RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399892.6

SEH1L-202, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEH1L, Length 1,846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-202ENST00000399892 Q8NBF4 154 aa10.35□□□□□ -0.75
SEH1L-202ENST00000399892 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa10.35□□□□□ -0.75
SEH1L-202ENST00000399892 OCIAD2Q56VL3 154 aa10.34□□□□□ -0.75
SEH1L-202ENST00000399892 F8WEM9 126 aa10.33□□□□□ -0.76
SEH1L-202ENST00000399892 GHRHP01286 108 aa10.33□□□□□ -0.76
SEH1L-202ENST00000399892 PPDPFLQ8WWR9 84 aa10.32□□□□□ -0.76
SEH1L-202ENST00000399892 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
SEH1L-202ENST00000399892 SNHG12Q9BXW3 62 aa10.32□□□□□ -0.76
SEH1L-202ENST00000399892 SPAG11AQ6PDA7 123 aa10.31□□□□□ -0.76
SEH1L-202ENST00000399892 SMIM29Q86T20 159 aa10.31□□□□□ -0.76
SEH1L-202ENST00000399892 PCP4L1A6NKN8 68 aa10.3□□□□□ -0.76
SEH1L-202ENST00000399892 LYRM7Q5U5X0 104 aa10.28□□□□□ -0.76
SEH1L-202ENST00000399892 FABP2P12104 132 aa10.26□□□□□ -0.77
SEH1L-202ENST00000399892 ORMDL1Q9P0S3 153 aa10.26□□□□□ -0.77
SEH1L-202ENST00000399892 H3BUT2 72 aa10.26□□□□□ -0.77
SEH1L-202ENST00000399892 LST1O00453 97 aa10.26□□□□□ -0.77
SEH1L-202ENST00000399892 SPINK1P00995 79 aa10.25□□□□□ -0.77
SEH1L-202ENST00000399892 TRACP01848 142 aa10.25□□□□□ -0.77
SEH1L-202ENST00000399892 H3BQ85 93 aa10.23□□□□□ -0.77
SEH1L-202ENST00000399892 C9orf118A6NHY6 69 aa10.23□□□□□ -0.77
SEH1L-202ENST00000399892 ATXN8Q156A1 80 aa10.23□□□□□ -0.77
SEH1L-202ENST00000399892 HRCT1Q6UXD1 115 aa10.22□□□□□ -0.77
SEH1L-202ENST00000399892 TAX1BP3O14907 124 aa10.21□□□□□ -0.77
SEH1L-202ENST00000399892 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa10.21□□□□□ -0.78
SEH1L-202ENST00000399892 TCL1BO95988 128 aa10.21□□□□□ -0.78
SEH1L-202ENST00000399892 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
SEH1L-202ENST00000399892 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa10.21□□□□□ -0.78
SEH1L-202ENST00000399892 Q6JHZ5 121 aa10.19□□□□□ -0.78
SEH1L-202ENST00000399892 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa10.19□□□□□ -0.78
SEH1L-202ENST00000399892 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa10.17□□□□□ -0.78
SEH1L-202ENST00000399892 A0A0G2JQZ4 141 aa10.17□□□□□ -0.78
SEH1L-202ENST00000399892 A0A1W2PPM0 123 aa10.17□□□□□ -0.78
SEH1L-202ENST00000399892 H3BMG7 143 aa10.17□□□□□ -0.78
SEH1L-202ENST00000399892 RPS29P62273 56 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
SEH1L-202ENST00000399892 PRR4Q16378 134 aa10.17□□□□□ -0.78
SEH1L-202ENST00000399892 CD164Q04900 197 aa10.16□□□□□ -0.78
SEH1L-202ENST00000399892 RETNLBQ9BQ08 111 aa10.16□□□□□ -0.78
SEH1L-202ENST00000399892 IGFL1Q6UW32 110 aa10.14□□□□□ -0.79
SEH1L-202ENST00000399892 LIMD2Q9BT23 127 aa10.14□□□□□ -0.79
SEH1L-202ENST00000399892 BAALC-AS2P0C853 105 aa10.14□□□□□ -0.79
SEH1L-202ENST00000399892 A0A1B0GV72 72 aa10.13□□□□□ -0.79
SEH1L-202ENST00000399892 UBE2V1Q13404 147 aa10.13□□□□□ -0.79
SEH1L-202ENST00000399892 ANKRD29Q8N6D5 301 aa10.1□□□□□ -0.79
SEH1L-202ENST00000399892 C9JAW5 83 aa10.1□□□□□ -0.79
SEH1L-202ENST00000399892 SPCS1Q9Y6A9 102 aa10.07□□□□□ -0.8
SEH1L-202ENST00000399892 HMCN2Q8NDA2 5059 aa10.07□□□□□ -0.8
SEH1L-202ENST00000399892 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa10.05□□□□□ -0.8
SEH1L-202ENST00000399892 RBM3P98179 157 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
SEH1L-202ENST00000399892 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
