 1677 aa-1.47□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 ABCC10Q5T3U5 1492 aa-1.47□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 C3orf79P0CE67 100 aa-1.47□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 ITSN1Q15811 1721 aa-1.47□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-1.47□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa-1.47□□□□□ -2.64
PTEN-204ENST00000487939 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-1.48□□□□□ -2.65
PTEN-204ENST00000487939 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-1.48□□□□□ -2.65
PTEN-204ENST00000487939 C20orf78Q9BR46 151 aa-1.48□□□□□ -2.65
PTEN-204ENST00000487939 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
PTEN-204ENST00000487939 MT1LQ93083 61 aa-1.49□□□□□ -2.65
PTEN-204ENST00000487939 ATMQ13315 3056 aa-1.49□□□□□ -2.65
PTEN-204ENST00000487939 M0R143 59 aa-1.5□□□□□ -2.65
PTEN-204ENST00000487939 DEFB106AQ8N104 65 aa-1.5□□□□□ -2.65
PTEN-204ENST00000487939 LY75O60449 1722 aa-1.5□□□□□ -2.65
PTEN-204ENST00000487939 GYPAP02724 150 aa-1.51□□□□□ -2.65
PTEN-204ENST00000487939 CEP162Q5TB80 1403 aa-1.51□□□□□ -2.65
PTEN-204ENST00000487939 PLIN4Q96Q06 1357 aa-1.52□□□□□ -2.65
PTEN-204ENST00000487939 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-1.52□□□□□ -2.65
PTEN-204ENST00000487939 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-1.53□□□□□ -2.65
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