RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		8.43	□□□□□ -1.06
PTPA-222	ENST00000445241	TAX1BP3	O14907	124 aa		8.41	□□□□□ -1.06
PTPA-222	ENST00000445241	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	8.41	□□□□□ -1.06
PTPA-222	ENST00000445241	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		8.41	□□□□□ -1.06
PTPA-222	ENST00000445241	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		8.41	□□□□□ -1.06
PTPA-222	ENST00000445241	C9orf118	A6NHY6	69 aa		8.4	□□□□□ -1.06
PTPA-222	ENST00000445241		H7C2G1	150 aa		8.4	□□□□□ -1.06
PTPA-222	ENST00000445241	PRR4	Q16378	134 aa		8.4	□□□□□ -1.06
PTPA-222	ENST00000445241		Q1RN00	199 aa		8.4	□□□□□ -1.06
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1B0GX51	115 aa		8.39	□□□□□ -1.07
PTPA-222	ENST00000445241		Q6ZQY7	126 aa		8.39	□□□□□ -1.07
PTPA-222	ENST00000445241	SMIM29	Q86T20	159 aa		8.39	□□□□□ -1.07
PTPA-222	ENST00000445241		Q8N377	158 aa		8.39	□□□□□ -1.07
PTPA-222	ENST00000445241	UBE2V1	Q13404	147 aa		8.38	□□□□□ -1.07
PTPA-222	ENST00000445241	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		8.38	□□□□□ -1.07
PTPA-222	ENST00000445241	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		8.38	□□□□□ -1.07
PTPA-222	ENST00000445241	CD164	Q04900	197 aa		8.37	□□□□□ -1.07
PTPA-222	ENST00000445241	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	8.37	□□□□□ -1.07
PTPA-222	ENST00000445241		F8WEM9	126 aa		8.35	□□□□□ -1.07
PTPA-222	ENST00000445241	GHRH	P01286	108 aa		8.35	□□□□□ -1.07
PTPA-222	ENST00000445241	TRIAP1	O43715	76 aa		8.33	□□□□□ -1.08
PTPA-222	ENST00000445241	COX6C	P09669	75 aa		8.33	□□□□□ -1.08
PTPA-222	ENST00000445241	FABP2	P12104	132 aa		8.33	□□□□□ -1.08
PTPA-222	ENST00000445241	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		8.33	□□□□□ -1.08
PTPA-222	ENST00000445241	LIMD2	Q9BT23	127 aa		8.33	□□□□□ -1.08
PTPA-222	ENST00000445241	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		8.32	□□□□□ -1.08
PTPA-222	ENST00000445241	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		8.32	□□□□□ -1.08
PTPA-222	ENST00000445241	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		8.31	□□□□□ -1.08
PTPA-222	ENST00000445241	TPRXL	Q17RH7	258 aa		8.31	□□□□□ -1.08
PTPA-222	ENST00000445241		Q6JHZ5	121 aa		8.31	□□□□□ -1.08
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PPM0	123 aa		8.3	□□□□□ -1.08
PTPA-222	ENST00000445241		H3BQ85	93 aa		8.3	□□□□□ -1.08
PTPA-222	ENST00000445241		H3BUT2	72 aa		8.3	□□□□□ -1.08
PTPA-222	ENST00000445241		K7ERJ3	54 aa		8.3	□□□□□ -1.08
PTPA-222	ENST00000445241		Q5XG85	94 aa		8.3	□□□□□ -1.08
PTPA-222	ENST00000445241	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		8.3	□□□□□ -1.08
PTPA-222	ENST00000445241	LRP2	P98164	4655 aa		8.3	□□□□□ -1.08
PTPA-222	ENST00000445241	PSMB2	P49721	201 aa		8.29	□□□□□ -1.08
PTPA-222	ENST00000445241		K7EP34	96 aa		8.27	□□□□□ -1.09
PTPA-222	ENST00000445241	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	8.26	□□□□□ -1.09
PTPA-222	ENST00000445241	CLEC2B	Q92478	149 aa		8.26	□□□□□ -1.09
PTPA-222	ENST00000445241	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		8.25	□□□□□ -1.09
PTPA-222	ENST00000445241	DNAL4	O96015	105 aa		8.25	□□□□□ -1.09
PTPA-222	ENST00000445241	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		8.25	□□□□□ -1.09
PTPA-222	ENST00000445241		F8W1H4	67 aa		8.23	□□□□□ -1.09
PTPA-222	ENST00000445241	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		8.23	□□□□□ -1.09
PTPA-222	ENST00000445241	TRAC	P01848	142 aa		8.22	□□□□□ -1.09
PTPA-222	ENST00000445241	IGFL1	Q6UW32	110 aa		8.22	□□□□□ -1.09
PTPA-222	ENST00000445241	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		8.22	□□□□□ -1.09
PTPA-222	ENST00000445241	TCL1B	O95988	128 aa		8.21	□□□□□ -1.1
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	8.21	□□□□□ -1.1
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		8.2	□□□□□ -1.1
