RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481414.5

KCNS3-205, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, human

TSL 4

Gene KCNS3, Length 560 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCNS3-205	ENST00000481414	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		14.2	□□□□□ -0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		14.2	□□□□□ -0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		14.18	□□□□□ -0.14
KCNS3-205	ENST00000481414		Q8NBF4	154 aa		14.18	□□□□□ -0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		14.15	□□□□□ -0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	GHRH	P01286	108 aa		14.14	□□□□□ -0.15
KCNS3-205	ENST00000481414	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		14.14	□□□□□ -0.15
KCNS3-205	ENST00000481414	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	14.13	□□□□□ -0.15
KCNS3-205	ENST00000481414	LST1	O00453	97 aa		14.12	□□□□□ -0.15
KCNS3-205	ENST00000481414	DNAL4	O96015	105 aa		14.12	□□□□□ -0.15
KCNS3-205	ENST00000481414	TRAC	P01848	142 aa		14.11	□□□□□ -0.15
KCNS3-205	ENST00000481414	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		14.11	□□□□□ -0.15
KCNS3-205	ENST00000481414	TAX1BP3	O14907	124 aa		14.09	□□□□□ -0.15
KCNS3-205	ENST00000481414	C9orf118	A6NHY6	69 aa		14.08	□□□□□ -0.16
KCNS3-205	ENST00000481414	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		14.08	□□□□□ -0.16
KCNS3-205	ENST00000481414		F8WEM9	126 aa		14.08	□□□□□ -0.16
KCNS3-205	ENST00000481414		H3BQ85	93 aa		14.07	□□□□□ -0.16
KCNS3-205	ENST00000481414		H3BUT2	72 aa		14.07	□□□□□ -0.16
KCNS3-205	ENST00000481414	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		14.07	□□□□□ -0.16
KCNS3-205	ENST00000481414	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		14.07	□□□□□ -0.16
KCNS3-205	ENST00000481414	SPINK1	P00995	79 aa		14.06	□□□□□ -0.16
KCNS3-205	ENST00000481414	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		14.05	□□□□□ -0.16
KCNS3-205	ENST00000481414	TCL1B	O95988	128 aa		14.03	□□□□□ -0.16
KCNS3-205	ENST00000481414	ATXN8	Q156A1	80 aa		14.03	□□□□□ -0.16
KCNS3-205	ENST00000481414	FABP2	P12104	132 aa		14.02	□□□□□ -0.17
KCNS3-205	ENST00000481414	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	14.02	□□□□□ -0.17
KCNS3-205	ENST00000481414	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		14.02	□□□□□ -0.17
KCNS3-205	ENST00000481414	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		14	□□□□□ -0.17
KCNS3-205	ENST00000481414	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		14	□□□□□ -0.17
KCNS3-205	ENST00000481414	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
KCNS3-205	ENST00000481414		Q6JHZ5	121 aa		14	□□□□□ -0.17
KCNS3-205	ENST00000481414	CD164	Q04900	197 aa		13.99	□□□□□ -0.17
KCNS3-205	ENST00000481414		A0A1W2PPM0	123 aa		13.98	□□□□□ -0.17
KCNS3-205	ENST00000481414		A0A0G2JQZ4	141 aa		13.94	□□□□□ -0.18
KCNS3-205	ENST00000481414	UBE2V1	Q13404	147 aa		13.94	□□□□□ -0.18
KCNS3-205	ENST00000481414	IGFL1	Q6UW32	110 aa		13.94	□□□□□ -0.18
KCNS3-205	ENST00000481414		H3BMG7	143 aa		13.93	□□□□□ -0.18
KCNS3-205	ENST00000481414	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		13.93	□□□□□ -0.18
KCNS3-205	ENST00000481414	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		13.92	□□□□□ -0.18
KCNS3-205	ENST00000481414	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		13.92	□□□□□ -0.18
KCNS3-205	ENST00000481414	LIMD2	Q9BT23	127 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KCNS3-205	ENST00000481414	PRR4	Q16378	134 aa		13.85	□□□□□ -0.19
KCNS3-205	ENST00000481414		Q5XG85	94 aa		13.85	□□□□□ -0.19
KCNS3-205	ENST00000481414	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		13.85	□□□□□ -0.19
KCNS3-205	ENST00000481414	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		13.85	□□□□□ -0.19
KCNS3-205	ENST00000481414		C9JAW5	83 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KCNS3-205	ENST00000481414	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KCNS3-205	ENST00000481414		Q6Q795	121 aa		13.81	□□□□□ -0.2
