RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 ROMO1P60602 79 aa7.53□□□□□ -1.2
CCBE1-202ENST00000439986 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.52□□□□□ -1.21
CCBE1-202ENST00000439986 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CCBE1-202ENST00000439986 A0A087X002 238 aa7.51□□□□□ -1.21
CCBE1-202ENST00000439986 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF292O60281 2723 aa7.51□□□□□ -1.21
CCBE1-202ENST00000439986 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.49□□□□□ -1.21
CCBE1-202ENST00000439986 K7EIL1 84 aa7.49□□□□□ -1.21
CCBE1-202ENST00000439986 Q8N377 158 aa7.49□□□□□ -1.21
CCBE1-202ENST00000439986 USP24Q9UPU5 2620 aa7.48□□□□□ -1.21
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.47□□□□□ -1.21
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP10-3P60369 221 aa7.47□□□□□ -1.21
CCBE1-202ENST00000439986 Q8N1X5 172 aa7.47□□□□□ -1.21
CCBE1-202ENST00000439986 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.47□□□□□ -1.21
CCBE1-202ENST00000439986 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.46□□□□□ -1.21
CCBE1-202ENST00000439986 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.46□□□□□ -1.22
CCBE1-202ENST00000439986 Q6ZR54 194 aa7.44□□□□□ -1.22
CCBE1-202ENST00000439986 A0A1B0GVX0 72 aa7.44□□□□□ -1.22
CCBE1-202ENST00000439986 CASC10Q5T4H9 136 aa7.44□□□□□ -1.22
CCBE1-202ENST00000439986 AKAP13Q12802 2813 aa7.43□□□□□ -1.22
CCBE1-202ENST00000439986 ITPR3Q14573 2671 aa7.43□□□□□ -1.22
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF861PO60384 105 aa7.42□□□□□ -1.22
CCBE1-202ENST00000439986 A0A087WTM6 91 aa7.42□□□□□ -1.22
CCBE1-202ENST00000439986 A0A1W2PNM2 257 aa7.41□□□□□ -1.22
CCBE1-202ENST00000439986 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.41□□□□□ -1.22
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CCBE1-202ENST00000439986 ATRQ13535 2644 aa7.4□□□□□ -1.22
CCBE1-202ENST00000439986 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.39□□□□□ -1.23
CCBE1-202ENST00000439986 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCBE1-202ENST00000439986 CHD6Q8TD26 2715 aa7.38□□□□□ -1.23
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CCBE1-202ENST00000439986 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.37□□□□□ -1.23
CCBE1-202ENST00000439986 Q8NDZ9 215 aa7.37□□□□□ -1.23
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CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.35□□□□□ -1.23
CCBE1-202ENST00000439986 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCBE1-202ENST00000439986 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa7.33□□□□□ -1.24
CCBE1-202ENST00000439986 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa7.33□□□□□ -1.24
CCBE1-202ENST00000439986 CFAP46Q8IYW2 2715 aa7.31□□□□□ -1.24
CCBE1-202ENST00000439986 M0R2T5 61 aa7.29□□□□□ -1.24
CCBE1-202ENST00000439986 SPRR4Q96PI1 79 aa7.29□□□□□ -1.24
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.29□□□□□ -1.24
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.27□□□□□ -1.25
CCBE1-202ENST00000439986 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.25□□□□□ -1.25
CCBE1-202ENST00000439986 Q6ZSA8 131 aa7.25□□□□□ -1.25
CCBE1-202ENST00000439986 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.25□□□□□ -1.25
CCBE1-202ENST00000439986 CR1P17927 2039 aa7.25□□□□□ -1.25
CCBE1-202ENST00000439986 MAST4O15021 2626 aa7.25□□□□□ -1.25
CCBE1-202ENST00000439986 A0A1B0GU33 70 aa7.23□□□□□ -1.25
CCBE1-202ENST00000439986 COL6A3P12111 3177 aa7.23□□□□□ -1.25
CCBE1-202ENST00000439986 ATMQ13315 3056 aa7.22□□□□□ -1.25
CCBE1-202ENST00000439986 TACC2O95359 2948 aa7.21□□□□□ -1.25
CCBE1-202ENST00000439986 LRBAP50851 2863 aa7.2□□□□□ -1.26
CCBE1-202ENST00000439986 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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CCBE1-202ENST00000439986 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.15□□□□□ -1.27
CCBE1-202ENST00000439986 MYO15AQ9UKN7 3530 aa7.14□□□□□ -1.27
CCBE1-202ENST00000439986 EYSQ5T1H1 3165 aa7.14□□□□□ -1.27
CCBE1-202ENST00000439986 SPRR1AP35321 89 aa7.13□□□□□ -1.27
CCBE1-202ENST00000439986 A8MUU9 505 aa7.13□□□□□ -1.27
CCBE1-202ENST00000439986 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa7.12□□□□□ -1.27
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CCBE1-202ENST00000439986 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.11□□□□□ -1.27
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CCBE1-202ENST00000439986 ITPR1Q14643 2758 aa7.11□□□□□ -1.27
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CCBE1-202ENST00000439986 COL12A1Q99715 3063 aa7.1□□□□□ -1.27
CCBE1-202ENST00000439986 S4R3F8 94 aa7.1□□□□□ -1.27
CCBE1-202ENST00000439986 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa7.1□□□□□ -1.27
CCBE1-202ENST00000439986 USP34Q70CQ2 3546 aa7.09□□□□□ -1.27
CCBE1-202ENST00000439986 PP632Q6XCG6 107 aa7.09□□□□□ -1.27
CCBE1-202ENST00000439986 NOTCH1P46531 2555 aa7.08□□□□□ -1.28
CCBE1-202ENST00000439986 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.07□□□□□ -1.28
CCBE1-202ENST00000439986 PLAC4Q8WY50 150 aa7.06□□□□□ -1.28
CCBE1-202ENST00000439986 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.05□□□□□ -1.28
CCBE1-202ENST00000439986 ZZEF1O43149 2961 aa7.05□□□□□ -1.28
CCBE1-202ENST00000439986 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CCBE1-202ENST00000439986 LOC400499M0QZD8 3231 aa7.03□□□□□ -1.28
CCBE1-202ENST00000439986 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CCBE1-202ENST00000439986 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.01□□□□□ -1.29
CCBE1-202ENST00000439986 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7□□□□□ -1.29
CCBE1-202ENST00000439986 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCBE1-202ENST00000439986 COL6A5A8TX70 2615 aa6.99□□□□□ -1.29
CCBE1-202ENST00000439986 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCBE1-202ENST00000439986 SPRR1BP22528 89 aa6.97□□□□□ -1.29
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CCBE1-202ENST00000439986 R4GN34 69 aa6.97□□□□□ -1.29
CCBE1-202ENST00000439986 STAB1Q9NY15 2570 aa6.96□□□□□ -1.29
CCBE1-202ENST00000439986 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.96□□□□□ -1.3
CCBE1-202ENST00000439986 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.96□□□□□ -1.3
CCBE1-202ENST00000439986 ZANQ9Y493 2812 aa6.93□□□□□ -1.3
CCBE1-202ENST00000439986 Q5W150 140 aa6.93□□□□□ -1.3
CCBE1-202ENST00000439986 Q5VSD8 79 aa6.93□□□□□ -1.3
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