RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 LINC01554Q52M75 96 aa4.25□□□□□ -1.73
ALMS1-201ENST00000423048 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.25□□□□□ -1.73
ALMS1-201ENST00000423048 Q6ZSA8 131 aa4.25□□□□□ -1.73
ALMS1-201ENST00000423048 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
ALMS1-201ENST00000423048 S4R3F8 94 aa4.25□□□□□ -1.73
ALMS1-201ENST00000423048 LUZP6Q538Z0 58 aa4.23□□□□□ -1.73
ALMS1-201ENST00000423048 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
ALMS1-201ENST00000423048 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.21□□□□□ -1.74
ALMS1-201ENST00000423048 M0QZ58 72 aa4.2□□□□□ -1.74
ALMS1-201ENST00000423048 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
ALMS1-201ENST00000423048 ROMO1P60602 79 aa4.2□□□□□ -1.74
ALMS1-201ENST00000423048 CFAP46Q8IYW2 2715 aa4.19□□□□□ -1.74
ALMS1-201ENST00000423048 SPINK7P58062 85 aa4.18□□□□□ -1.74
ALMS1-201ENST00000423048 ACANP16112 2415 aa4.17□□□□□ -1.74
ALMS1-201ENST00000423048 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
ALMS1-201ENST00000423048 STAB1Q9NY15 2570 aa4.15□□□□□ -1.75
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.14□□□□□ -1.75
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF292O60281 2723 aa4.14□□□□□ -1.75
ALMS1-201ENST00000423048 C9orf92A6NGG3 77 aa4.13□□□□□ -1.75
ALMS1-201ENST00000423048 Q8N1X5 172 aa4.13□□□□□ -1.75
ALMS1-201ENST00000423048 A0A0A0MQY5 61 aa4.13□□□□□ -1.75
ALMS1-201ENST00000423048 A8MUU9 505 aa4.12□□□□□ -1.75
ALMS1-201ENST00000423048 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.12□□□□□ -1.75
ALMS1-201ENST00000423048 A6NN06 94 aa4.12□□□□□ -1.75
ALMS1-201ENST00000423048 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.11□□□□□ -1.75
ALMS1-201ENST00000423048 PANO1I0J062 215 aa4.1□□□□□ -1.75
ALMS1-201ENST00000423048 MGAM2Q2M2H8 2515 aa4.1□□□□□ -1.75
ALMS1-201ENST00000423048 PP632Q6XCG6 107 aa4.09□□□□□ -1.75
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ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP10-1P60331 282 aa4.08□□□□□ -1.76
ALMS1-201ENST00000423048 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa4.07□□□□□ -1.76
ALMS1-201ENST00000423048 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.07□□□□□ -1.76
ALMS1-201ENST00000423048 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
ALMS1-201ENST00000423048 R4GN34 69 aa4.05□□□□□ -1.76
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.05□□□□□ -1.76
ALMS1-201ENST00000423048 Q5VSD8 79 aa4.03□□□□□ -1.76
ALMS1-201ENST00000423048 COL6A5A8TX70 2615 aa4.02□□□□□ -1.77
ALMS1-201ENST00000423048 IGSF10Q6WRI0 2623 aa4.02□□□□□ -1.77
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.02□□□□□ -1.77
ALMS1-201ENST00000423048 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ALMS1-201ENST00000423048 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP10-2P60368 255 aa3.98□□□□□ -1.77
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.97□□□□□ -1.77
ALMS1-201ENST00000423048 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
ALMS1-201ENST00000423048 A0A0D9SG42 100 aa3.97□□□□□ -1.77
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ALMS1-201ENST00000423048 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ALMS1-201ENST00000423048 FLNCQ14315 2725 aa3.94□□□□□ -1.78
ALMS1-201ENST00000423048 TPRXLQ17RH7 258 aa3.93□□□□□ -1.78
ALMS1-201ENST00000423048 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.91□□□□□ -1.78
ALMS1-201ENST00000423048 FBN3Q75N90 2809 aa3.91□□□□□ -1.78
ALMS1-201ENST00000423048 H0YAA0 97 aa3.9□□□□□ -1.78
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.9□□□□□ -1.79
ALMS1-201ENST00000423048 TENM4Q6N022 2769 aa3.89□□□□□ -1.79
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.89□□□□□ -1.79
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.89□□□□□ -1.79
ALMS1-201ENST00000423048 TNP1P09430 55 aa3.88□□□□□ -1.79
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.87□□□□□ -1.79
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ALMS1-201ENST00000423048 A0A0C4DFX4 3053 aa3.85□□□□□ -1.79
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ALMS1-201ENST00000423048 XP32Q5T750 250 aa3.82□□□□□ -1.8
ALMS1-201ENST00000423048 H3BS24 57 aa3.81□□□□□ -1.8
ALMS1-201ENST00000423048 M0R2T5 61 aa3.81□□□□□ -1.8
ALMS1-201ENST00000423048 HIVEP1P15822 2718 aa3.79□□□□□ -1.8
ALMS1-201ENST00000423048 CENPEQ02224 2701 aa3.75□□□□□ -1.81
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP10-8P60410 259 aa3.74□□□□□ -1.81
ALMS1-201ENST00000423048 UTRNP46939 3433 aa3.72□□□□□ -1.81
ALMS1-201ENST00000423048 DSPP15924 2871 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
ALMS1-201ENST00000423048 A0A1B0GVY2 172 aa3.71□□□□□ -1.82
ALMS1-201ENST00000423048 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
ALMS1-201ENST00000423048 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.7□□□□□ -1.82
ALMS1-201ENST00000423048 REV3LO60673 3130 aa3.69□□□□□ -1.82
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.69□□□□□ -1.82
ALMS1-201ENST00000423048 P0C880 135 aa3.69□□□□□ -1.82
ALMS1-201ENST00000423048 ITPR2Q14571 2701 aa3.69□□□□□ -1.82
ALMS1-201ENST00000423048 STAB2Q8WWQ8 2551 aa3.67□□□□□ -1.82
ALMS1-201ENST00000423048 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa3.66□□□□□ -1.82
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ALMS1-201ENST00000423048 A8MU10 97 aa3.65□□□□□ -1.82
ALMS1-201ENST00000423048 ITPR1Q14643 2758 aa3.64□□□□□ -1.83
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ALMS1-201ENST00000423048 CHD9Q3L8U1 2897 aa3.61□□□□□ -1.83
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ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.6□□□□□ -1.83
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ALMS1-201ENST00000423048 CFAP54Q96N23 3096 aa3.57□□□□□ -1.84
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ALMS1-201ENST00000423048 AKAP13Q12802 2813 aa3.56□□□□□ -1.84
ALMS1-201ENST00000423048 CENPFP49454 3210 aa3.56□□□□□ -1.84
ALMS1-201ENST00000423048 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ALMS1-201ENST00000423048 COL6A3P12111 3177 aa3.55□□□□□ -1.84
ALMS1-201ENST00000423048 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ALMS1-201ENST00000423048 NDUFAF8A1L188 74 aa3.54□□□□□ -1.84
ALMS1-201ENST00000423048 KALRNO60229 2985 aa3.53□□□□□ -1.84
ALMS1-201ENST00000423048 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
ALMS1-201ENST00000423048 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.49□□□□□ -1.85
ALMS1-201ENST00000423048 DNAH12Q6ZR08 3092 aa3.48□□□□□ -1.85
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.48□□□□□ -1.85
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