PTPA-222	ENST00000445241	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		8.2	□□□□□ -1.1
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		8.2	□□□□□ -1.1
PTPA-222	ENST00000445241	CDIP1	Q9H305	208 aa		8.2	□□□□□ -1.1
PTPA-222	ENST00000445241	LST1	O00453	97 aa		8.19	□□□□□ -1.1
PTPA-222	ENST00000445241	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		8.19	□□□□□ -1.1
PTPA-222	ENST00000445241	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		8.18	□□□□□ -1.1
PTPA-222	ENST00000445241		Q6Q795	121 aa		8.18	□□□□□ -1.1
PTPA-222	ENST00000445241	LPA	P08519	4548 aa		8.17	□□□□□ -1.1
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0G2JQZ4	141 aa		8.17	□□□□□ -1.1
PTPA-222	ENST00000445241		H3BMG7	143 aa		8.16	□□□□□ -1.1
PTPA-222	ENST00000445241	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		8.16	□□□□□ -1.1
PTPA-222	ENST00000445241	C1orf195	Q5TG92	126 aa		8.15	□□□□□ -1.1
PTPA-222	ENST00000445241	TEN1	Q86WV5	123 aa		8.15	□□□□□ -1.1
PTPA-222	ENST00000445241		K7ERU9	68 aa		8.14	□□□□□ -1.11
PTPA-222	ENST00000445241	LCE2C	Q5TA81	110 aa		8.14	□□□□□ -1.11
PTPA-222	ENST00000445241		J3QR89	54 aa		8.12	□□□□□ -1.11
PTPA-222	ENST00000445241	ATXN8	Q156A1	80 aa		8.12	□□□□□ -1.11
PTPA-222	ENST00000445241	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	8.12	□□□□□ -1.11
PTPA-222	ENST00000445241	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		8.12	□□□□□ -1.11
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		8.09	□□□□□ -1.11
PTPA-222	ENST00000445241	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		8.07	□□□□□ -1.12
PTPA-222	ENST00000445241	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		8.07	□□□□□ -1.12
PTPA-222	ENST00000445241	XP32	Q5T750	250 aa		8.07	□□□□□ -1.12
PTPA-222	ENST00000445241	PRO0461	Q9UI25	63 aa		8.06	□□□□□ -1.12
PTPA-222	ENST00000445241	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	8.05	□□□□□ -1.12
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PNM2	257 aa		8.04	□□□□□ -1.12
PTPA-222	ENST00000445241	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	8.04	□□□□□ -1.12
PTPA-222	ENST00000445241		A0A087WSZ3	146 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PTPA-222	ENST00000445241		H3BT86	120 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PTPA-222	ENST00000445241	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		8.02	□□□□□ -1.13
PTPA-222	ENST00000445241	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		8.02	□□□□□ -1.13
PTPA-222	ENST00000445241	DSCR8	Q96T75	97 aa		8.02	□□□□□ -1.13
PTPA-222	ENST00000445241	CCK	P06307	115 aa		8.01	□□□□□ -1.13
PTPA-222	ENST00000445241	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	7.99	□□□□□ -1.13
PTPA-222	ENST00000445241	ETDB	Q3ZM63	59 aa		7.99	□□□□□ -1.13
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1B0GV72	72 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PTPA-222	ENST00000445241	C9orf92	A6NGG3	77 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PTPA-222	ENST00000445241		C9JAW5	83 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PTPA-222	ENST00000445241	PDE6G	P18545	87 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0U1RQV1	116 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1B0GW54	56 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PTPA-222	ENST00000445241		Q96NJ1	140 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PTPA-222	ENST00000445241	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		7.95	□□□□□ -1.14
PTPA-222	ENST00000445241	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		7.94	□□□□□ -1.14
PTPA-222	ENST00000445241	RNF213	Q63HN8	5207 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPA-222	ENST00000445241		Q6ZQT0	140 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPA-222	ENST00000445241	VPS25	Q9BRG1	176 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		7.91	□□□□□ -1.14

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