SEH1L-202ENST00000399892 TEN1Q86WV5 123 aa10.04□□□□□ -0.8
SEH1L-202ENST00000399892 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa10.03□□□□□ -0.8
SEH1L-202ENST00000399892 DSCR8Q96T75 97 aa10.03□□□□□ -0.8
SEH1L-202ENST00000399892 Q5XG85 94 aa10.02□□□□□ -0.81
SEH1L-202ENST00000399892 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa10□□□□□ -0.81
SEH1L-202ENST00000399892 Q6Q795 121 aa10□□□□□ -0.81
SEH1L-202ENST00000399892 MTURNQ8N3F0 131 aa10□□□□□ -0.81
SEH1L-202ENST00000399892 H3BT86 120 aa9.99□□□□□ -0.81
SEH1L-202ENST00000399892 CCKP06307 115 aa9.99□□□□□ -0.81
SEH1L-202ENST00000399892 VPS25Q9BRG1 176 aa9.98□□□□□ -0.81
SEH1L-202ENST00000399892 SS18L2Q9UHA2 77 aa9.98□□□□□ -0.81
SEH1L-202ENST00000399892 A0A1W2PNM2 257 aa9.97□□□□□ -0.81
SEH1L-202ENST00000399892 A0A087WSZ3 146 aa9.96□□□□□ -0.81
SEH1L-202ENST00000399892 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa9.96□□□□□ -0.81
SEH1L-202ENST00000399892 K7EP34 96 aa9.96□□□□□ -0.81
SEH1L-202ENST00000399892 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa9.96□□□□□ -0.82
SEH1L-202ENST00000399892 C1orf195Q5TG92 126 aa9.94□□□□□ -0.82
SEH1L-202ENST00000399892 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.93□□□□□ -0.82
SEH1L-202ENST00000399892 TPRXLQ17RH7 258 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-202ENST00000399892 LRP2P98164 4655 aa9.92□□□□□ -0.82
SEH1L-202ENST00000399892 C14orf132Q9NPU4 83 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-202ENST00000399892 PDE6GP18545 87 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-202ENST00000399892 CDIP1Q9H305 208 aa9.91□□□□□ -0.82
SEH1L-202ENST00000399892 LPAP08519 4548 aa9.9□□□□□ -0.82
SEH1L-202ENST00000399892 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa9.89□□□□□ -0.83
SEH1L-202ENST00000399892 Q6ZQT0 140 aa9.88□□□□□ -0.83
SEH1L-202ENST00000399892 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa9.88□□□□□ -0.83
SEH1L-202ENST00000399892 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa9.86□□□□□ -0.83
SEH1L-202ENST00000399892 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa9.85□□□□□ -0.83
SEH1L-202ENST00000399892 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
SEH1L-202ENST00000399892 PRO0461Q9UI25 63 aa9.83□□□□□ -0.84
SEH1L-202ENST00000399892 F8W1H4 67 aa9.81□□□□□ -0.84
SEH1L-202ENST00000399892 A0A1B0GW54 56 aa9.8□□□□□ -0.84
SEH1L-202ENST00000399892 C9orf92A6NGG3 77 aa9.8□□□□□ -0.84
SEH1L-202ENST00000399892 SIGMAR1Q99720 223 aa9.78□□□□□ -0.84
SEH1L-202ENST00000399892 Q96NJ1 140 aa9.77□□□□□ -0.84
SEH1L-202ENST00000399892 IGKV4-1P06312 121 aa9.77□□□□□ -0.85
SEH1L-202ENST00000399892 DEFB116Q30KQ4 102 aa9.75□□□□□ -0.85
SEH1L-202ENST00000399892 UBR4Q5T4S7 5183 aa9.75□□□□□ -0.85
SEH1L-202ENST00000399892 LINC00472Q9H8W2 130 aa9.74□□□□□ -0.85
SEH1L-202ENST00000399892 ETDBQ3ZM63 59 aa9.72□□□□□ -0.85
SEH1L-202ENST00000399892 XP32Q5T750 250 aa9.72□□□□□ -0.85
SEH1L-202ENST00000399892 A0A1B0GV90 55 aa9.71□□□□□ -0.85
SEH1L-202ENST00000399892 NREPQ16612 68 aa9.71□□□□□ -0.85
SEH1L-202ENST00000399892 J3KT08 172 aa9.69□□□□□ -0.86
SEH1L-202ENST00000399892 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SEH1L-202ENST00000399892 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa9.63□□□□□ -0.87
SEH1L-202ENST00000399892 NDUFB1O75438 58 aa9.63□□□□□ -0.87
SEH1L-202ENST00000399892 DSCR10P59022 87 aa9.62□□□□□ -0.87
SEH1L-202ENST00000399892 LINC00313P59037 77 aa9.62□□□□□ -0.87
SEH1L-202ENST00000399892 A0A1B0GVX0 72 aa9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 140.6 ms