RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403258.1

ACTBP8-201, Transcript of actin, beta pseudogene 8, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP8, Length 1,108 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP8-201ENST00000403258 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
ACTBP8-201ENST00000403258 GHRHP01286 108 aa8.82□□□□□ -1
ACTBP8-201ENST00000403258 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.82□□□□□ -1
ACTBP8-201ENST00000403258 CLEC2BQ92478 149 aa8.82□□□□□ -1
ACTBP8-201ENST00000403258 F8WEM9 126 aa8.8□□□□□ -1
ACTBP8-201ENST00000403258 SPINK1P00995 79 aa8.8□□□□□ -1
ACTBP8-201ENST00000403258 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
ACTBP8-201ENST00000403258 BATFQ16520 125 aa8.8□□□□□ -1
ACTBP8-201ENST00000403258 DNAL4O96015 105 aa8.79□□□□□ -1
ACTBP8-201ENST00000403258 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.78□□□□□ -1
ACTBP8-201ENST00000403258 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTBP8-201ENST00000403258 LST1O00453 97 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTBP8-201ENST00000403258 TRACP01848 142 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTBP8-201ENST00000403258 H3BQ85 93 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTBP8-201ENST00000403258 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTBP8-201ENST00000403258 CD164Q04900 197 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTBP8-201ENST00000403258 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTBP8-201ENST00000403258 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTBP8-201ENST00000403258 Q6JHZ5 121 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTBP8-201ENST00000403258 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTBP8-201ENST00000403258 HERC1Q15751 4861 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP8-201ENST00000403258 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTBP8-201ENST00000403258 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTBP8-201ENST00000403258 TAX1BP3O14907 124 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTBP8-201ENST00000403258 ATXN8Q156A1 80 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTBP8-201ENST00000403258 C9orf118A6NHY6 69 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTBP8-201ENST00000403258 H3BUT2 72 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTBP8-201ENST00000403258 TCL1BO95988 128 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTBP8-201ENST00000403258 FABP2P12104 132 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTBP8-201ENST00000403258 LIMD2Q9BT23 127 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTBP8-201ENST00000403258 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTBP8-201ENST00000403258 IGFL1Q6UW32 110 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTBP8-201ENST00000403258 PRR4Q16378 134 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTBP8-201ENST00000403258 UBE2V1Q13404 147 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTBP8-201ENST00000403258 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTBP8-201ENST00000403258 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTBP8-201ENST00000403258 A0A0G2JQZ4 141 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTBP8-201ENST00000403258 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTBP8-201ENST00000403258 Q5XG85 94 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTBP8-201ENST00000403258 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ACTBP8-201ENST00000403258 A0A1W2PPM0 123 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP8-201ENST00000403258 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP8-201ENST00000403258 H3BMG7 143 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP8-201ENST00000403258 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTBP8-201ENST00000403258 Q6Q795 121 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTBP8-201ENST00000403258 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTBP8-201ENST00000403258 TEN1Q86WV5 123 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTBP8-201ENST00000403258 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTBP8-201ENST00000403258 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTBP8-201ENST00000403258 TPRXLQ17RH7 258 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTBP8-201ENST00000403258 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTBP8-201ENST00000403258 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTBP8-201ENST00000403258 C9JAW5 83 aa8.56□□□□□ -1.04
ACTBP8-201ENST00000403258 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ACTBP8-201ENST00000403258 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTBP8-201ENST00000403258 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTBP8-201ENST00000403258 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTBP8-201ENST00000403258 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTBP8-201ENST00000403258 A0A1B0GV72 72 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTBP8-201ENST00000403258 H3BT86 120 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTBP8-201ENST00000403258 A0A1W2PNM2 257 aa8.53□□□□□ -1.04
ACTBP8-201ENST00000403258 C1orf195Q5TG92 126 aa8.53□□□□□ -1.04
ACTBP8-201ENST00000403258 DSCR8Q96T75 97 aa8.53□□□□□ -1.04
ACTBP8-201ENST00000403258 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTBP8-201ENST00000403258 A0A087WSZ3 146 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTBP8-201ENST00000403258 CCKP06307 115 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTBP8-201ENST00000403258 K7EP34 96 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP8-201ENST00000403258 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP8-201ENST00000403258 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP8-201ENST00000403258 PDE6GP18545 87 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP8-201ENST00000403258 CDIP1Q9H305 208 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP8-201ENST00000403258 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTBP8-201ENST00000403258 MTURNQ8N3F0 131 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTBP8-201ENST00000403258 Q6ZQT0 140 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTBP8-201ENST00000403258 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.44□□□□□ -1.06
ACTBP8-201ENST00000403258 VPS25Q9BRG1 176 aa8.44□□□□□ -1.06
ACTBP8-201ENST00000403258 A0A1B0GW54 56 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTBP8-201ENST00000403258 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTBP8-201ENST00000403258 Q96NJ1 140 aa8.42□□□□□ -1.06
ACTBP8-201ENST00000403258 LPAP08519 4548 aa8.42□□□□□ -1.06
ACTBP8-201ENST00000403258 PRO0461Q9UI25 63 aa8.41□□□□□ -1.06
ACTBP8-201ENST00000403258 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ACTBP8-201ENST00000403258 LRP2P98164 4655 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTBP8-201ENST00000403258 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTBP8-201ENST00000403258 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTBP8-201ENST00000403258 XP32Q5T750 250 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTBP8-201ENST00000403258 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTBP8-201ENST00000403258 C9orf92A6NGG3 77 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTBP8-201ENST00000403258 F8W1H4 67 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTBP8-201ENST00000403258 IGKV4-1P06312 121 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTBP8-201ENST00000403258 SIGMAR1Q99720 223 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTBP8-201ENST00000403258 J3KT08 172 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTBP8-201ENST00000403258 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTBP8-201ENST00000403258 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
ACTBP8-201ENST00000403258 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTBP8-201ENST00000403258 NREPQ16612 68 aa8.25□□□□□ -1.09
ACTBP8-201ENST00000403258 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
ACTBP8-201ENST00000403258 ETDBQ3ZM63 59 aa8.24□□□□□ -1.09
ACTBP8-201ENST00000403258 A0A1B0GVX0 72 aa8.22□□□□□ -1.09
ACTBP8-201ENST00000403258 A0A1B0GV90 55 aa8.21□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms