RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CELSR2Q9HCU4 2923 aa10.71□□□□□ -0.7
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLAC8Q9NZF1 115 aa10.11□□□□□ -0.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa10.1□□□□□ -0.79
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RELNP78509 3460 aa10.07□□□□□ -0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q75L30 129 aa10.06□□□□□ -0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPRR1BP22528 89 aa10.05□□□□□ -0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PANO1I0J062 215 aa10.05□□□□□ -0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LAMA5O15230 3695 aa10.04□□□□□ -0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q5XG85 94 aa10.03□□□□□ -0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H3BS24 57 aa10□□□□□ -0.81
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MXRA5Q9NR99 2828 aa10□□□□□ -0.81
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OXTP01178 125 aa9.97□□□□□ -0.81
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1B0GU33 70 aa9.96□□□□□ -0.81
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.95□□□□□ -0.82
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRAC1Q96KF2 57 aa9.94□□□□□ -0.82
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q5W150 140 aa9.93□□□□□ -0.82
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP10-1P60331 282 aa9.93□□□□□ -0.82
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