RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 H3BNG1 76 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-209ENST00000442510 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-209ENST00000442510 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-209ENST00000442510 R4GN34 69 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-209ENST00000442510 SPRR1BP22528 89 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-209ENST00000442510 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-209ENST00000442510 Q6ZSA8 131 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-209ENST00000442510 BRCA2P51587 3418 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-209ENST00000442510 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-209ENST00000442510 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-209ENST00000442510 H0YAA0 97 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-209ENST00000442510 LAMA3Q16787 3333 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-209ENST00000442510 BPTFQ12830 3046 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-209ENST00000442510 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-209ENST00000442510 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-209ENST00000442510 EPG5Q9HCE0 2579 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PPR1 153 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-209ENST00000442510 PP632Q6XCG6 107 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-209ENST00000442510 HECTD1Q9ULT8 2610 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-209ENST00000442510 USP34Q70CQ2 3546 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-209ENST00000442510 SMR3AQ99954 134 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-209ENST00000442510 TRANK1O15050 2925 aa3.15□□□□□ -1.9
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP10-9P60411 292 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-209ENST00000442510 S4R3F8 94 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-209ENST00000442510 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-209ENST00000442510 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-209ENST00000442510 SZT2Q5T011 3432 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-209ENST00000442510 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-209ENST00000442510 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-209ENST00000442510 C9orf92A6NGG3 77 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-209ENST00000442510 VCANP13611 3396 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-209ENST00000442510 DNAH12Q6ZR08 3092 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-209ENST00000442510 TPRXLQ17RH7 258 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-209ENST00000442510 CEP295Q9C0D2 2601 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-209ENST00000442510 HTTP42858 3142 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-209ENST00000442510 MGAQ8IWI9 3026 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-209ENST00000442510 EYSQ5T1H1 3165 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-209ENST00000442510 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-209ENST00000442510 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-209ENST00000442510 CDH23Q9H251 3354 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-209ENST00000442510 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-209ENST00000442510 COL6A3P12111 3177 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-209ENST00000442510 UNC80Q8N2C7 3258 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-209ENST00000442510 UNC79Q9P2D8 2635 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-209ENST00000442510 INE1O15225 51 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-209ENST00000442510 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-209ENST00000442510 ITPR1Q14643 2758 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-209ENST00000442510 M0QZ58 72 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP10-8P60410 259 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-209ENST00000442510 CENPEQ02224 2701 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-209ENST00000442510 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-209ENST00000442510 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-209ENST00000442510 XIRP2A4UGR9 3374 aa3.02□□□□□ -1.93
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PTPRC-209ENST00000442510 FREM2Q5SZK8 3169 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-209ENST00000442510 ITPR3Q14573 2671 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-209ENST00000442510 MYO15AQ9UKN7 3530 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-209ENST00000442510 MUC3AQ02505 3323 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-209ENST00000442510 DNAH14Q0VDD8 3507 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-209ENST00000442510 CHD6Q8TD26 2715 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-209ENST00000442510 C5orf42Q9H799 3197 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-209ENST00000442510 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-209ENST00000442510 DSPP15924 2871 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-209ENST00000442510 CFAP46Q8IYW2 2715 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-209ENST00000442510 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-209ENST00000442510 AKAP13Q12802 2813 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-209ENST00000442510 MGAM2Q2M2H8 2515 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-209ENST00000442510 REV3LO60673 3130 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-209ENST00000442510 SPEGQ15772 3267 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-209ENST00000442510 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-209ENST00000442510 WDFY4Q6ZS81 3184 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-209ENST00000442510 LRBAP50851 2863 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-209ENST00000442510 CFAP54Q96N23 3096 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-209ENST00000442510 ZFHX3Q15911 3703 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-209ENST00000442510 MAST4O15021 2626 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-209ENST00000442510 ATRQ13535 2644 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-209ENST00000442510 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-209ENST00000442510 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-209ENST00000442510 TNP1P09430 55 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-209ENST00000442510 CHD7Q9P2D1 2997 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-209ENST00000442510 STAB2Q8WWQ8 2551 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-209ENST00000442510 TRIOO75962 3097 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-209ENST00000442510 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-209ENST00000442510 VPS13AQ96RL7 3174 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-209ENST00000442510 NOTCH1P46531 2555 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-209ENST00000442510 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-209ENST00000442510 NBEAQ8NFP9 2946 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-209ENST00000442510 CELSR2Q9HCU4 2923 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-209ENST00000442510 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-209ENST00000442510 DMDP11532 3685 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP12-2P59991 146 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP10-11P60412 298 aa2.86□□□□□ -1.95
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