RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399892.6

SEH1L-202, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEH1L, Length 1,846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-202ENST00000399892 Q8NBF4 154 aa10.35□□□□□ -0.75
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SEH1L-202ENST00000399892 OCIAD2Q56VL3 154 aa10.34□□□□□ -0.75
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SEH1L-202ENST00000399892 SPAG11AQ6PDA7 123 aa10.31□□□□□ -0.76
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SEH1L-202ENST00000399892 HMCN2Q8NDA2 5059 aa10.07□□□□□ -0.8
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SEH1L-202ENST00000399892 Q5XG85 94 aa10.02□□□□□ -0.81
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SEH1L-202ENST00000399892 K7EP34 96 aa9.96□□□□□ -0.81
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SEH1L-202ENST00000399892 C1orf195Q5TG92 126 aa9.94□□□□□ -0.82
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SEH1L-202ENST00000399892 CDIP1Q9H305 208 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-202ENST00000399892 LPAP08519 4548 aa9.9□□□□□ -0.82
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SEH1L-202ENST00000399892 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa9.85□□□□□ -0.83
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SEH1L-202ENST00000399892 ETDBQ3ZM63 59 aa9.72□□□□□ -0.85
SEH1L-202ENST00000399892 XP32Q5T750 250 aa9.72□□□□□ -0.85
SEH1L-202ENST00000399892 A0A1B0GV90 55 aa9.71□□□□□ -0.85
SEH1L-202ENST00000399892 NREPQ16612 68 aa9.71□□□□□ -0.85
SEH1L-202ENST00000399892 J3KT08 172 aa9.69□□□□□ -0.86
SEH1L-202ENST00000399892 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SEH1L-202ENST00000399892 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa9.63□□□□□ -0.87
SEH1L-202ENST00000399892 NDUFB1O75438 58 aa9.63□□□□□ -0.87
SEH1L-202ENST00000399892 DSCR10P59022 87 aa9.62□□□□□ -0.87
SEH1L-202ENST00000399892 LINC00313P59037 77 aa9.62□□□□□ -0.87
SEH1L-202ENST00000399892 A0A1B0GVX0 72 aa9.6□□□□□ -0.87
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