KCNS3-205	ENST00000481414	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KCNS3-205	ENST00000481414	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
KCNS3-205	ENST00000481414	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
KCNS3-205	ENST00000481414	TEN1	Q86WV5	123 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KCNS3-205	ENST00000481414		A0A1B0GV72	72 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KCNS3-205	ENST00000481414	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KCNS3-205	ENST00000481414		H3BT86	120 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KCNS3-205	ENST00000481414	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KCNS3-205	ENST00000481414		A0A1W2PNM2	257 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KCNS3-205	ENST00000481414	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KCNS3-205	ENST00000481414	DSCR8	Q96T75	97 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KCNS3-205	ENST00000481414		K7EP34	96 aa		13.71	□□□□□ -0.21
KCNS3-205	ENST00000481414	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		13.7	□□□□□ -0.22
KCNS3-205	ENST00000481414	MTURN	Q8N3F0	131 aa		13.68	□□□□□ -0.22
KCNS3-205	ENST00000481414	CCK	P06307	115 aa		13.67	□□□□□ -0.22
KCNS3-205	ENST00000481414	C1orf195	Q5TG92	126 aa		13.67	□□□□□ -0.22
KCNS3-205	ENST00000481414	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		13.67	□□□□□ -0.22
KCNS3-205	ENST00000481414	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		13.66	□□□□□ -0.22
KCNS3-205	ENST00000481414	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		13.65	□□□□□ -0.22
KCNS3-205	ENST00000481414		A0A087WSZ3	146 aa		13.64	□□□□□ -0.23
KCNS3-205	ENST00000481414	LPA	P08519	4548 aa		13.63	□□□□□ -0.23
KCNS3-205	ENST00000481414	LRP2	P98164	4655 aa		13.63	□□□□□ -0.23
KCNS3-205	ENST00000481414	TPRXL	Q17RH7	258 aa		13.63	□□□□□ -0.23
KCNS3-205	ENST00000481414	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KCNS3-205	ENST00000481414	PDE6G	P18545	87 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KCNS3-205	ENST00000481414	PRO0461	Q9UI25	63 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KCNS3-205	ENST00000481414	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
KCNS3-205	ENST00000481414		Q6ZQT0	140 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KCNS3-205	ENST00000481414	VPS25	Q9BRG1	176 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KCNS3-205	ENST00000481414	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KCNS3-205	ENST00000481414	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KCNS3-205	ENST00000481414		A0A1B0GW54	56 aa		13.52	□□□□□ -0.25
KCNS3-205	ENST00000481414		F8W1H4	67 aa		13.5	□□□□□ -0.25
KCNS3-205	ENST00000481414	CDIP1	Q9H305	208 aa		13.5	□□□□□ -0.25
KCNS3-205	ENST00000481414		Q96NJ1	140 aa		13.48	□□□□□ -0.25
KCNS3-205	ENST00000481414	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		13.43	□□□□□ -0.26
KCNS3-205	ENST00000481414	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		13.39	□□□□□ -0.27
KCNS3-205	ENST00000481414	C9orf92	A6NGG3	77 aa		13.37	□□□□□ -0.27
KCNS3-205	ENST00000481414		A0A1B0GV90	55 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KCNS3-205	ENST00000481414	IGKV4-1	P06312	121 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KCNS3-205	ENST00000481414	ETDB	Q3ZM63	59 aa		13.34	□□□□□ -0.27
KCNS3-205	ENST00000481414	XP32	Q5T750	250 aa		13.34	□□□□□ -0.27
KCNS3-205	ENST00000481414	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		13.33	□□□□□ -0.28
KCNS3-205	ENST00000481414	SIGMAR1	Q99720	223 aa		13.33	□□□□□ -0.28
KCNS3-205	ENST00000481414		J3KT08	172 aa		13.3	□□□□□ -0.28
KCNS3-205	ENST00000481414	NREP	Q16612	68 aa		13.29	□□□□□ -0.28
KCNS3-205	ENST00000481414	MUC17	Q685J3	4493 aa		13.24	□□□□□ -0.29
KCNS3-205	ENST00000481414	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
KCNS3-205	ENST00000481414		A0A1B0GVX0	72 aa		13.17	□□□□□ -0.3
KCNS3-205	ENST00000481414	LINC00313	P59037	77 aa		13.17	□□□□□ -0.3
KCNS3-205	ENST00000481414	DSCR10	P59022	87 aa		13.16	□□□□□ -0.3

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