RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487935.1

OPTN-212, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 511 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-212ENST00000487935 COX6CP09669 75 aa7.03□□□□□ -1.28
OPTN-212ENST00000487935 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.03□□□□□ -1.28
OPTN-212ENST00000487935 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.03□□□□□ -1.28
OPTN-212ENST00000487935 LINC00483Q53H64 154 aa7.02□□□□□ -1.29
OPTN-212ENST00000487935 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
OPTN-212ENST00000487935 SNCGO76070 127 aa7.01□□□□□ -1.29
OPTN-212ENST00000487935 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.01□□□□□ -1.29
OPTN-212ENST00000487935 Q6ZQY7 126 aa7.01□□□□□ -1.29
OPTN-212ENST00000487935 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.01□□□□□ -1.29
OPTN-212ENST00000487935 CLEC2BQ92478 149 aa7.01□□□□□ -1.29
OPTN-212ENST00000487935 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.01□□□□□ -1.29
OPTN-212ENST00000487935 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
OPTN-212ENST00000487935 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7□□□□□ -1.29
OPTN-212ENST00000487935 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
OPTN-212ENST00000487935 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.99□□□□□ -1.29
OPTN-212ENST00000487935 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.99□□□□□ -1.29
OPTN-212ENST00000487935 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.99□□□□□ -1.29
OPTN-212ENST00000487935 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.99□□□□□ -1.29
OPTN-212ENST00000487935 SPRR1BP22528 89 aa6.98□□□□□ -1.29
OPTN-212ENST00000487935 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.98□□□□□ -1.29
OPTN-212ENST00000487935 A0A1B0GX51 115 aa6.97□□□□□ -1.29
OPTN-212ENST00000487935 DNAL4O96015 105 aa6.97□□□□□ -1.29
OPTN-212ENST00000487935 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
OPTN-212ENST00000487935 MOBPQ13875 183 aa6.97□□□□□ -1.29
OPTN-212ENST00000487935 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.97□□□□□ -1.29
OPTN-212ENST00000487935 Q8N377 158 aa6.96□□□□□ -1.3
OPTN-212ENST00000487935 H3BUT2 72 aa6.95□□□□□ -1.3
OPTN-212ENST00000487935 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.95□□□□□ -1.3
OPTN-212ENST00000487935 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
OPTN-212ENST00000487935 TAX1BP3O14907 124 aa6.94□□□□□ -1.3
OPTN-212ENST00000487935 Q8NBF4 154 aa6.94□□□□□ -1.3
OPTN-212ENST00000487935 C9orf118A6NHY6 69 aa6.93□□□□□ -1.3
OPTN-212ENST00000487935 F8WEM9 126 aa6.93□□□□□ -1.3
OPTN-212ENST00000487935 LST1O00453 97 aa6.93□□□□□ -1.3
OPTN-212ENST00000487935 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.93□□□□□ -1.3
OPTN-212ENST00000487935 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.93□□□□□ -1.3
OPTN-212ENST00000487935 SMIM29Q86T20 159 aa6.93□□□□□ -1.3
OPTN-212ENST00000487935 TRACP01848 142 aa6.92□□□□□ -1.3
OPTN-212ENST00000487935 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.92□□□□□ -1.3
OPTN-212ENST00000487935 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.92□□□□□ -1.3
OPTN-212ENST00000487935 TCL1BO95988 128 aa6.91□□□□□ -1.3
OPTN-212ENST00000487935 FABP2P12104 132 aa6.91□□□□□ -1.3
OPTN-212ENST00000487935 ATXN8Q156A1 80 aa6.91□□□□□ -1.3
OPTN-212ENST00000487935 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.91□□□□□ -1.3
OPTN-212ENST00000487935 A0A1W2PPM0 123 aa6.9□□□□□ -1.3
OPTN-212ENST00000487935 SPINK1P00995 79 aa6.9□□□□□ -1.3
OPTN-212ENST00000487935 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.89□□□□□ -1.31
OPTN-212ENST00000487935 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.87□□□□□ -1.31
