RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442447.5

RBM39-215, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 644 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-215ENST00000442447 CD164Q04900 197 aa8.98□□□□□ -0.97
RBM39-215ENST00000442447 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.97□□□□□ -0.97
RBM39-215ENST00000442447 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.96□□□□□ -0.98
RBM39-215ENST00000442447 hADV29S1A0JD25 119 aa8.95□□□□□ -0.98
RBM39-215ENST00000442447 Q6ZQY7 126 aa8.95□□□□□ -0.98
RBM39-215ENST00000442447 XP32Q5T750 250 aa8.93□□□□□ -0.98
RBM39-215ENST00000442447 CEND1Q8N111 149 aa8.93□□□□□ -0.98
RBM39-215ENST00000442447 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.93□□□□□ -0.98
RBM39-215ENST00000442447 F8WEM9 126 aa8.92□□□□□ -0.98
RBM39-215ENST00000442447 CFC1BP0CG36 223 aa8.92□□□□□ -0.98
RBM39-215ENST00000442447 CFC1P0CG37 223 aa8.92□□□□□ -0.98
RBM39-215ENST00000442447 FXYD2P54710 66 aa8.92□□□□□ -0.98
RBM39-215ENST00000442447 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
RBM39-215ENST00000442447 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.92□□□□□ -0.98
RBM39-215ENST00000442447 Q5XG85 94 aa8.91□□□□□ -0.98
RBM39-215ENST00000442447 HSD52Q0P140 79 aa8.9□□□□□ -0.98
RBM39-215ENST00000442447 RAB37Q96AX2 223 aa8.9□□□□□ -0.98
RBM39-215ENST00000442447 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
RBM39-215ENST00000442447 C9orf92A6NGG3 77 aa8.88□□□□□ -0.99
RBM39-215ENST00000442447 A0A0B4J2C4 111 aa8.87□□□□□ -0.99
RBM39-215ENST00000442447 C1orf195Q5TG92 126 aa8.87□□□□□ -0.99
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.87□□□□□ -0.99
RBM39-215ENST00000442447 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
RBM39-215ENST00000442447 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.84□□□□□ -0.99
RBM39-215ENST00000442447 Q6JHZ5 121 aa8.84□□□□□ -0.99
RBM39-215ENST00000442447 IGFL1Q6UW32 110 aa8.84□□□□□ -0.99
RBM39-215ENST00000442447 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.83□□□□□ -1
RBM39-215ENST00000442447 TSTD3H0UI37 97 aa8.83□□□□□ -1
RBM39-215ENST00000442447 K7ERJ3 54 aa8.83□□□□□ -1
RBM39-215ENST00000442447 TCL1BO95988 128 aa8.83□□□□□ -1
RBM39-215ENST00000442447 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.83□□□□□ -1
RBM39-215ENST00000442447 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.83□□□□□ -1
RBM39-215ENST00000442447 CLEC2BQ92478 149 aa8.83□□□□□ -1
RBM39-215ENST00000442447 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.82□□□□□ -1
RBM39-215ENST00000442447 H0YGX0 51 aa8.81□□□□□ -1
RBM39-215ENST00000442447 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.81□□□□□ -1
RBM39-215ENST00000442447 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.8□□□□□ -1
RBM39-215ENST00000442447 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.79□□□□□ -1
RBM39-215ENST00000442447 H3BUT2 72 aa8.79□□□□□ -1
RBM39-215ENST00000442447 SNCGO76070 127 aa8.79□□□□□ -1
RBM39-215ENST00000442447 PCOTHQ58A44 107 aa8.77□□□□□ -1.01
RBM39-215ENST00000442447 M0R143 59 aa8.74□□□□□ -1.01
RBM39-215ENST00000442447 TRIAP1O43715 76 aa8.74□□□□□ -1.01
RBM39-215ENST00000442447 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
RBM39-215ENST00000442447 A0A1B0GX51 115 aa8.72□□□□□ -1.01
RBM39-215ENST00000442447 BATFQ16520 125 aa8.71□□□□□ -1.02
RBM39-215ENST00000442447 FABP2P12104 132 aa8.69□□□□□ -1.02
RBM39-215ENST00000442447 PSMB2P49721 201 aa8.69□□□□□ -1.02
RBM39-215ENST00000442447 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RBM39-215ENST00000442447 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RBM39-215ENST00000442447 H3BMG7 143 aa8.67□□□□□ -1.02
RBM39-215ENST00000442447 LST1O00453 97 aa8.67□□□□□ -1.02
RBM39-215ENST00000442447 GHRHP01286 108 aa8.67□□□□□ -1.02
RBM39-215ENST00000442447 Q6Q795 121 aa8.67□□□□□ -1.02
RBM39-215ENST00000442447 TEN1Q86WV5 123 aa8.66□□□□□ -1.02
RBM39-215ENST00000442447 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.65□□□□□ -1.02
RBM39-215ENST00000442447 DNAL4O96015 105 aa8.64□□□□□ -1.03
RBM39-215ENST00000442447 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.63□□□□□ -1.03
RBM39-215ENST00000442447 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.63□□□□□ -1.03
RBM39-215ENST00000442447 A0A087WSZ3 146 aa8.62□□□□□ -1.03
RBM39-215ENST00000442447 COX6CP09669 75 aa8.62□□□□□ -1.03
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.62□□□□□ -1.03
RBM39-215ENST00000442447 LCE2CQ5TA81 110 aa8.62□□□□□ -1.03
RBM39-215ENST00000442447 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.62□□□□□ -1.03
RBM39-215ENST00000442447 A0A1B0GV72 72 aa8.61□□□□□ -1.03
RBM39-215ENST00000442447 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.61□□□□□ -1.03
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.61□□□□□ -1.03
RBM39-215ENST00000442447 A0A1W2PNM2 257 aa8.59□□□□□ -1.03
RBM39-215ENST00000442447 H3BQ85 93 aa8.58□□□□□ -1.04
RBM39-215ENST00000442447 TAX1BP3O14907 124 aa8.57□□□□□ -1.04
RBM39-215ENST00000442447 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.57□□□□□ -1.04
RBM39-215ENST00000442447 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.56□□□□□ -1.04
RBM39-215ENST00000442447 Q75L30 129 aa8.56□□□□□ -1.04
RBM39-215ENST00000442447 Q96NJ1 140 aa8.56□□□□□ -1.04
RBM39-215ENST00000442447 TRACP01848 142 aa8.53□□□□□ -1.04
RBM39-215ENST00000442447 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.52□□□□□ -1.05
RBM39-215ENST00000442447 C9orf118A6NHY6 69 aa8.52□□□□□ -1.05
RBM39-215ENST00000442447 MT1HP80294 61 aa8.52□□□□□ -1.05
RBM39-215ENST00000442447 UBE2V1Q13404 147 aa8.52□□□□□ -1.05
RBM39-215ENST00000442447 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.52□□□□□ -1.05
RBM39-215ENST00000442447 SIGMAR1Q99720 223 aa8.51□□□□□ -1.05
RBM39-215ENST00000442447 CCKP06307 115 aa8.49□□□□□ -1.05
RBM39-215ENST00000442447 DSCR10P59022 87 aa8.48□□□□□ -1.05
RBM39-215ENST00000442447 ATXN8Q156A1 80 aa8.48□□□□□ -1.05
RBM39-215ENST00000442447 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.48□□□□□ -1.05
RBM39-215ENST00000442447 A0A1W2PPM0 123 aa8.47□□□□□ -1.05
RBM39-215ENST00000442447 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.47□□□□□ -1.05
RBM39-215ENST00000442447 IGKV4-1P06312 121 aa8.46□□□□□ -1.06
RBM39-215ENST00000442447 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.46□□□□□ -1.06
RBM39-215ENST00000442447 A8MUU9 505 aa8.45□□□□□ -1.06
RBM39-215ENST00000442447 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.45□□□□□ -1.06
RBM39-215ENST00000442447 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM39-215ENST00000442447 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RBM39-215ENST00000442447 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM39-215ENST00000442447 VPS25Q9BRG1 176 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM39-215ENST00000442447 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.42□□□□□ -1.06
RBM39-215ENST00000442447 DSCR8Q96T75 97 aa8.42□□□□□ -1.06
RBM39-215ENST00000442447 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.42□□□□□ -1.06
RBM39-215ENST00000442447 C9JAW5 83 aa8.4□□□□□ -1.06
RBM39-215ENST00000442447 LINC00313P59037 77 aa8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms