RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
TMOD1-203ENST00000395211 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
TMOD1-203ENST00000395211 DEFB135Q30KP9 77 aa6.06□□□□□ -1.44
TMOD1-203ENST00000395211 CSAG1Q6PB30 78 aa6.06□□□□□ -1.44
TMOD1-203ENST00000395211 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
TMOD1-203ENST00000395211 LELP1Q5T871 98 aa6.05□□□□□ -1.44
TMOD1-203ENST00000395211 HRES1P13985 223 aa6.05□□□□□ -1.44
TMOD1-203ENST00000395211 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.05□□□□□ -1.44
TMOD1-203ENST00000395211 TENM4Q6N022 2769 aa6.05□□□□□ -1.44
TMOD1-203ENST00000395211 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TMOD1-203ENST00000395211 PRR34Q9NV39 138 aa6.04□□□□□ -1.44
TMOD1-203ENST00000395211 X6R8D5 127 aa6.03□□□□□ -1.44
TMOD1-203ENST00000395211 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.03□□□□□ -1.44
TMOD1-203ENST00000395211 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.02□□□□□ -1.45
TMOD1-203ENST00000395211 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.02□□□□□ -1.45
TMOD1-203ENST00000395211 C15orf56Q8N910 161 aa6.02□□□□□ -1.45
TMOD1-203ENST00000395211 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.01□□□□□ -1.45
TMOD1-203ENST00000395211 PRLHP81277 87 aa6□□□□□ -1.45
TMOD1-203ENST00000395211 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
TMOD1-203ENST00000395211 A8MWP4 228 aa5.99□□□□□ -1.45
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TMOD1-203ENST00000395211 Q6ZR54 194 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD1-203ENST00000395211 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
TMOD1-203ENST00000395211 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD1-203ENST00000395211 ACANP16112 2415 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD1-203ENST00000395211 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TMOD1-203ENST00000395211 A0A1B0GU69 56 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD1-203ENST00000395211 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD1-203ENST00000395211 RTL8CO15255 209 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD1-203ENST00000395211 REG3GQ6UW15 175 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD1-203ENST00000395211 SPART-AS1P0CW21 52 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD1-203ENST00000395211 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD1-203ENST00000395211 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.92□□□□□ -1.46
TMOD1-203ENST00000395211 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.91□□□□□ -1.46
TMOD1-203ENST00000395211 SPRR1AP35321 89 aa5.91□□□□□ -1.46
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.91□□□□□ -1.46
TMOD1-203ENST00000395211 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.9□□□□□ -1.47
TMOD1-203ENST00000395211 K7EIL1 84 aa5.89□□□□□ -1.47
TMOD1-203ENST00000395211 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa5.89□□□□□ -1.47
TMOD1-203ENST00000395211 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.88□□□□□ -1.47
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.88□□□□□ -1.47
TMOD1-203ENST00000395211 FASNP49327 2511 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
TMOD1-203ENST00000395211 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
TMOD1-203ENST00000395211 UQCR11O14957 56 aa5.86□□□□□ -1.47
TMOD1-203ENST00000395211 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa5.86□□□□□ -1.47
TMOD1-203ENST00000395211 CDK2AP2O75956 126 aa5.86□□□□□ -1.47
TMOD1-203ENST00000395211 ACYP2P14621 99 aa5.86□□□□□ -1.47
TMOD1-203ENST00000395211 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.86□□□□□ -1.47
TMOD1-203ENST00000395211 PDZD2O15018 2839 aa5.85□□□□□ -1.47
TMOD1-203ENST00000395211 CASC10Q5T4H9 136 aa5.85□□□□□ -1.47
TMOD1-203ENST00000395211 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.85□□□□□ -1.47
TMOD1-203ENST00000395211 ITPR3Q14573 2671 aa5.85□□□□□ -1.47
TMOD1-203ENST00000395211 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.84□□□□□ -1.47
TMOD1-203ENST00000395211 VWFP04275 2813 aa5.84□□□□□ -1.47
TMOD1-203ENST00000395211 HIVEP1P15822 2718 aa5.84□□□□□ -1.47
TMOD1-203ENST00000395211 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
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TMOD1-203ENST00000395211 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.83□□□□□ -1.48
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TMOD1-203ENST00000395211 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD1-203ENST00000395211 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD1-203ENST00000395211 ROMO1P60602 79 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP10-9P60411 292 aa5.8□□□□□ -1.48
TMOD1-203ENST00000395211 TENM2Q9NT68 2774 aa5.8□□□□□ -1.48
TMOD1-203ENST00000395211 DEFB113Q30KQ7 82 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD1-203ENST00000395211 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TMOD1-203ENST00000395211 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD1-203ENST00000395211 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD1-203ENST00000395211 CRIPTQ9P021 101 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD1-203ENST00000395211 A0A087X002 238 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD1-203ENST00000395211 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD1-203ENST00000395211 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD1-203ENST00000395211 HECTD1Q9ULT8 2610 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF861PO60384 105 aa5.77□□□□□ -1.49
TMOD1-203ENST00000395211 Q5W150 140 aa5.76□□□□□ -1.49
TMOD1-203ENST00000395211 ITPR2Q14571 2701 aa5.75□□□□□ -1.49
TMOD1-203ENST00000395211 A0A1B0GVX0 72 aa5.75□□□□□ -1.49
TMOD1-203ENST00000395211 LINC01556Q5JQF7 62 aa5.75□□□□□ -1.49
TMOD1-203ENST00000395211 COL7A1Q02388 2944 aa5.74□□□□□ -1.49
TMOD1-203ENST00000395211 SPINK1P00995 79 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD1-203ENST00000395211 CHTF8P0CG12 524 aa5.72□□□□□ -1.49
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.72□□□□□ -1.49
TMOD1-203ENST00000395211 Q96NJ1 140 aa5.72□□□□□ -1.49
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD1-203ENST00000395211 DNAH10OSP0CZ25 163 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD1-203ENST00000395211 DMAC1Q96GE9 116 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD1-203ENST00000395211 ATRQ13535 2644 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD1-203ENST00000395211 INAFM1C9JVW0 142 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD1-203ENST00000395211 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP10-3P60369 221 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD1-203ENST00000395211 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD1-203ENST00000395211 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD1-203ENST00000395211 FAM229AH3BQW9 127 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD1-203ENST00000395211 NOTCH1P46531 2555 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD1-203ENST00000395211 P0C880 135 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD1-203ENST00000395211 TENM3Q9P273 2699 aa5.67□□□□□ -1.5
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