OPTN-212ENST00000487935 H3BQ85 93 aa6.87□□□□□ -1.31
OPTN-212ENST00000487935 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
OPTN-212ENST00000487935 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.87□□□□□ -1.31
OPTN-212ENST00000487935 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.85□□□□□ -1.31
OPTN-212ENST00000487935 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.85□□□□□ -1.31
OPTN-212ENST00000487935 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.85□□□□□ -1.31
OPTN-212ENST00000487935 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.85□□□□□ -1.31
OPTN-212ENST00000487935 A0A0G2JQZ4 141 aa6.84□□□□□ -1.31
OPTN-212ENST00000487935 A0A1B0GV72 72 aa6.84□□□□□ -1.31
OPTN-212ENST00000487935 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.84□□□□□ -1.31
OPTN-212ENST00000487935 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
OPTN-212ENST00000487935 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
OPTN-212ENST00000487935 Q6JHZ5 121 aa6.84□□□□□ -1.31
OPTN-212ENST00000487935 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.83□□□□□ -1.32
OPTN-212ENST00000487935 C9JAW5 83 aa6.83□□□□□ -1.32
OPTN-212ENST00000487935 H3BMG7 143 aa6.83□□□□□ -1.32
OPTN-212ENST00000487935 UBE2V1Q13404 147 aa6.82□□□□□ -1.32
OPTN-212ENST00000487935 IGFL1Q6UW32 110 aa6.82□□□□□ -1.32
OPTN-212ENST00000487935 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.81□□□□□ -1.32
OPTN-212ENST00000487935 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.8□□□□□ -1.32
OPTN-212ENST00000487935 CD164Q04900 197 aa6.79□□□□□ -1.32
OPTN-212ENST00000487935 MTURNQ8N3F0 131 aa6.79□□□□□ -1.32
OPTN-212ENST00000487935 K7EP34 96 aa6.78□□□□□ -1.32
OPTN-212ENST00000487935 LIMD2Q9BT23 127 aa6.78□□□□□ -1.32
OPTN-212ENST00000487935 H3BT86 120 aa6.77□□□□□ -1.33
OPTN-212ENST00000487935 LCE2BO14633 110 aa6.76□□□□□ -1.33
OPTN-212ENST00000487935 XP32Q5T750 250 aa6.76□□□□□ -1.33
OPTN-212ENST00000487935 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.75□□□□□ -1.33
OPTN-212ENST00000487935 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
OPTN-212ENST00000487935 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.75□□□□□ -1.33
OPTN-212ENST00000487935 DSCR8Q96T75 97 aa6.74□□□□□ -1.33
OPTN-212ENST00000487935 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.73□□□□□ -1.33
OPTN-212ENST00000487935 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.73□□□□□ -1.33
OPTN-212ENST00000487935 SVIPQ8NHG7 77 aa6.73□□□□□ -1.33
OPTN-212ENST00000487935 TEN1Q86WV5 123 aa6.72□□□□□ -1.33
OPTN-212ENST00000487935 VPS25Q9BRG1 176 aa6.72□□□□□ -1.33
OPTN-212ENST00000487935 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.71□□□□□ -1.34
OPTN-212ENST00000487935 A0A1W2PNM2 257 aa6.71□□□□□ -1.34
OPTN-212ENST00000487935 CCKP06307 115 aa6.71□□□□□ -1.34
OPTN-212ENST00000487935 Q6Q795 121 aa6.71□□□□□ -1.34
OPTN-212ENST00000487935 A0A087WSZ3 146 aa6.7□□□□□ -1.34
OPTN-212ENST00000487935 Q5XG85 94 aa6.7□□□□□ -1.34
OPTN-212ENST00000487935 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.7□□□□□ -1.34
OPTN-212ENST00000487935 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.69□□□□□ -1.34
OPTN-212ENST00000487935 PRO0461Q9UI25 63 aa6.69□□□□□ -1.34
OPTN-212ENST00000487935 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.67□□□□□ -1.34
OPTN-212ENST00000487935 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.67□□□□□ -1.34
OPTN-212ENST00000487935 PDE6GP18545 87 aa6.66□□□□□ -1.34
OPTN-212ENST00000487935 Q6ZQT0 140 aa6.66□□□□□ -1.34
OPTN-212ENST00000487935 A0A1B0GV90 55 aa6.65□□□□□ -1.34
OPTN-212ENST00000487935 LCE2CQ5TA81 110 aa6.65□□□□□ -1.34
OPTN-212ENST00000487935 C1orf195Q5TG92 126 aa6.65□□□□□ -1.34
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