RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 ANAPC11Q9NYG5 84 aa10.31□□□□□ -0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 ATMQ13315 3056 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 IGLV7-43P04211 117 aa10.27□□□□□ -0.77
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa10.27□□□□□ -0.77
CTDSP2-201ENST00000398073 CD164Q04900 197 aa10.26□□□□□ -0.77
CTDSP2-201ENST00000398073 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa10.26□□□□□ -0.77
CTDSP2-201ENST00000398073 OXTP01178 125 aa10.25□□□□□ -0.77
CTDSP2-201ENST00000398073 FLNCQ14315 2725 aa10.25□□□□□ -0.77
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM229BQ4G0N7 80 aa10.25□□□□□ -0.77
CTDSP2-201ENST00000398073 NOTCH1P46531 2555 aa10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-201ENST00000398073 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-201ENST00000398073 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-201ENST00000398073 MIR22HGQ0VDD5 57 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-201ENST00000398073 LRBAP50851 2863 aa10.21□□□□□ -0.77
CTDSP2-201ENST00000398073 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
CTDSP2-201ENST00000398073 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CTDSP2-201ENST00000398073 SPEGQ15772 3267 aa10.19□□□□□ -0.78
CTDSP2-201ENST00000398073 COL6A3P12111 3177 aa10.19□□□□□ -0.78
CTDSP2-201ENST00000398073 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa10.18□□□□□ -0.78
CTDSP2-201ENST00000398073 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa10.18□□□□□ -0.78
CTDSP2-201ENST00000398073 SPRR1BP22528 89 aa10.18□□□□□ -0.78
CTDSP2-201ENST00000398073 TACC2O95359 2948 aa10.17□□□□□ -0.78
CTDSP2-201ENST00000398073 TNP2Q05952 138 aa10.16□□□□□ -0.78
CTDSP2-201ENST00000398073 PRR26Q8N8Z3 221 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-201ENST00000398073 ITPR1Q14643 2758 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-201ENST00000398073 COL6A5A8TX70 2615 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-201ENST00000398073 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
CTDSP2-201ENST00000398073 COL12A1Q99715 3063 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-201ENST00000398073 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-201ENST00000398073 LINC00472Q9H8W2 130 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-201ENST00000398073 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-201ENST00000398073 STAB1Q9NY15 2570 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-201ENST00000398073 LINC00304Q8N9R0 145 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-201ENST00000398073 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa10.12□□□□□ -0.79
CTDSP2-201ENST00000398073 Q75L30 129 aa10.12□□□□□ -0.79
CTDSP2-201ENST00000398073 LCA10Q71F78 164 aa10.1□□□□□ -0.79
CTDSP2-201ENST00000398073 REV3LO60673 3130 aa10.1□□□□□ -0.79
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CTDSP2-201ENST00000398073 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa10.06□□□□□ -0.8
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa10.03□□□□□ -0.8
CTDSP2-201ENST00000398073 Q5VV11 94 aa10.03□□□□□ -0.8
CTDSP2-201ENST00000398073 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa10.02□□□□□ -0.8
CTDSP2-201ENST00000398073 HRES1P13985 223 aa10.02□□□□□ -0.81
CTDSP2-201ENST00000398073 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CTDSP2-201ENST00000398073 PLAC8Q9NZF1 115 aa10□□□□□ -0.81
CTDSP2-201ENST00000398073 ZZEF1O43149 2961 aa9.99□□□□□ -0.81
CTDSP2-201ENST00000398073 C9orf92A6NGG3 77 aa9.98□□□□□ -0.81
CTDSP2-201ENST00000398073 Q8N1X5 172 aa9.98□□□□□ -0.81
CTDSP2-201ENST00000398073 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
CTDSP2-201ENST00000398073 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CTDSP2-201ENST00000398073 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CTDSP2-201ENST00000398073 EYSQ5T1H1 3165 aa9.95□□□□□ -0.82
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CTDSP2-201ENST00000398073 ZANQ9Y493 2812 aa9.92□□□□□ -0.82
CTDSP2-201ENST00000398073 LOC400499M0QZD8 3231 aa9.91□□□□□ -0.82
CTDSP2-201ENST00000398073 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CTDSP2-201ENST00000398073 BAHCC1Q9P281 2608 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDSP2-201ENST00000398073 ITPR2Q14571 2701 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDSP2-201ENST00000398073 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CTDSP2-201ENST00000398073 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDSP2-201ENST00000398073 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CTDSP2-201ENST00000398073 Q5W150 140 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDSP2-201ENST00000398073 SPINT4Q6UDR6 99 aa9.86□□□□□ -0.83
CTDSP2-201ENST00000398073 DMXL1Q9Y485 3027 aa9.86□□□□□ -0.83
CTDSP2-201ENST00000398073 LINC00483Q53H64 154 aa9.84□□□□□ -0.83
CTDSP2-201ENST00000398073 USP34Q70CQ2 3546 aa9.84□□□□□ -0.83
CTDSP2-201ENST00000398073 Q6ZR54 194 aa9.83□□□□□ -0.84
CTDSP2-201ENST00000398073 LCE6AA0A183 80 aa9.83□□□□□ -0.84
CTDSP2-201ENST00000398073 SPINK7P58062 85 aa9.83□□□□□ -0.84
CTDSP2-201ENST00000398073 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CTDSP2-201ENST00000398073 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.81□□□□□ -0.845e-6■■■□□ 16.7
CTDSP2-201ENST00000398073 STAB2Q8WWQ8 2551 aa9.8□□□□□ -0.84
CTDSP2-201ENST00000398073 APCP25054 2843 aa9.78□□□□□ -0.84
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.78□□□□□ -0.84
CTDSP2-201ENST00000398073 CRIPTQ9P021 101 aa9.78□□□□□ -0.84
CTDSP2-201ENST00000398073 PANO1I0J062 215 aa9.77□□□□□ -0.84
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A1B0GU33 70 aa9.76□□□□□ -0.85
CTDSP2-201ENST00000398073 CELSR2Q9HCU4 2923 aa9.76□□□□□ -0.85
CTDSP2-201ENST00000398073 MYO15AQ9UKN7 3530 aa9.76□□□□□ -0.85
CTDSP2-201ENST00000398073 DMAC1Q96GE9 116 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDSP2-201ENST00000398073 HIVEP1P15822 2718 aa9.7□□□□□ -0.86
CTDSP2-201ENST00000398073 PRAC1Q96KF2 57 aa9.69□□□□□ -0.86
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.69□□□□□ -0.86
CTDSP2-201ENST00000398073 LINC01554Q52M75 96 aa9.69□□□□□ -0.86
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A0D9SG42 100 aa9.68□□□□□ -0.86
CTDSP2-201ENST00000398073 NF1P21359 2839 aa9.66□□□□□ -0.86
CTDSP2-201ENST00000398073 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CTDSP2-201ENST00000398073 FBN2P35556 2912 aa9.65□□□□□ -0.86
CTDSP2-201ENST00000398073 DCHS2Q6V1P9 2916 aa9.62□□□□□ -0.87
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A087X002 238 aa9.61□□□□□ -0.87
CTDSP2-201ENST00000398073 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.61□□□□□ -0.87
CTDSP2-201ENST00000398073 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP10-2P60368 255 aa9.56□□□□□ -0.88
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.56□□□□□ -0.88
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP10-1P60331 282 aa9.56□□□□□ -0.88
CTDSP2-201ENST00000398073 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CTDSP2-201ENST00000398073 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.2 ms