RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 Q8N377 158 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRD-210ENST00000481079 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRD-210ENST00000481079 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRD-210ENST00000481079 H0YGX0 51 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRD-210ENST00000481079 K7ERJ3 54 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRD-210ENST00000481079 Q6ZQY7 126 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRD-210ENST00000481079 SNCGO76070 127 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRD-210ENST00000481079 SMIM29Q86T20 159 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRD-210ENST00000481079 FAT4Q6V0I7 4981 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRD-210ENST00000481079 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
PTPRD-210ENST00000481079 TSTD3H0UI37 97 aa13.4□□□□□ -0.26
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PTPRD-210ENST00000481079 FAM218AQ96MZ4 157 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRD-210ENST00000481079 M0R143 59 aa13.36□□□□□ -0.27
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PTPRD-210ENST00000481079 HRCT1Q6UXD1 115 aa13.3□□□□□ -0.28
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PTPRD-210ENST00000481079 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRD-210ENST00000481079 GHRHP01286 108 aa13.27□□□□□ -0.29
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PTPRD-210ENST00000481079 LIMD2Q9BT23 127 aa13.25□□□□□ -0.29
PTPRD-210ENST00000481079 CD164Q04900 197 aa13.24□□□□□ -0.29
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PTPRD-210ENST00000481079 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRD-210ENST00000481079 DNAL4O96015 105 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa13.2□□□□□ -0.3
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PTPRD-210ENST00000481079 BATFQ16520 125 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRD-210ENST00000481079 Q6JHZ5 121 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRD-210ENST00000481079 H3BQ85 93 aa13.18□□□□□ -0.3
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PTPRD-210ENST00000481079 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
PTPRD-210ENST00000481079 Q5XG85 94 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRD-210ENST00000481079 ORMDL1Q9P0S3 153 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRD-210ENST00000481079 H3BUT2 72 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRD-210ENST00000481079 IGFL1Q6UW32 110 aa13.15□□□□□ -0.3
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PTPRD-210ENST00000481079 H3BMG7 143 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRD-210ENST00000481079 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa13.09□□□□□ -0.31
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PTPRD-210ENST00000481079 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa13.04□□□□□ -0.32
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PTPRD-210ENST00000481079 TEN1Q86WV5 123 aa12.97□□□□□ -0.33
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PTPRD-210ENST00000481079 C9JAW5 83 aa12.86□□□□□ -0.35
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PTPRD-210ENST00000481079 Q6ZQT0 140 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRD-210ENST00000481079 C14orf132Q9NPU4 83 aa12.68□□□□□ -0.38
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PTPRD-210ENST00000481079 A0A1B0GW54 56 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRD-210ENST00000481079 IGKV4-1P06312 121 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRD-210ENST00000481079 LINC00472Q9H8W2 130 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRD-210ENST00000481079 DEFB116Q30KQ4 102 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRD-210ENST00000481079 K7EP34 96 aa12.61□□□□□ -0.39
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