RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00474Q9P2X8 69 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 PKIGQ9Y2B9 76 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 H0Y9J4 135 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFC2O95298 119 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 RAB37Q96AX2 223 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 COPS9Q8WXC6 57 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 SNHG12Q9BXW3 62 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 FAT1Q14517 4588 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 HSPG2P98160 4391 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 M0R143 59 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 IGLV6-57P01721 117 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 PRLHP81277 87 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 C1orf137Q5JT78 98 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 SMIM11BQ8TCY0 68 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM126AQ9H061 195 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 PRO1854Q9UHT4 67 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0B4J2C4 111 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 C6orf99Q4VX62 202 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 PSMB2P49721 201 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 KCNQ1DNQ9H478 68 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 H3BUT2 72 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 TAX1BP3O14907 124 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 BCE1O60756 84 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 SCGB1C2P0DMR2 95 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 COX7BP24311 80 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 UBE2AP49459 152 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 Q5VSD8 79 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 CLEC2BQ92478 149 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 DIRC1Q969H9 104 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 HIGD2AQ9BW72 106 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA1109Q2LD37 5005 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 ERC2-IT1O76042 136 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 IGLV7-43P04211 117 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 SPRR1AP35321 89 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 RPL28P46779 137 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 SMCR5Q8TEV8 140 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 Q9BRP9 147 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 RYR1P21817 5038 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF861PO60384 105 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 VAMP3Q15836 100 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZRX8 168 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 DEFB105AQ8NG35 78 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 TCL1BO95988 128 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00575Q6W349 94 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 BIRC6Q9NR09 4857 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PPM0 123 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 hADV29S1A0JD25 119 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 H0YGX0 51 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 COX6CP09669 75 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 CBY1Q9Y3M2 126 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 SLC25A20O43772 301 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 SPINK6Q6UWN8 80 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZQY7 126 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 C3orf22Q8N5N4 141 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1B0GV72 72 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1B0GV90 55 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 H3BMG7 143 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 LST1O00453 97 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 INAFM2P0DMQ5 153 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 FABP2P12104 132 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 SPRR4Q96PI1 79 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 SPCS1Q9Y6A9 102 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0G2JQZ4 141 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 DNAL4O96015 105 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 ATXN8Q156A1 80 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 HERC2O95714 4834 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 C9JAW5 83 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 K7EP34 96 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 SNCGO76070 127 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 TRACP01848 142 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 BAALC-AS2P0C853 105 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 LYRM7Q5U5X0 104 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1B0GX51 115 aa2.74□□□□□ -1.97
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